Turunçgillerde kuraklık stresi sırasında bazı nac transkripsiyon faktörlerinin ekspresyonlarının belirlenmesi
Determination of the expression of some nac transcription factors from citrus during drought stress
- Tez No: 570783
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHTAP ŞAHİN ÇEVİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 126
Özet
Bitkiler yaşamları boyunca büyüme ve gelişmelerini kısıtlayıcı koşullarla karşı karşıya kalmaktadırlar. Büyüme ve gelişmeyi olumsuz olarak etkileyen ya da engelleyen bu koşullar stres olarak tanımlanmaktadır. Kuraklık stresi, dünyanın birçok yerinde tarımsal üretimi sınırlayan ciddi bir sorundur. Moleküler biyolojide kullanılan tekniklerin ilerlemesi ile bitkilerde kuraklık stresine tepkinin moleküler mekanizmaları araştırılmış ve kuraklık stresine adaptasyon ve toleransta anahtar rol oynayan genler belirlenmiştir. Bu genler arasında yer alan transkripsiyon faktör (TF)'leri büyük gen ailelerinden oluşmakta ve bitkilerde birçok süreçte etkili genlerin ifadelerinin düzenlenmesinde rol almaktadırlar. NAC TF'leri bu TF'ü ailelerinden birisini oluşturmakta olup kuraklıkla ilgili genlerin ifadelerinin düzenlenmesinde oldukça etkilidirler. Yapılan bu tez çalışması kapsamında, öncelikle diğer bitkilerde kuraklık stresinde önemli rolleri olduğu belirlenen NAC genleri arasından 5 tanesi (ANAC002/ATAF1, ANAC072/RD26, ANAC042/JUB1, ANAC053/NTL4 ve ANAC062/NTL6) seçilerek bu NAC genlerinin turunçgillerde yer alan orthologları belirlenmiştir. Belirlenen bu turunçgil NAC TF'lerinin ifadeleri 14 günlük kuraklık stresi sırasında turunç (Citrus aurantium), Carrizo (C. sinensis X P. trifoliata) ve Rangpur laym (Citrus x limonia) anaçlarında ve portakalda (C. sinensis) real-time RT-PCR yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. Yapılan gen ekspresyon analizler sonucunda ekspresyonu incelenen NAC TF'leri arasında ANAC002/ATAF1 ve ANAC072/RD26 TF'lerinin ekspresyonlarında kuraklığa dayanıklı Rangpur laymı anacında kuraklık stresi sırasında önemli düzeylerde artışlar gözlemlenirken turunç ve Carrizo anaçlarında ve portakalda önemli bir değişiklik gözlemlenmemiştir. Elde edilen sonuçlar ANAC002/ATAF1 ve ANAC072/RD26 TF genlerinin kuraklığa dayanıklı Rangpur laymı anacının kuraklık stresine dayanımında etkili olabileceğini ve diğer turunçgil türlerinde kuraklık toleransının artırılmasında kullanılabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Plants face conditions that restrict their growth and development throughout their lives. These conditions that adversely affect or limit growth and development of plants are defined as stress. Drought is a serious problem limiting the agricultural production in many parts of the world. With the advancement of techniques used in molecular biology, molecular mechanisms of drought response in plants has been explored and genes playing a key role in drought adaptation and tolerance have been identified. Among these genes, transcription factors (TFs) constitute an important group consisting of large gene families and they have an important role in regulation of expressions gene involved in various cellular processes. NAC TFs are one of these TF family playing a key role in the regulation of drought response in plants. In this study, first citrus orthologs of five important NAC genes playing a role in drought stress in the other plants (ANAC002/ATAF1, ANAC072/RD26, ANAC042/JUB1, ANAC053/NTL4 ve ANAC062/NTL6) were selected. Then the expressions of these NAC genes were analyzed in response to 14-day of drought stress in sour orange (Citrus aurantium), Carrizo (Citrus sinensis X Poncirus trifoliata), Rangpur lime (Citrus x limonia) and orange (Citrus sinensis) plants using real-time RT-PCR. Gene expression analyses revealed that the expression of the ANAC002/ATAF1 and ANAC072/RD26 genes were significantly increased in response to drought stress in drought resistant Rangpur lime rootstock. However, no significant change was observed in the expression of genes in response to drought stress in sour orange, Carrizo rootstocks and orange plants. As a result, it was concluded that the ANAC002/ATAF1 and ANAC072/RD26 TF genes may play important role in drought resistance of Rangpur lime rootstocks and could be used for improving drought tolerance in other Citrus species.
Benzer Tezler
- Üç turunçgil anacının kuraklık stresi sırasında antioksidan aktivitelerinde meydana gelen değişimlerin belirlenmesi
The determination of changes in antioxidant activities during the drought stress of three citrus
BÜŞRA ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP ŞAHİN ÇEVİK
- Kuraklık stresi sırasında uyarılan nac transkripsiyon faktörünün rangpur laym'dan izolasyonu, karakterizasyonu ve turunç anacına genetik transformasyonu
Isolation, characterization of nac transcription factor induced, during drought stress from rangpur lime and geneti̇c transformation to citrus aurantium rootsrock
EMİNE DOĞUŞ SİVRİ
Doktora
Türkçe
2019
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP ŞAHİN ÇEVİK
- Kuraklık stresi sırasında mitojen-aktivated protein kinaz (MAPK)'ların ekspresyonlarının turunçgil anaçlarında, turunç, carrizo ve troyer'de belirlenmesi
Determination of expression of mitogen-activated protein kinases (MAPKS) during drought stress in citrus rootstocks, sourorange, carrizo and troyer
MERVE GÜNEY
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHTAP ŞAHİN ÇEVİK
- Bazı turunçgil anaçlarında kuraklık ile ilişkili bazı hareketli genetik elementlerin (Transpozon) aktivitelerinin karşılaştırılması
Comparison of the activities of some mobile genetic elements (Transposon) associated with drought in some citrus rootstocks
MUHAMMET MUSTAFA SEZER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YILDIZ KAÇAR
- Bazı abiyotik streslerin prolinle desteklenen turunçgil anacı çöğürleri üzerine morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal etkileri
Morphological, physiological and biochemical effects of some abiotic stresses on proline-supported citrus rootstocks
ZEYNEP ÜNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İLHAMİ TOZLU