Pseudomonas putida'nın Arabidopsis thaliana ve Nicotiana tabacum bitkileri ile in vitro biyotizasyonu ve 2,4-dinitrotoluen'in biyotransformasyonu
In vitro biotization of Pseudomonas putida with Arabidopsis thaliana and Nicotiana tabacum and biotransformation of 2,4-dinitrotoluene
- Tez No: 565917
- Danışmanlar: PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ, DR. ÖZLEM AKKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 113
Özet
Bu çalışmada patlayıcı sanayinde ve poliüretan köpük yapımında kullanılan ksenobiyotik bir bileşik olan 2,4-dinitrotoluen'in (2,4-DNT) in vitro koşullarda biyotransformasyonu incelenmiştir. Arabidopsis thaliana L. (A. thaliana), genomuna Burkholderia cepacia R34 bakterisine ait dnt degradasyonunundan sorumlu genler aktarılmış Pseudomonas putida (P. putida) KT.DNT bakterisi ile inoküle edilmiştir. Bitki köklerinde kolonize olan bakteri aracılığı ile 2,4-DNT'nin in vitro biyodegradasyonu gerçekleştirilmiştir. Öncelikle bitki-bakteri etkileşimi çalışmaları yapılarak, P. putida'nın A. thaliana ve N. tabacum tohum çimlenmesi, bitki gelişimi ve büyümesine etkileri; farklı inokülasyon yöntemleri ve P. putida'nın farklı konsantrasyonları denenerek incelenmiştir. Böylece P. putida ile inokülasyon için bitkilerin optimum fizyolojik evresi belirlenmiştir. Bitki-bakteri birlikteliği sonrasında, bitki köklerine tutunan ve 2,4-DNT'yi degrade edebilen bakteriler tarafından 2,4-DNT'nin degradasyonu değerlendirilmiştir. 2,4-DNT'nin degradasyonu sonucunda, ortamdaki 2,4-DNT miktarındaki azalma ve oluşan degradasyon ürünleri spektrofotometrik ve kromatografik yöntemlerle analiz edildi. Elde edilen veriler bitki köklerine tututan KT.DNT bakterisinin 2,4-DNT biyotransformasyonunu etkin bir şekilde yapabildiğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, biotransformation of 2,4-dinitrotoluene (2,4-DNT), a xenobiotic compound used in explosive industry and polyurethane foam production, was investigated. Arabidopsis thaliana L. (A. thaliana) inoculated with Pseudomonas putida (P. putida) KT.DNT carrying the genes necessary for 2,4-DNT degradation from Burkholderia sp. R34. In vitro biodegradation of 2,4-DNT was carried out by bacteria colonizing plant roots. First of all, the effects of P. putida on A. thaliana and N. tabacum seed germination, plant growth and development were investigated by using different inoculation methods and different concentrations of P. putida. Thus, the optimal physiological stage of the plants was determined for inoculation with P. putida. Afterwards, the 2,4-DNT degradation activity of the bacteria attached to the roots of the plant and capable of degrading DNT was evaluated. As a result of degradation of 2,4-DNT, the decrease in the amount of 2,4-DNT and the resulting degradation products were analyzed by spectrophotometric and chromatographic methods. The obtained data showed that DNT-degrading bacteria, which attach to plant roots, can efficiently perform 2,4-DNT biotransformation.
Benzer Tezler
- Bitki büyümesini teşvik edici bazı bakterilerin oluşturduğu biyofilm yapılarının raman spektroskopisi ile karakterizasyonu
Characterization of biofilm structures produced by some bacteria that promote plant growth by raman spectroscopy
TACETTİN ÇİFTÇİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İBRAHİM ERDOĞAN
- Investigation of microRNAs roles during maize leaf growth response to pseudomonas putida
Pseudomonas putida ile inoküle edilen mısır bitkisinin yaprak büyüme cevabında mikroRNA genlerinin rolünün araştırılması
ÖMER İLTAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
DR. FATMA AYDINOĞLU
- Pseudomonas putida NRRL B-13 suşu tarafından Toluen'in biyolojik yıkımının belirlenmesi
Determination of Toluen biodegradation by pseudomonas putida NRRL B-13 strain
SÜMEYYA TATLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSA SARİ
- Bitki büyüme düzenleyici bakteri olarak Pseudomonas putida'nın sapsız meşe (Quercus petrea L.) fidanlarının tutma başarısı üzerine etkisi
Effect of plant growth promoting bacteria Pseudomanas putida on the survival rate of sessile oak (Quercus petraea L.)
ZEKİYE ODABAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Ormancılık ve Orman MühendisliğiArtvin Çoruh ÜniversitesiOrman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZAFER ÖLMEZ
- Pseudomonas putida ile izoöjenolden doğal vanilin üretiminin optimizasyonu
Optimization of natural vanillin production from isoeugenol by pseudomonas putida
HÜSEYİN KARAKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Gıda Mühendisliğiİnönü ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT YILMAZTEKİN