BreastIS: A software tool for flexible breast MRI analysis
BreastIS: Meme MRG analiz yazılımı
- Tez No: 561260
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ESİN ÖZTÜRK IŞIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Biyomühendislik, Mühendislik Bilimleri, Computer Engineering and Computer Science and Control, Bioengineering, Engineering Sciences
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Biyo-Medikal Mühendislik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
Manyetik rezonans görüntüleme (MRG) meme kanserinin teshisi ve takibiyle ilgili oldukça faydalı bilgi saglamaktadır. Günümüzde meme MRGâde genellikle dinamik kontrastlı MRG (DKG), difüzyon agırlıklı MRG (DAG) ve proton MR spektroskopik görüntüleme (1H-MRSG) teknikleri kullanılmaktadır. Bu görüntüleme tekniklerinin analizlerini ayrı ayrı yapabilen farklı yazılımlar bulunmaktadır. Bu çalısmada tüm bu tekniklerin analizini yapabilen esnek ve açık kaynak kodlu BreastIS görüntü analizi yazılımı gelistirilmistir. BreastIS görüntü analizi yazılımı MATLAB kullanılarak programlanmıstır, ve kullanıcı ara yüzü MATLAB GUI ve Java kullanılarak gelistirilmistir. Windows, Linux ve Mac isletim sistemlerini desteklemektedir. Tasarlanan yazılımın analiz ve görüntü isleme algoritmalarını ve klinik veriye uyumlulugunu test etmek için retrospektif analizler yapılmıstır. DKG analizleri için 16 meme kanseri hastaya ait MRG ve DAG analizleri için de 6 meme kanserli hastaya ait MRG BreastIS yazılımı kullanılarak analiz edilmistir. Analizler sonucunda tümörlü ve saglıklı doku arasındaki farklılıkları saptamak için hesaplanan parametrelere Mann-Whitney sıra toplam testi uygulanmıstır. DKG analizleri sonucunda hesaplanan sinyalde ortalama yüzde artıs, erken evrede artıs yüzde artıs gibi parameterler tümörlü ve saglıklı doku için istatistiksel olarak anlamlı farklılıklar göstermistir (P
Özet (Çeviri)
Magnetic resonance imaging of breast provides valuable information about breast tissue composition. A common breast MRI protocol may include dynamic contrast enhanced (DCE) MRI, diffusion weighted MRI (DWI) and proton MR spectroscopic imaging (1H-MRSI). There have been several software tools that can analyze each of these data types separately. In this study, a flexible and open-source postprocessing software called 'BreastIS 'was developed to analyze DCE-MRI, DWI, and 1H-MRSI and store them in a database for further exploration. BreastIS image processing software was implemented using MATLAB and the graphical user interface was developed using MATLAB GUI and Java. The software could be run onWindows, Mac and Linux computers. A retrospective study was conducted to test the suitability of the analysis algorithms of BreastIS tool for the use with clinical dataset. DCE-MRI data of 16 and DWI data of 6 breast cancer subjects were analyzed with BreastIS. For DCE-MRI analysis, the semi-quantitative parameters such as early and maximum percentage enhancement, signal uptake pattern and maximum pixel intensity were calculated for healthy and tumor regions of each subject. For DWI analysis, mean and maximum apparent diffusion coefficient (ADC) values were calculated for tumor and healthy regions of each subject. A Mann-Whitney rank sum test with Bonferroni multiple comparison correction was applied to find statistically significant differences between healthy and tumor regions. Maximum and early percentage enhancements and maximum pixel intensity were higher (P
Benzer Tezler
- Meme kanserinde nöroendokrin farklılaşma gösteren hastaların luminal A moleküler alt tipteki meme kanserli hastalarla klinik ve histopatolojik olarak karşılaştırılması
Clinical and histopathological comparison of patients showing neuroendocrine differentiation in breast cancer with patients with luminal A molecular subtype breast cancer
MUHAMMED BAHADIR AVCI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Genel CerrahiSağlık Bilimleri ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERVET KOCAÖZ
- Meme görüntülemede termografi uygulamaları ve konvansiyonel sistemlerle karşılaştırılması
Comparison of thermography with other conventional imaging modalities from breast imaging perspective
FUAD NURİLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Radyoloji ve Nükleer Tıpİstanbul ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET HALİT YILMAZ
- İri memelerde superomediyal pediküllü meme küçültme yaklaşımı ve tekniğin güvenilirliğinin değerlendirilmesi
Superomedial pedicle breast reduction approach for giant breasts and evaluation of the reliability of the technique
ALİ TÜRKOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Plastik ve Rekonstrüktif Cerrahiİstanbul Medipol ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA KESKİN
- Bebeklerin ilk 6 aydaki beslenme durumlarının retrospektif olarak incelenmesi
The retrospective research of the first six months infants feeding
YEŞİM KURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Hemşirelikİstanbul Bilim ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZERRİN ÇİĞDEM
- Miyokart perfüzyon SPECT/BT uygulamasında meme dokusu atenüasyonu: Kardiyak fantom çalışması
Breast tissue attenuation in myocardial perfusion SPECT/CT application: Cardiac phantom study
FATİH BOĞA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiRadyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FEVZİYE CANBAZ TOSUN