Geri Dön

Sakarya nehir kaynağı sedimentinden izole edilen prokaryotların 16s rrna dizilemesi ile moleküler tiplendirilmesi

Molecular systematic of prokaryotes isolated from Sakarya river-head sediment by 16s rrna gene sequencing

PDF İndir

  1. Tez No: 529684
  2. Yazar: UĞUR ÇİĞDEM
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ FADİME ÖZDEMİR KOÇAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 127

Özet

Yapılan çalışmada, Eskişehir ilinin Çifteler ilçesinde bulunan Sakarya Nehri'nin doğduğu bölgeden farklı derinliklere sahip 4 farklı lokaliteden alınan sediment örneklerinden prokaryotik mikroorganizma izolasyonu yapılmıştır. İzolatların 16S rRNA gen bölgelerine ait dizi verileri elde edilmiş ve filogenetik analizler ile moleküler tiplendirilmesi yapılmıştır. Sediment örnekleri, nehirden steril kavanozlar ile alınmış ve laboratuvar ortamında dilüsyon plaka yöntemi uygulanarak önceden hazırlanmış antibiyotik içerikli 5 farklı besiyeri ortamına inoküle edilmiştir. İzole edilen 22 organizmanın 16S rRNA gen bölgesinin PCR çalışmaları yapılmıştır. 16S rRNA gen bölgesi nükleotid dizi verilerine göre, izolatların Cellulomonas, Micromonospora, Saccharomonospora, Brevibacillus, Paenibacillus ve Microvirga cinslerine ait oldukları belirlenmiştir. Mega 7 paket programı ile 22 izolatın en yakın tip türleri ile filogenetik analizleri gerçekleştirilmiştir. BIOEDIT programı kullanılarak izolatların en yakın tip türleri ile yüzde benzerlik ve nükleotid farklılık tabloları oluşturulmuştur. İzolatlar arasından olası yeni türler belirlenmiştir. 16S rRNA gen bölgesi filogenetik analizlerine göre; S1S32 (Microvirga sp.), S2S24 (Cellulomonas sp.), S1I41 (Brevibacillus sp.), S1S22 (Paenibacillus sp.), S2S21 (Saccharomonospora sp.), S1S33 (Micromonospora sp.) ve S1G21 (Micromonospora sp.) yeni türler olarak literatüre kazandırılacakları düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, isolastion of prokaryotics mircoorganisms from sediment samples taken 4 different location with varied depths of Sakarya Riverhead located in Çifteler town of Eskişehir province was performed. Based on 16S rRNA gene region's nucleotide sequence analysis data of isolates was obtained and phylogenetic analyses was caried out for molecular typing. Sediment samples was collected from river by sterile jar. Sediment samples was applied Dilution plate technique and samples were inoculated on 5 different media including the antibiotics previously prepared. PCR studies of 16S rRNA gene region of 22 organisms isolated from 5 different media was completed. According to nucleotide sequence analysis data of 16S rRNA sequencing; isolates belonging to Cellulomonas, Micromonospora, Saccharomonospora, Brevibacillus, Paenibacillus and Microvirga genus were determined. Phylogenetic analyses with the closest type of 22 isolates were performed via the Mega 7 package program. Similarity percentage and nucleotide difference of isolates compared to the closest type strains were established by using BIOEDIT program. The probability of new species among the isolates were determined. According to phylogenetic analysis of 16S rRNA gene region; isolates S1S32 (Microvirga sp.), S2S24 (Cellulomonas sp.), S1I41 (Brevibacillus sp.), S1S22 (Paenibacillus sp.), S2S21 (Saccharomonospora sp.), S1S33 (Micromonospora sp.) and S1G21 (Micromonospora sp.) could be new species.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    840697

    Effect of different precursors and disinfection processes on the formation of nitrosamines

    Nitrosamin oluşumunda farklı öncü maddelerin ve dezenfeksiyon proseslerinin etkisi

    BURÇİN COŞKUN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELİF PEHLİVANOĞLU MANTAŞ

  2. Tez No

    439531

    Sakarya Havzası'nın yüksek çözünürlüklü hidrolojik modelinin yapılandırılması

    Structuring the high resolution hydrological model of Sakarya Basin

    SALİM YAYKIRAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALPASLAN EKDAL

  3. Tez No

    245341

    Sakarya havzasının hidroelektrik potansiyelinin analizi ve uygun görülen akarsular için HES projesi yapılması

    Sakarya basin analysis of the hydroelectric potential and HES project made for some streams which are suitable

    UĞUR KULAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Teknik EğitimSakarya Üniversitesi

    Yapı Eğitimi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM YÜKSEL

  4. Tez No

    582694

    Case study for calculating and reporting the uncertainty budget of 1 and 2 dimensional combined hydraulic model

    Bir örnek olay çerçevesinde incelenmiş 1 ve 2 boyutlu birleştirilmiş hidrolik modelin belirsizlik bütçesinin hesaplanması ve raporlanması

    UĞRAŞ SİDAR GÜL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    İnşaat MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE BURCU ALTAN SAKARYA

  5. Tez No

    797561

    Ankara ili Polatlı ilçesinde faaliyet gösteren sulama kooperatiflerinde su kullanımının değerlendirilmesi

    Evaluation of water use in irrigation cooperatives operating in Ankara Polatlı district

    İBRAHİM ATALAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Tarımsal Yapılar ve Sulama Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ÖZTÜRK

Geri Dön