Geri Dön

Characterization of a candidate effector of wheat yellow rust targeting chloroplast with a novel transit peptide

Kloroplasta yeni bir transit peptit ile lokalize olan buğday sarı pas patojeninin karakterize edilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 547282
  2. Yazar: AYŞE ANDAÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA, DOÇ. DR. BALA GÜR DEDEOĞLU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 124

Özet

Puccinia striiformis f. sp. tritici, buğdayda sarı pas hastalığına neden olan bir fungus patojeni olup, dünyanın bir çok yerinde buğday üretiminde büyük kayıplara neden olmaktadır. Bu fungus patojenleri bitkinin immunitesini baskılamak için kendi efektör moleküllerini konak hücresi içerisine göndererek, bitki üzerinde kolonileşirler. Patojenin bu önemli efektör proteinlerini karakterize etmek ve tanımlamak için bir sürü çalışmalar devam etmektedir. Yine de, bu efektörlere ait biyolojik ve biyokimyasal fonkiyonlar; yeterli düzeyde tanımlanamamıştır. Bu tez çalışmasında, Puccinia striiformis f. sp. tritici fungusunun bir efektör adayı olan PstCTE1 çalışılmış ve bitkide ekspres edildiğinde kloroplasta lokalize olduğu gözlemlenmiştir. Bu lokalizasyona sebep olan transit peptid en çok kullanılan biyoenformatik programlar ile aranmış fakat tespit edilememiştir ve kendine özgü bir transit peptidi olduğu düşünülmektedir. Daha sonra, bu transit peptidin N-terminal etiketlemeden etkilenmediği ve PstCTE1 efektörünün yine kloroplastta localize olduğu gözlemlenmiştir. Ayrıca, efektörün N-terminal tarafına signal peptidi birleşik şekilde ekspres edildiğinde yine kloroplasta gittiği gözlemlenmiştir ve bu bulgu da hücre içerisine tekrar grime hipotezini desteklemektedir.

Özet (Çeviri)

Fungal pathogen, Puccinia striiformis f. sp. trtici, is the causative agent of stripe disease of wheat which causes disruption on wheat yield in many parts of the world. Fungal pathogens secrete effector molecules into host plant cells to suppress host immunity via virulence to colonize plants. Ongoing efforts are being made to identify and characterize effector proteins in many fungal plant pathogens. Nevertheless, the precise biological and biochemical functions of many effectors, such as their trafficking from the pathogen to the host cytoplasm, have yet to be fully understood. In this study, we show that an effector candidate (PstCTE1) of Puccinia striiformis f. sp. tritici localizes to chloroplasts when expressed in planta, although it has no transit signal region that can be detected by widely accepted prediction tools, indicating that it must be carrying a unique localization signal. Moreover, N-terminal tagging has no effect on the chloroplast localization of PstCTE1. It has been also observed the entrance of the effector to the chloroplast even in the presence of an intact signal peptide on the N-terminus of the transit peptide region, a result that supports possible host cell re-entry.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    338343

    Investigation of subcellular localization of a yellow rust pathogen effector candidate

    Sarı pas patojeni efektör adayının hücre içi lokalizasyonunun incelenmesi

    AYŞE ANDAÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA

  2. Tez No

    535991

    Bacterial expression of an effector protein of yellow rust pathogen and a resistance protein of wheat and characterization of the effector protein

    Sarı pas patojenine ait bir efektör proteinin ve buğdaya ait bir direnç proteininin bakteri içinde ifadesi ve efektör proteinin karakterizasyonu

    SAYIT MAHMUT ERDOĞAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR S. AKKAYA

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİH ÖZÇUBUKÇU

  3. Tez No

    397770

    Bacillus subtilis GntR ailesine ait LutR transkripsiyon faktörünün doğrudan kontrolü altındaki genlerin CHIP ve EMSA yöntemleriyle belirlenmesi

    Determination of genes under the direct control of GntR-type transcriptional factor LutR in Bacillus subtilis PY79 by CHIP and EMSA methods

    MURAT KEMAL AVCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN KARATAŞ

  4. Tez No

    593169

    Development of supported non-noble metal catalysts for partial hydrogenation of 1,3-butadiene

    1,3-butadiyenin kısmi hidrojenasyonu için soy olmayan metal katalizörlerin geliştirilmesi

    AHSAN JALAL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    KimyaKoç Üniversitesi

    Kimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    Assoc. Prof. Dr. ALPER UZUN

  5. Tez No

    459236

    Zeytinde polen uyumunu kontrol eden aday genin moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of a candidate gene associated in pollen recognation of olive

    ALİ CAN KAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLENDAM TÜMEN

Geri Dön