Comparison of different assay techniques used for detecting acetyl-CoA carboxylase (ACCase) and acetolactate synthase (ALS)-inhibitors herbicide resistance in sterile wild oat (Avena sterilis L.)
Asetil-CoA karboksilaz (ACCase) ve asetolaktat sentetaz (ALS) enzimi inhıbitörü herbisitlere karşı kısır yabani yulaf (Avena sterilis L.) direncinin belirlenmesinde farklı yöntemlerin karşılaştırılması
- Tez No: 565941
- Danışmanlar: PROF. DR. SİBEL UYGUR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 140
Özet
Herbisit direnci, herbisitlerin yoğun bir şekilde kullanımından kaynaklanmış olup, son yıllarda tarım ve gıda güvencesini tehdit eden küresel bir sorun haline gelmiştir. ACCase ve ALS inhibitörlerine dirençli olan yabancı otlar, dünya genelinde bildirilen tüm direnç vakalarının üçte birinden fazlasını oluşturur ve Akdeniz çevrelerde buğday üretiminin ana kısıtlayıcısı olmaktadır. Ancak, yabancı otlardaki herbisit direncini saptamak için farklı yaklaşımlar geliştirilmiştir. Bu çalışma, Adana ilinde yetişen Kısır Yabani Yulaf (Avena. sterilis)'taki Asetil CoA Karboksilaz (ACCase) ve asetolaktat sentetaz (ALS) inhibe eden herbisitlere karşı direnci saptamak amacıyla kullanılan hızlı testler [flitre kağdı ve agar bazlı (tohum ve fide)], sera test ve moleküler testlerinin güvenilirliği ve geçerliliği karşılaştırılmasını amaçlanmıştır. Moleküler testlerde, dirençli ve hassas popülasyonlarının ACCase genleri dizilmiş ve karşılaştırılmıştır. Yapılan çalışmada, sera testleri, dirençli A. sterilis popülasyonunun clodinafop-propargyl (11.97 kat) ve pyroxsulam (42.88 kat)'a karşı yüksek bir direnç seviyesine; ve pinoxaden (2.1 kat) ve mesosulfuron-methyl iodosulfuron-methyl-sodium (1.08 kat)'e karşı düşük bir direnç seviyesine sahip olduğunu doğrulamıştır. Hızlı testlerden elde edilen direnç seviyelerinin tüm herbisitlerde 5 kattan az olduğu bulunmuştur. ACCase geninde altı mutasyon noktası“Serin (Ser), Glisin (Gly), Treonin (Thr), Valin (Val), Glutamin (Gln) ve Fenilalanin (Phe)”" tespit edilmiştir. Sonuç olarak, agar bazlı testler, doğru, hızlı ve uygun maliyetli herbisit direnci onayları sağlayıp, sera ve flitre kağdı testlerine göre daha az alana ihtiyaç duymaktadır. Moleküler testi, dirençli popülasyondaki hedef bölge direncini doğrulamıştır. Çalışma, bu mutasyonları Türkiye'de ilk kez A. sterilis'te rapor etmektedir.
Özet (Çeviri)
Intensive use of herbicides has resulted in the occurrence of herbicide resistance. Recently, herbicide resistance has become a global issue threatening agricultural food production. ACCase and ALS-inhibitor-resistant weeds constitute more than one-third of all the reported resistance cases worldwide becoming the main constraint to wheat production in Mediterranean environments. However, different techniques have been devised to detect herbicide resistance in weeds. This study was aimed to compare the reliability and validity of quick tests [filter paper and agar-based (seed and seedling)], greenhouse (whole-plant pot) and molecular tests for detecting the resistance to acetyl-CoA carboxylase (ACCase) and acetolactate synthase (ALS)-inhibiting herbicides in sterile wild oat (Avena sterilis L.) in Adana, Turkey. In the molecular test, ACCase genes of the resistance and susceptible populations were sequenced and compared. As a result, greenhouse tests confirmed that the resistant population of A. sterilis has a high-level of resistance to clodinafop-propargyl (11.97 fold) and pyroxsulam (42.88 fold); and low resistance level to pinoxaden (2.1 fold) and mesosulfuron-methyl+iodosulfuron-methyl-sodium (1.08 fold). The levels of resistance obtained from quick tests were less than 5-folds in all herbicides. Six mutation points“Serine (Ser), Glycine (Gly), Threonine (Thr), Valine (Val), Glutamine (Gln) and Phenylalanine (Phe)”were detected in the ACCase gene. In conclusion, the agar-based tests provided feasible, accurate, rapid and cost-effective herbicide resistance confirmations which need less space than a greenhouse and filter paper tests. The molecular test confirmed the target-site resistance in the resistant population. The study reports these mutations for the first time in A. sterilis in Turkey.
Benzer Tezler
- Yüksek basınçlı sıvı kromatografisi (HPLC) yöntemi ile plazma vitamin D3 ölçümü
The measurement of Vitamin D3 by high performance liquid chromatography method
FETHİ ABDULGANİ
- Towards implanted biosensors: Methods for miniaturising and protectingpeptide-based electrochemical sensors
Başlık çevirisi yok
AHMET UÇAR
- Cryptosporidium parvumun hücre kültüründe üretilmesi ve üremenin farklı yöntemlerle belirlenmesi
Production of Cryptosporidium parvum in cell-culture and detection of proliferation with different methods
SIRRI KAR
Doktora
Türkçe
2007
ParazitolojiAnkara ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE ÇAKMAK
- İstanbul ili köpeklerinde bulunan babesia türlerinin teşhisinde mikroskobik ve pcr-rlb bulgularının karşılaştırılması
Comparison of microscobic and pcr-rlb findings in detection of babesia species of dogs in istanbul
NURAN (SELEK) AYSUL
Doktora
Türkçe
2006
Parazitolojiİstanbul ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. TÜLİN KARAGENÇ
PROF.DR. AYŞEN GARGILI
- Cloning, production, purification, and characterization of granulocyte-colony stimulating factor (G-CSF)
Granülosit-koloni uyarıcı faktörü (G-CSF) klonlanması, üretimi, saflaştırma ve karakterizasyonu
CANSIN KIRMAÇOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY