Geri Dön

Hidrofobin proteini üretici Cladosporium türlerinin moleküler karakterizasyonu

Molecular characterization of Cladosporium species producing hydrophobins

  1. Tez No: 528768
  2. Yazar: BÜŞRA ALBAYRAK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SERKAN ÖRTÜCÜ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erzurum Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 68

Özet

Hidrofobinler filamentöz funguslarda üretilen küçük moleküler ağırlığa sahip amfipatik proteinlerdir. Bu proteinler içerdikleri korunmuş sisteinler arasında oluşan disülfit bağları sayesinde oldukça kararlı bir yapıdadırlar ve bu yapılarından dolayı yüzey modifikasyonları, doku mühendisliği ve ilaç taşıma sistemleri gibi birçok farklı alanda kullanılma potansiyelleri vardır. Bu tez çalışmasında, kültür ortamında süperhidrofobik özellik gösteren fungus izolatlarının hidrofobisitesinden sorumlu olan hidrofobin proteinlerinin belirlenmesi, saflaştırılması ve hidrofobin üretici türlerinin moleküler karakterizasyonunun gerçekleştirilmesi ile yeni hidrofobin üretici türlerin ve yeni hidrofobin proteinlerinin literatüre kazandırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, topraktan izole edilmiş filamentöz fungus izolatları PDA'da bir hafta geliştirildikten sonra suyun değme açısı ölçümüyle yüzey hidrofobisiteleri belirlendi. Elde edilen değme açılarına göre derecelendirilip, en yüksek hidrofobisiteye sahip beş farklı fungus klasik yöntemlerle Cladosporium olarak tanılandı. Ardından bu izolatların sporları, hidrofobin eldesi için önerilen asetonitril-TFA ve %60'lık etanol çözeltileri içinde ekstrakte edildi. Son olarak, ITS ve D1D2 gen bölgelerine göre Cladosporium türlerinin moleküler karakterizasyonu gerçekleştirildi. Sonuç olarak, en yüksek değme açısına sahip A5 izolatı, C. macrocarpum olarak tanılandı ve yaklaşık 8kDa'luk hidrofobin proteinine sahip olduğu belirlendi.

Özet (Çeviri)

Hydrophobins are amphipathic proteins with small molecular weight produced in filamentous fungi. These proteins are highly stable due to the disulfide bonds formed between the protected cysteines they contain and have the potential to be used in many different fields such as surface modifications, tissue engineering, and drug transport systems. In this study, it was aimed to determine the hydrophobin proteins responsible for the hydrophobicity of the superhydrophobic fungus isolates in the culture medium and to carry out the molecular characterization of the hydrophobin producer species and to introduce new hydrophobin producing species and new hydrophobin proteins. For this purpose, isolates from soil were incubated for one week in PDA and surface hydrophobicity was determined by measuring the water contact angle. Five different fungi with the highest hydrophobicity were classified as Cladosporium by classical methods. The spores of these isolates were then extracted in acetonitrile-TFA and 60% ethanol solutions recommended for obtaining hydrophobins. Finally, molecular characterization of Cladosporium species was performed according to ITS and D1D2 gene regions. As a result, the A5 isolate with the highest contact angle was identified as C. macrocarpum and it was determined to have a hydrophobin protein of about 8kDa.

Benzer Tezler

  1. Hidrofobik protein DewA'nın Pichia pastoris ile rekombinant üretimi ve biyoteknolojik uygulamaları

    Recombinant production and biotechnological applications of the hydrophobic protein DewA by Pichia pastoris

    ALPGİRAY TURGUT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiErzurum Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERKAN ÖRTÜCÜ

  2. Production of electrospun nanofibers of biocompatible polymers and a study of streptavidin immobilization

    Elektro çekim yöntemi ile biyouyumlu polimerlerden nanolif üretimi ve streptavidin immobilizasyonu

    ECE POLAT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. A. SEZAİ SARAÇ

  3. Evaluation of pichia pastoris as a microbial cell factory for production of fungal antimicrobial proteins

    Fungal antimikrobiyal proteinlerin üretimi için bir mikrobiyal hücre fabrikasi olarak pichia pastoris'in değerlendirilmesi

    BUSEL ÖZCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜNSELİ BAYRAM AKÇAPINAR

  4. Spirulina platensis'den fikosiyanin proteinin ekstraksiyonu ve sulu çözelti ikili faz sistemi ile protein dağılımının incelenmesi

    Extraction of phycocyanin protein from Spirulina platensis and investigation of protein distribution by aqueous solution dual phase system

    HİLAL AKTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    KimyaKocaeli Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YONCA DUMAN

  5. Biomimetic approaches for the fabrication of hollow fiber nanofiltration membranes

    Biyomimetik yaklaşımlarla içi boşluklu nanofiltrasyon membran üretimi

    REYHAN ŞENGÜR TAŞDEMİR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL KOYUNCU