Geri Dön

Antibiyofilm ajanı olarak DNA aptamerlerinin Salmonella biyofilm oluşumuna etkisi

The effect of DNA aptamers as antibiofilm agents on Salmonella biofilm formation

PDF İndir

  1. Tez No: 561632
  2. Yazar: FATIMA SHATILA
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HÜSNİYE TANSEL YALÇIN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Beş Salmonella enterica serovarları, biyofilm oluşturma yetenekleri açısından test edilmiştir, bunların arasında S. Enteritidis 6 (2014) ve S. Enteritidis (86) suşlarının, en yüksek biyofilm oluşturma kabiliyetine sahip olduğu görülmüştür. Bu nedenle bu iki suş ileri denemeler için seçilmiştir. Bir GST füzyon proteini olarak pGEX-4T-1 vektörüne klonlanmış olan SipA proteinin optimum üretimi, Rosetta hücreleri kullanılarak elde edilmiştir. Saflaştırılan SipA proteini, SELEX yöntemi kullanılarak aptamerler geliştirmek için kullanılmıştır. Karakterize edilmiş Apt17 inhibisyon çalışmalarında kullanılmıştır. Apt17 (2 µM) S. Enteritidis 6 (2014) ve S. Enteritidis (68) suşları ile birlikte inkübe edildiğinde sırasıyla %24.34 ve %26.81 oranında biyofilm oluşumunu inhibe ettiği görülmüştür. SEM ile biyofilm oluşumu analiz edildiğinde, Apt17 ile muamele edilen S. Enteritidis 6 (2014) biyofilmlerinin 3D yapıyı oluşturmadığı ve matriks yapısının da kontrol ile karşılaştırıldığında aynı olmadığı gözlemlenmiştir. Öte yandan, Apt17 ile muamele edilen S. Enteritidis (68) hücrelerinin cam yüzeyi kaplamadığı da görülmüştür. Yapılan adezyon ve invazyon analizlerinde ise Apt17 (2 µM), Caco-2 hücre hattının adezyonunu % 25–70 oranında ve invazyonunu ise % 18.03 – 39.5 oranında inhibe etmiştir.

Özet (Çeviri)

Five Salmonella enterica serovars were tested for their biofilm formation ability. Among which, S. Enteritidis 6(2014) and S. Enteritidis (86) demonstrated the highest biofilm formation ability. These two most potent biofilm formers were chosen for further experiments. Optimum production of SipA, cloned as a GST fusion protein into pGEX-4T-1 vector, was obtained when Rosetta cells were incubated over night at 28°C. Aptamers were developed against the purified protein by Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment. The characterized Apt17 was applied in inhibition studies. Maximum inhibition percentages, equivalent to (24.34%) and (26.81%), were recorded when Apt17 (2 µM) was co-incubated with S. Enteritidis 6(2014) and S. Enteritidis (68) respectively. SEM analysis revealed that treated S. Enteritidis 6(2014) biofilms didn't form the 3D structure and matrix wasn't evident. On the other hand, Apt17 reduced the surface coverage of Salmonella Enteritidis (68) cells on the attachment surface. A smaller diameter of cell aggregates was recorded in the treated specimens of both tested strains. Moreover, Apt 7 (2µM) inhibited the adhesion and invasion of Caco-2 cell line by 25 to 70 % and 18.03 to 39.5 % respectively

Benzer Tezler

  1. Tez No

    109455

    Test of biomaterials in biological systems

    Biyomalzemelerin biyolojik sistemlerde test edilmesi

    MERT SUDAĞIDAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2001

    Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. HATİCE GÜNEŞ

  2. Tez No

    157626

    Dental materyal yüzeylerinde tükürük tarafından oluşturulan biyofilm tabakasının değerlendirilmesi

    Evaluation of biofilm layer produced by saliva on dental material surfaces

    FULYA ÇİZMECİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Diş HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Protetik Diş Tedavisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEHİR ÖZDEN

    DOÇ. DR. IBTİSAM AL-HASHIMI

  3. Tez No

    223017

    Çeşitli sistemlerde sorun oluşturan hücre dışı polisakkarit üreten mikroorganizmaların polisakkaritlerinin biyoparçalanması ve parçalanma etkinliğinin saptanması

    Determination of biodegradation and biodegradation capability of polysaccharides of extracellular polysaccharides producing microorganisms which cause problems in several systems

    NUR CEYHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜVEN ÖZDEMİR

  4. Tez No

    242642

    Fosfomisin disodyum kaplı üreteral stentlerin sık karşılaşılan üropatojenlere ve enkrustasyona karşı etkinliğinin in vitro ve in vivo olarak incelenmesi

    In vitro and in vivo activity of fosfomycin disodium loaded ureteral stents against common bacterial uropathogens and encrustation

    MUHARREM MURAT YILDIZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET AKIN

  5. Tez No

    276568

    Anti-fouling boyaların denizdeki bakteriyal biyofilm gelişimi üzerine etkisi

    Effects of anti-fouling paints on marine bacterial biofilm development

    ASLI KAÇAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Deniz BilimleriDokuz Eylül Üniversitesi

    Deniz Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BÜLENT CİHANGİR

  6. Tez No

    304433

    Pseudomonas aeruginosa'nın planktonik ve biyofilm kültürlerine karşı çeşitli dezenfektanların antimikrobik etkilerinin araştırılması

    Evaluation of the bactericidal activity of various disinfectants against pseudomonas aeruginosa in planktonic and biofilm cell cultures

    EMEL MATARACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. A.ALEV GERÇEKER

Geri Dön