Yabani soya (Glycine) türlerinde CenH3 genomik DNA dizilerinin klonlanması
Molecular cloning of CenH3 genomic DNA sequences in the wild soybean (Glycine) species
- Tez No: 562026
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET LATİF TEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Ziraat, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
Ökaryotik organizmalarda hayati fonksiyonların sağlanması için gerekli olan hücre bölünmesi sırasında kromozomların doğru olarak ayrışması önemlidir. Bu işlevi kromozomlar üzerindeki sentromerler sağlamaktadır. Her ne kadar sentromerik DNA dizileri evrimsel olarak değişkenlik gösterse de, sentromeri oluşturan histon H3 varyantı olan sentromerik histon H3 (CENH3) proteini korunmuştur. Bu tez çalışmasında farklı soya türlerinde moleküler yöntemlerle CenH3 genomik DNA lokus dizi bilgisi tespit edilmiştir. Bu amaçla farklı soya türlerinin yapraklarından genomik DNA izole edilmiştir. PCR ile CenH3 genine özgü primer çiftleri kullanılarak, toplam CenH3 genomik lokusu çoğaltılmıştır. Çoğaltılan genomik DNA fragmentleri klonlanarak CenH3 genomik lokusunun dizi bilgisine ulaşılmıştır. Biyoinformatik yöntemler ile intron ve ekzon bölgeleri tespit edilerek, tür içi ve türler arasında DNA dizi hizalaması yapılmıştır. Ekzon bölgelerinde daha fazla dizi korunmuşluğu varken, intron bölgelerinde nükleotit uzunluk farkları tespit edilmiştir. Gelecekte soya ıslahında sentromer modifikasyonunu dayanan haploid hatların geliştirilebilmesi için farklı soya türlerinde CenH3 genomik DNA lokus dizi bilgisinin katkı sağlayacağı değerlendirilmektedir.
Özet (Çeviri)
doldurulacaktırProper distribution of chromosomes during cell division is essential for maintaining vital functions in eukaryotic organisms. Centromeres provide such functions on chromosomes. Although centromeric DNA sequences vary evolutionarily, the centromeric histone H3 (CENH3) protein, a variant of the histone H3, is conserved throughout eukaryotes. In this thesis, CenH3 genomic DNA locus sequence information was determined by molecular methods in several soybean species. For this purpose, genomic DNA was isolated from the leaves of different soybean species. The complete CenH3 genomic loci were amplified by PCR using primers specific to the CenH3 gene. The amplified genomic DNA fragments were cloned and the sequence information of the CenH3 genomic locus was obtained. Intron and exon regions were determined by bioinformatics methods and DNA sequence alignment within and between species was performed. Nucleotide length differences were detected in intron regions, while exon regions had greater sequence conservation. In order to develop haploid lines based on centromere modification in soybean breeding, the sequence information of CenH3 genomic DNA locus from different soybean species will contribute significantly.
Benzer Tezler
- Yabani soya türlerinde CenH3 geninin cDNA moleküler klonlanması
cDNA molecular cloning of CenH3 gene in wild soybean species
HÜMEYRA YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
GenetikNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET LATİF TEK
- Bazı pestisitlerin soya (Glycine max (L.) Merrill cv. May 5312) üzerindeki genotoksik etkilerinin belirlenmesi
Determination of genotoxic effects of some pecticıdes on soybean (Glycine max (L.) Merrill cv. May 5312)
ASUMAN DEVECİ
- Türkiye'de ıslah edilmiş yeni soya (Glycine max. L. Merrill) çeşitlerinin orta karadeniz bölgesi koşullarında verim ve kalite performanslarının belirlenmesi
Determination of yield and quality performances of new soybean (Glycine max. L. Merrill) varieties improved in Turkey under middle black sea region conditions
BAYRAM AY
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FUNDA ARSLANOĞLU
- EMS mutageni kullanılarak klorosulforon (su grubu) herbisitine karşı dayanıklı soya (Glycine max L.) mutantlarının geliştirilmesi ve ALS geninin dizi analizi
Development of soybean (Glycine max L.) mutants resistant to chlorsulfuron (su group) herbicide through EMS mutagen and ALS gene sequence analyses
RÜSTEM ÜSTÜN
Doktora
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT UZUN
- Türkiye'deki işlenmiş soya ürünlerinde kalitatif ve kantitatif GDO tanısı ve transgen analizi
Qualitative and quantitative GMO detection of processed soy products and analysis of transgene in Turkey
MÜNEVVER MERVE YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞULE ARI