Bazı turunçgil anaçlarında kuraklık ile ilişkili bazı hareketli genetik elementlerin (Transpozon) aktivitelerinin karşılaştırılması
Comparison of the activities of some mobile genetic elements (Transposon) associated with drought in some citrus rootstocks
- Tez No: 687159
- Danışmanlar: PROF. DR. YILDIZ KAÇAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
Turunçgiller, Rutaceae familyasının ticari olarak önemli bir cinsidir ve Dünyada yaygın olarak yetiştirilen meyve grubudur. Dünyada tarım alanlarına etki eden stres faktörleri göz önüne alındığında kuraklık stresi etki ettiği alan bakımından %26'lık payla en büyük orana sahiptir. Bu durumda kuraklığa dayanıklı genotiplerin geliştirilmesi oldukça önem kazanmaktadır. Transpozonlarca zengin turunçgil bitkilerinde transpozon çalışmaları önem kazanmıştır. Transpozonların, bitki genomlarının ortak bileşenleri olduğunu, transkripsiyon ve entegresyon seviyelerinde işlevsellik gösterdiklerini, transpozonların miktar ve transpoze etme yetenekleri onları potansiyel markör haline getirmiştir. Ayrıca transpozonlar zengin bir polimorfizm kaynağı olarak da hizmet ederler. Bu çalışmada; ilk defa Cs18SrR, Cs_Pol-1, CsCLCoy_1, CsCc1-8, Retro_Cc1_32, Sire_Cc1, Sire_Cc1_74 ve Sire_Cc1_83 transpozonlar, kuraklık stresi altında, turunçgil anaçları olarak kullanılan Tuzcu 31-31 turuncu, Kleopatra mandarin, Makrofilla ve Kaba limon turunçgil anaçlarında çalışılmıştır. İncelenen genotiplerin kök ve yaprak dokularından örnek alınmıştır. Kuraklık stresi uygulanmış 4 farklı anaç genotipinden gen fonksiyonu ve genom üzerinde önemli etkileri bulunan bazı transpozon genlerinin ifade seviyeleri eşzamanlı PCR ile ölçülmüştür. Sonuç olarak, bu tez çalışması ile kuraklık stresi altındaki bazı turunçgillerin geliştirdiği moleküler düzeyde değişimleri ile ilgili literatüre yeni bilgiler kazandırılmıştır. Elde edilen sonuçlarla, genotipler arasında kullanılan retrotranspozonların gen ekspresyon seviyeleri tartışılmıştır.
Özet (Çeviri)
Citrus is a commercially important genus of the Rutaceae family and is a widely grown fruit group in the world. Considering the agricultural land used in the world, drought stress has the highest rate of 26% among the stress factors. In this case, it is very important to develop drought-resistant genotypes. Transposon studies have gained importance in citrus plants rich in transposons. Transposons are common components of plant genomes, functioning at transcription and integration levels, and their quantification and transposing abilities make them potential markers. Transposons also serve as a rich source of polymorphism. In this study, Cs18SrR, Cs_Pol-1, CsCLCoy_1, CsCc1-8, Retro_Cc1_32, Sire_Cc1, Sire_Cc1_74 and Sire_Cc1_83 transposons were studied for the first time under drought stress, Tuzcu 31-31, Cleopatra mandarin, Macrophylla and Rough Limon used as citrus rootstocks plants were studied. Samples were taken from the root and leaf tissues of the examined genotypes. Expression levels of some transposon genes, which have important effects on gene function and genome, were measured by real-time PCR in different 4 rootstock genotypes that were subjected to drought stress. As a result, with this thesis study, new information has been brought to the literature about the changes at the molecular level developed by some citrus fruits under drought stress. With the results obtained, the gene expression levels of the retrotransposons used between genotypes are discussed.
Benzer Tezler
- Turunçgillerde kuraklık stresi sırasında bazı nac transkripsiyon faktörlerinin ekspresyonlarının belirlenmesi
Determination of the expression of some nac transcription factors from citrus during drought stress
BETÜL GÖNÜLKIRMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP ŞAHİN ÇEVİK
- Kuraklık stresinin değişik turunçgil anaçlarında bazı fotosentetik parametreler ve bitki besin maddeleri konsantrasyonları üzerine etkileri
Effects of drought stress on some photosyntetic parameters and plant nutrition concentrations in different citrus rootstocks
SÜHA ÇERÇİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ZiraatÇukurova ÜniversitesiZiraat Bölümü
YRD. DOÇ. DR. BİLGE YILMAZ
DOÇ. DR. SELİM EKER
- Bazı turunçgil anaçlarında farklı eksplant kaynağı ve besi ortamlarının somatik embriyogenesis üzerine etkileri
The efficiency of different culture media and explant type of some citrus rootstock on somatic embryogenesis
BELGİN BİÇEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YILDIZ AKA KAÇAR
- Bazı turunçgil anaçlarında kökten bitki rejenerasyonunun optimizasyonu
Optimization of plant regeneration from root explants at some citrus rootstocks
ÜLKÜ İNCEOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Bilim ve TeknolojiÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YILDIZ AKA KAÇAR
- Bazı turunçgil anaçlarında mikoriza ile Phytophthora citrophthora etkileşimleri
Interactions with mycoriza and Phytophthora citrophthora in some citrus rootstocks
GÖKHAN KARADELİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İLHAMİ TOZLU