Geri Dön

Tonsillofarenjitli hastalardan izole edilen Streptococcus pyogenes suşlarının tanılanması, antibiyotik direnç profilleri ile emm ve ekzotoksin genlerinin tespiti

Identification of Streptococcus pyogenes strains isolated from patients with tonsillopharyngitis, determination of their emm and exotoxin genes with antibiotic resistance profiles

PDF İndir

  1. Tez No: 602460
  2. Yazar: MEHZAT ALTUN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BİNNUR MERİÇLİ YAPICI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 179

Özet

Tonsillofarenjitin en sık bakteriyel etkeni A grubu streptokoklar olup; C, G ve F grubu Beta Hemolitik Streptokoklar (BHS) nadiren görülmektedir. Çalışmamızda tonsillofarenjitli hastaların boğaz kültürlerinden izole edilen BHS'lerin grup dağılımları ve antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi, moleküler çalışmalar ile A Grubu Streptokok türlerinin, emm ve süperantijen genlerinin tespiti, mevcut aşıların emm tiplerini kapsama oranının belirlenmesi amaçlanmıştır.200 tonsillofarenjit ön tanılı hastadan alınan boğaz kültürlerinin % 5 koyun kanlı agara ekimi ile BHS'lerin izolasyonu, 16S rRNA dizi analizine dayalı olarak tanılanması, Gram boyama, katalaz, L-Pirolidonil β-Naftilamid, basitrasin-trimetoprim sülfametoksazol antibiyotik duyarlılık testleri ve lateks agglütinasyon testi ile karakterizasyonu belirlenmiştir. BHS'lerin antibiyotik duyarlılıkları, Kirby Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve sonrasında yapılan dizi analizi ile AGS'lerin tür tanımlaması 16S rRNA, emm ve spe genlerinin tespiti gerçekleştirilmiştir.15 adet AGS izolatının 16S rRNA dizi analiz sonuçlarına göre S. pyogenes türüne ait olduğu bulunmuştur. emm tiplendirmesi yapılan 13 S. pyogenes izolatında emm89 (% 33.3), emm44 (% 20), emm6 (% 13.3), emm84, emm1 ve emm18.1 (% 6.7) olmak üzere 6 çeşit emm tipi bulunmuştur. S. pyogenes suşlarının 26 valanlı aşıyı kapsama oranı % 61.5, 30 valanlı aşıyı kapsama oranı % 84.6 olarak saptanmıştır. Çalışmamızda en yaygın speB (% 86.7) bulunmuştur. Çanakkale ilinde, S. pyogenes türünün emm tiplerinin belirlenmesi neticesinde 30 valanlı aşının ülkemizde kullanılma potansiyelinin dikkate alınması gerektiği ve yararlı olabileceği kanaatine varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Group A streptococci is the most common bacterial agent of tonsillopharyngitis, Group C, G and F Beta Hemolytic Streptococci (BHS) are rarely seen. The objective of our study is to determine group distributions and antibiotic resistance profiles of BHSs taken from throat cultures of patients with tonsillopharyngitis, molecular studies and determination of Group A Streptococcus (GAS) species, emm genes, superantigen genes and the rate of coverage of available vaccines.Isolation of BHSs with 5 % sheep blood agar sowing from throat cultures taken from 200 patients whom prediagnosis are tonsillopharyngitis, identification based on 16S rRNA sequence analysis, characterization determined with Gram staining, catalase, L-Pyrrolidonyl β-Naphthylamide, bacitracin-trimethoprim sulfamethoxazole antibiotic susceptibility and latex agglutination tests. Antibiotic susceptibilities of BHSs were determined by Kirby Bauer disc diffusion method. Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequence analysis of the species identification of GASs 16S rRNA, emm and spe genes were determined.15 GAS isolates were found to belong to S. pyogenes species according to 16S rRNA sequence analysis results. By emm typing method emm89 (33.3 %), emm44 (20 %), emm6 (13.3 %), emm84, emm1 and emm18.1 (6.7 %) were found in 13 S. pyogenes isolates. The coverage rate of S. pyogenes strains for 26-valent vaccine was 61.5 % and for the 30-valent vaccine was 84.6 %. In our study, the most common exotoxin was speB (86.7 %). Determination of emm types of S. pyogenes species in Canakkale province, it was concluded that the potential of 30-valent vaccine should be considered in our country may be beneficial.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    230498

    İstanbul'da 2007-2009 döneminde çocuk hastaların boğaz kültürlerinde izole edilen A grubu beta hemolitik streptokokların M proteini (emm) gen tiplendirilmesi

    M protein (emm) gene typing of group A beta-hemolytic streptococci isolated from pharyngeal cultures of children with acute tonsillopharyngitis in istanbul

    AYÇA ERKİN ÇAKMAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİN ÜNÜVAR

  2. Tez No

    70994

    Akut tonsillofarenjitli hastalardan izole edilen beta hemolitik streptokokların tiplendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    İBRAHİM ERAYMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSelçuk Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET BİTİRGEN

  3. Tez No

    108098

    Tonsillofarenjitli çocukların boğaz kültürlerinden izole edilen beta hemolitik streptokokların gruplandırılması, antibiyotik duyarlılıklarının ve penisilin toleransının araştırılması

    Investigation of group determination, antibiotic susceptibility and penicilin tolerance in beta hemolytic streptococci isolated from children with tonsillopharyngitis

    ERGİN ÇİFTÇİ

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAnkara Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKER DOĞRU

  4. Tez No

    484970

    İnvaziv A grubu streptokok enfeksiyonlarından sorumlu suşlarda emm ve süperantijen genotiplerinin dağılımı, klinik korelasyonu ve filogenetik ilişkilerinin tespiti

    Distribution of emm and superantigen genotypes in responsible strains for invasive group A streptococcus infections, clinical correlation and determination of phylogenetic relationships

    SUNA KIZILYILDIRIM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  5. Tez No

    891387

    Akut romatizmal ateş tanısı ile izlenen çocukların sistemik velaboratuvar bulgularının retrospektif olarakdeğerlendirilmesi: On yıllık tek tez merkez deneyimi

    Retrospective evaluation of systemic and laboratory findings in children with a diagnosis of acute rheumatic fever: A ten-year single-center experience

    HÜRİYA ISLAMOVA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HELEN BORNAUN

Geri Dön