Geri Dön

Boy kısalığının genetik etiyolojisinin araştırılması

Investigation of genetic etiology of short stature

PDF İndir

  1. Tez No: 541393
  2. Yazar: ADAM NAJAFLI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BİRSEN KARAMAN, DR. GÜVEN TOKSOY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: boy kısalığı, genetik, yeni nesil dizileme, short stature, genetic, next generation sequencing
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Boy uzunluğunun 3. persantilin, boy uzama hızının 25. persantilin altında olması, öngörülen boyun hedef boya göre 8,5 cm veya daha kısa olması ve kemik yaşının kronolojik yaşa göre ileri (> 2 SD) olması gibi durumlar boy kısalığının tanımında yer alan başlıca kriterlerdir. Klinik olarak patolojik ve non-patolojik olmak üzere iki ana sınıf altında toplanan boy kısalıkları genetik olarak kromozomal, tek gen ilişkili ve multifaktoriyel olarak incelenmektedir. Birçoğu muayene sırasında klinik tanı alsa da kesin tanı amacıyla genetik etkeni bilinenlere sitogenetik ve moleküler testlerin yapılması gerekmektedir. Bu çalışmada klinik olarak idiyopatik boy kısalığı tanısı alan 189 olguda sitogenetik ve moleküler sitogenetik yöntemler kullanılarak genetik etiyolojinin araştırılması planlandı. Normal kromozom kuruluşu saptanan 41 olguda ilişkili 10 gen (GH1, GHR, GHRH, GHSR, IGF1, IGF1R, IGFALS, IGFBP3, SHOX ve STAT5B) ve çoğul hipofiz hormon eksikliği (ÇHHE) ile ilişkili 15 gen panel-gen testi ile Ion Torrent platformunda yeni nesil dizileme (YND) yöntemi ile incelendi. Beş olguda beş farklı gende (BMP4, GHR, IGSF1, LHX4 ve PROKR2) (biri boy kısalığı, dördü ÇHHE genlerinde) biri yeni, biri daha önce ilişkilendirilmiş ve üçü veri tabanlarında yer alan olmak üzere anlamlı olduğu düşünülen toplam beş varyant saptandı. Klinik öneme sahip olduğu düşünülen bu değişimler Sanger dizileme yöntemi ile doğrulandı ve segregasyon analizi yapıldı. Dört heterozigot değişimin ailedeki sağlıklı bireylerde de bulunduğu, homozigot değişim saptanan bir olguda ise ebeveynlerin heterozigot taşıyıcı oldukları gösterildi. Türkiye'de boy kısalığı ile ilişkili ilk panel-gen test uygulaması olan çalışmamızın etiyolojide rol oynayan genetik faktörlerin açıklanmasına, fenotip-genotip ilişkilerin açıklanmasına ve özgün genetik danışmaya katkı sağlaması beklendi. Boy kısalığının geniş bir genetik spektruma sahip olması nedeniyle hedefli panellerle çalışmanın araştırmada yeterli olmadığına, bu tür incelemelerin indeks olgu ve ebeveynleri içeren, sağlıklı kontrol grubuyla paralel olarak tüm ekzom veya tüm genom dizileme çalışmaları ile yapılmasının daha doğru bir yaklaşım olacağı kanaatine varıldı.

Özet (Çeviri)

The main criteria of short stature are: height below 3rd percentile, growth rate below 25th percentile, height being 8.5 cm shorter than the target stature, and the bone age being older than the chronological age (>2 SD). Short stature is divided into two categories as being clinically pathological and non-pathological, and are further divided into subgroups associated with different level of genetic factors such as chromosomal, single gene and multifactorial. Although many of the cases are clinically diagnosed during physical examination, cytogenetic and molecular tests are recommended if genetic cause is expected. In this study, we aimed to elucidate the genetic etiology of 189 clinically diagnosed short stature patients. All of the patients are first evaluated with cytogenetic analysis that followed with molecular tests for the cases with normal karyotypes. Molecular test compromised of the investigation of 10 genes associated with short stature (GH1, GHR, GHRH, GHSR, IGF1, IGF1R, IGFALS, IGFBP3, SHOX and STAT5B) and 15 genes associated with combined pituitary hormone deficiency (CPHD) packed as panel-gene on Ion Torrent platform. Five different variants in five cases expected to have significant clinical impact (BMP4, GHR, IGSF1, LHX4 and PROKR2) are identified. Only one of those was previously associated, three were rare variants annotated in databases and one was novel. Mutations that were thought to have clinical importance are confirmed by Sanger sequencing. Segregation studies had revealed that four of the heterozygous alterations were also identified in healthy family individuals and one homozygous change was shown to be inherited from heterozygous parents. Our panel-gene test for short stature was in-house designed for the first time in Turkey and our findings are expected to elucidate genetic factors that play a role in the etiology of this phenotype, to reveal genotype-phenotype correlations and to contribute to the personalized genetic counseling. Since short stature has a high genetic heterogeneity, we determined that gene panel is not competent and that proper approach should be to investigate index individuals, their parents and healthy controls by means of whole exome or whole genome sequencing.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    272528

    İdiyopatik boy kısalığı olan bireylerde SHOX geni mutasyonlarının araştırılması

    Analyses of SHOX gene mutations in patients with idiopathic short stature

    İSMAİL AYKUT ÇATAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GenetikPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CAVİDAN NUR SEMERCİ

  2. Tez No

    466491

    Keçiören Eğitim ve Araştırma Hastanesinde hashimoto tiroiditi tanısı ile takip edilen çocukların değerlendirilmesi

    Evaluation of children diagnosed with hashimoto thyroiditis in Keçioren Training and Research Hospital

    ECE GÖKÇE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYSUN ÇALTIK YILMAZ

  3. Tez No

    175195

    Endokrinoloji polikliniğine boy kısalığı ile başvuran kronik sistemik hastalığı olmayan olguların antropometrik özellikleri,genetik boy potansiyellerinden sapma dereceleri ve tanısal dağılımları

    Anthropometric characteristics, deviation degree of genetically height potentials and diagnostical disturbutions of short stature cases without chronic systemic disease admitted to endocrinology policlinic

    NURİ ALAÇAKIR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAnkara Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    GÖNÜL ÖÇAL

  4. Tez No

    2946

    Boy kısalığı gösteren 13-17 yaş arası çocuklarda benlik kavramı

    Başlık çevirisi yok

    AYSIN TURPOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1988

    Psikolojiİstanbul Üniversitesi

    Ana Çocuk Sağlığı Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURÇİN SAKA

  5. Tez No

    437558

    Büyüme hormonu eksikliği olan hastaların tedavi ile büyüme durumunun ve erişkin boyunun değerlendirilmesi

    The assessment of growth velocity and adult height of treated patients with diagnosis of growth hormone deficiency

    EBRU OĞULTEKİN VAZGEÇER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. ŞÜKRAN POYRAZOĞLU

Geri Dön