Geri Dön

İnsuyu mağarasının bakteriyel biyoçeşitliliğinin, enzimatik ve antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi

Determination of bacterial biodiversity, enzymatic and antibiotic resistance profiles of İnsuyu Cave

  1. Tez No: 529729
  2. Yazar: FATMA SEÇİL KOÇ
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ NERMİN SARIGÜL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: bakteriyal biyoçeşitlilik, insuyu mağarası, çoklu ilaç direnci, moleküler yöntemler, bacterial biodiversity, Insuyu cave, multiple drug resistance, molecular method
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Burdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 85

Özet

Bu tez çalışmasında İnsuyu Mağarası'nın bakteriyolojik çeşitliliği ve izolatların antibiyotik direnç profilleri kültür temelli yöntemler ve moleküler biyoloji yöntemleriyle belirlenmiştir. Çalışma kapsamında İnsuyu Mağarasının 15 farklı lokasyonundan aydınlık ve karanlık alanlardan örnekleme yapılmıştır. Örnekleme sonunda elde edilen 75 izolatın antibiyotik dirençliliği Minimum İnhibisyon Konsantrasyon (MİK) Testi ile belirlenmiştir. Minimum Inhibisyon Konsantrasyon (MIK) testi sonucunda 75 izolattan 64 sefpodoksim, 6 rifampisin ve gentamisin, 18 vankomisin, 15 ampisilin, 44 klindamisin, 48' inin penisilin antibiyotiklerine karşı en yüksek konsantrasyonda direnç gösterdiği tespit edilmiştir. Çoklu direnç gösteren 10 izolat ve duyarlı 3 izolat seçilerek 16S rRNA dizi analizi ile tür tayini yapılmıştır. Çoklu direnç gösteren Pseudomonas spp. (2G-2), Pseudomonas jesseni (2J), Sphingopyxis fribergensis (4D), Microbacterium yannicii (4M), Flavobacterium chungangense (6B), Rhodococcus spp. (7A), Flavobacterium resistens (9D), Pseudomonas spp. (K-4F), Pseudomonas spp.(K-4G), Buttiauxella agrestis (K-15A) ve duyarlılık gösteren Flavobacterium chungangense (K-1E), Rhodococcus erythropolis (K-11G) ve Pseudomonas spp (K-15G) suşlarında antibiyotik direnç genleri taranmıştır. Pseudomonas jesseni (2J) ve Pseudomonas spp. (K-4G)' de aminoglikozit 2''-O-nükleotiltransferaz (aadB), beta laktamaz (blaCTXM3, blaSHV, blaTEM), aminoglikozit direnç proteini (strA), rifampin ADP- ribosiltransferaz (arr2- int2a), vankomisin (vanC) olmak üzere 8 farklı gen bölgesi saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

In this study, the bacteriological diversity of Insuyu Cave was determined by culture depended and molecular biology methods. Samples were taken from 15 different points in Insuyu Cave. Antibiotic resistance of 75 isolates was determined by the Minimum Inhibition Concentration (MIC) Test. As a result of Minimum Inhibition Concentration (MIC) test, 64 cefpodoxim, 6 rifampicin and gentamycin, 18 vancomycin, 15 ampicillin, 44 clindamycin, 48 penicillin resistant strains were detected. 10 multiple drug resistant and 3 susceptible strains were selected and identificated by 16S rRNA sequencing. Antibiotic resistant genes were investigated for both multiple drug resistantPseudomonas spp. (2G-2), Pseudomonas jesseni (2J), Sphingopyxis fribergensis (4D), Microbacterium yannicii (4M), Flavobacterium chungangense (6B), Rhodococcus spp. (7A), Flavobacterium resistens (9D), Pseudomonas spp. (K-4F), Pseudomonas spp. (K-4G), Buttiauxella agrestis (K-15A) and susceptible Flavobacterium chungangense (K-1E), Rhodococcus erythropolis (K-11G) , Pseudomonas spp (K-15G). AadB, BlaCTXM3, BlaSHV, BlaOXA1, BlaSHV, BlaSHV2, BlaTEM2, StrA and Arr2- int2a genes were detected in Pseudomonas jesseni (2J) and aadB, blaCTXM3, blaOXA1, blaSHV2, strA, strA', arr2-int2a and vanC genes were detected in Psudomonas spp (K-4G).

Benzer Tezler

  1. The bacterial and archaeal biodiversity of Insuyu cave

    İnsuyu mağarasının bakteriyel ve arkeal biyoçeşitliliği

    EZGİ TOK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İklim ve Deniz Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN NÜZHET DALFES

  2. CR-39 dedektörleri ile mağaralarda radon konsantrasyonu ölçümleri

    Radon concentration measurements in caves by using CR-39 detectors

    ALİ KARADEM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Fizik ve Fizik MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET ERTAN KÜRKÇÜOĞLU

  3. Nüfus, toplum ve ekonomi yapısına göre İnsuyu ve Turgud kazaları (1833-1845)

    Insuyu and Turgud districts according to population, society and economic structure (1833-1845)

    ŞENER ŞEKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    TarihKaramanoğlu Mehmetbey Üniversitesi

    Tarih Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA DURDU

  4. İnsuyu kireçtaşı (Karapınar-Konya) ostrakod topluluğunun biyostratigrafik ve kronostratigrafik incelenmesi

    Biostratigraphic and chronostratigraphic investigation of ostracoda association of İnsuyu limestone (Karapınar-Konya)

    KAAN BEKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Jeoloji MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEMAL TUNOĞLU

  5. Population structure and feeding ecology of endemic gudgeon Gobio insuyanus ladiges, 1960

    Endemik insuyu derekayası Gobio insuyanus ladiges, 1960 türünün popülasyon yapısı ve beslenme ekolojisi

    JULİAN ERDOĞAN JOHNSON

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FITNAT GÜLER EKMEKÇİ