DNA tabanlı moleküler yöntemler kullanılarak Türkiye'de yetiştirilen farklı fasulye (Phaseolus vulgaris) genotiplerinin genetik çeşitlilik analizi
The genetic diversity analysis of different bean (Phaseolus vulgaris) cultivated genotypes in Turkey using DNA-based moleculer methods
- Tez No: 559563
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İSMAİL POYRAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 91
Özet
Dünyada fasulyenin 230 civarında türünün var olduğu, bunların 20 adedinin insan beslenmesinde yoğun olarak kullanıldığı ve en fazla üretimi yapılan türün ise P. vulgaris olduğu bilinmektedir. Bu çalışmada, Eskişehir Tarımsal Araştırma enstitüsünden temin edilen 38 fasulye genotipinde, ISSR (Basit Tekrarlı Diziler Arası Polimorfizmi), RAPD (Rastgele Çoğaltılmış DNA Polimorfizmi) ve ITS (Transkripsiyon İçindeki Ara Parça) DNA tabanlı moleküler belirteçleri kullanılarak genetik çeşitlilik analizi gerçekleştirilmiştir. Analizlerde dış grup olarak farklı fasulye türüne ait Ph.Corh çeşidi kullanılmıştır. PCR ürünü bantlar Phoretix1DPro programıyla analiz edilmiş, elde edilen var (1) yok (0) (binary yöntemi) verileri kullanılarak UPGMA metoduyla Jaccard Benzerlik/Mesafe Matriksi oluşturulmuştur. Matriks verilerinden elde edilen Newick formatıyla Mega 6.0 programında her bir yöntem için filogenetik ağaç oluşturulmuştur. ISSR yöntemiyle elde edilen filogenetik ağaca ait mesafe matriksi verilerine göre UI1140 ve Novanbey (mesafe verisi: 0.946) genotiplerinin birbirine en uzak bireyler olduğu görülmüştür. RAPD yöntemiyle elde edilen filogenetik ağaç sonucuna göre ise, Cardinal Yozgat Barbunyası ve 17SBVD20 (mesafe verisi: 0.805) genotiplerinin en uzak bireyler olduğu belirlenmiştir. ITS yöntemiyle elde edilen filogenetik ağaç, dış grup ayrımı net olmadığı için değerlendirilmemiştir. Genetik yakınlıkları daha önce analiz edilmemiş genotipler kullanılarak gerçekleştirilen bu çalışmadan elde edilen veriler, gelecekte yapılacak ıslah çalışmalarında hastalıklara daha dayanıklı ve verimi yüksek yeni çeşitlerin geliştirilmesi için önemli bir veri tabanı niteliğindedir.
Özet (Çeviri)
It is known that there are around 230 species of beans in the world and 20 of them are used extensively in human nutrition and P. vulgaris is the most produced species. In this study, the DNA-based molecular markers of 38 beans genotypes obtained from Eskişehir Agricultural Research Institute an important database has been created for rapid recovery of new varıetıes which are both resistant to determined diseases and with high efficiency in the future improvement studies with ISSR (Inter Simple Sequence Repeat Polymorphism), RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) and ITS (Internal Transcribed Spacer) markers. Ph.Corh cultivars belonging to different bean species were used as external groups in the analyzes. The band analysis of the PCR products of the selected markers was performed by Phoretix1DPro program. By using the data obtained by the binary method, Jaccard similarity matrix was obtained by UPGMA method. With the Newick format obtained from matrix data, phylogenetic tree was created for each method in Mega 6.0 program. As a result of distance matrix data obtained by tree obtained by ISSR primer, UI1140 and Novanbey (distance matrix: 0.946) genotypes were found to be the most distant individuals and the drawn tree with RAPD primers, Cardinal Yozgat Barbunyası and 17SBVD20 (distance matrix: 0.805) genotypes were identified as the most distant individuals. The phylogenetic tree obtained by the ITS method was not evaluated because the distinction of the out-group was not clear. Data obtained from this study performed using genotypes that genetic relationship wasn't analyzed have got important data qualification to develop new more resistant and fruitful varieties in future breeding studies.
Benzer Tezler
- Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri
Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types
SEVDA DÜLGER
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER
- Türkiye'de yetişen bazı Scandix L. (Apiaceae) türleri üzerinde biyosistematik araştırmalar
Biosystematics research on some of Scandix L. (Apiaceae) species grown in Turkey
AZİZE DEMİRPOLAT
- Development of fast and economic QPCR-based method for meat species detection
Hızlı ve ekonomik et tür tayini için QPCR tabanlı bir yöntem geliştirilmesi
EDA ÇİFTÇİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiBiyoloji Bölümü
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
DR. MUSTAFA KOLUKIRIK
- Laboratuvar hattı Lucilia sericata'nın lucimycin, chymotrypsin, lucifensin genlerinin moleküler karakterizasyonu ve rekombinant füzyon proteinin ekspresyon denemeleri
Molecular characterization of lucimycin, chymotrypsin, lucifensin genes of Lucilia sericata lab line and expression trials of recombinant fusion protein
EMRAH ERDOĞAN
Doktora
Türkçe
2020
ParazitolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Parazitoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖNDER DÜZLÜ
- Yapay zeka tabanlı yöntemler kullanılarak mikroarray gen verilerinin sınıflandırılması
Classification of microarray gene data using artificial intelligence based methods
MUSTAFA TURAN ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolErciyes ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADEM KALINLI