Domates (solanum lycopersicum l.)'te virüs enfeksiyonu ve kuraklık stresi sırasında mirna'lar ve hedefledikleri myb transkripsiyon faktörlerinin ekspresyonlarının belirlenmesi
Determination of the expression of myb transcription factors targeted by mirnas during virus infection and drought stress in tomato (solanum lycopersicum l.)
- Tez No: 603074
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHTAP ŞAHİN ÇEVİK, PROF. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 116
Özet
Domates (Solanum lycopersicum L.), ülkemizde ve dünyada ekonomik değere sahip önemli tarımsal ürünlerden biridir. Ancak, domates üretiminde verimi ve kaliteyi olumsuz yönde etkileyen pek çok abiyotik ve biyotik stres faktörleri bulunmaktadır. Kuraklık stresi, domateste büyüme ve gelişmeyi sınırlandıran ciddi bir sorundur. Ayrıca, domates lekeli solgunluk virüsü (Tomato spotted wilt virus, TSWV) domates üretim alanlarında sıkça karşılaşılan ve yıkıcı etkilere neden olan virüstür. Son yıllarda, bitkilerde abiyotik ve biyotik streslere yanıt yollarında yer alan stresin algısı, sinyal iletimi, düzenleyici elementler ve moleküler mekanizmaları içeren birkaç moleküler ağ tanımlanmıştır. Çeşitli bitki türlerinde tekli stres etmenleri üzerinde ortaya çıkarılan bu mekanizmalar, doğada çoklu stresler ile karşı karşıya kalan bitkilerin yanıt mekanizmalarının açıklanmasında yetersiz kalmaktadır. Transkripsiyon faktörleri (TF'ler) ve mikroRNA (miRNA)'lar bitkilerin çevresel streslere karşı yanıt mekanizmalarının düzenlenmesinde kilit rol oynamaktadırlar. Bu yapılar, büyüme ve gelişme, çevresel streslere karşı adaptasyon ve tolarans gibi birçok süreçte yer alan genlerin ekspresyonundan ve/veya baskılanmasından sorumludurlar. Yapılan bu tez çalışması kapsamında, SlMYB44, SlMYB73, SlMYB96, SlMYB101 ve Sly-miR159 genlerinin TSWV'ye karşı duyarlı Alsancak ve TSWV'ye karşı dayanıklı Sedir domates çeşitlerinde TSWV enfeksiyonu, kuraklık stresi ve TSWV/kuraklık uygulaması sırasındaki ekspresyon seviyeleri belirlenmiştir. Bu amaçla, domates bitkilerinden TSWV enfeksiyonun 7., 14. ve 21. günlerde, kuraklık stresinin ve TSWV/kuraklık uygulamasının 0., 3., 5. ve 7. günlerde yaprak örnekleri alınmıştır. Gen ekspresyonu düzeyindeki değişimler 2-∆∆CT yöntemi kullanılarak real-time RT-PCR ile belirlenmiştir. Yapılan analizler sonucunda domateste hem tekli hem de çoklu stres uygulamaları sırasında SlMYB44, SlMYB73, SlMYB96, SlMYB101 ve Sly-miR159 genlerin stres çeşidine göre farklı düzeylerde ifade edildikleri belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the important agricultural products of economic value in our country and in the world. However, there are many abiotic and biotic stress factors that negatively affect yield and quality in tomato production. Drought stress is a serious problem that limits growth and development in tomatoes. In addition, Tomato spotted wilt virus (TSWV) is a virus frequently encountered in tomato production areas and causes destructive effects. In recent years, several molecular networks have been identified, including perception of stress, signal transduction, regulatory elements and molecular mechanisms involved in the response pathways to abiotic and biotic stresses in plants. These mechanisms, which have been revealed on single stress factors in various plant species, are insufficient to explain the response mechanisms of plants facing multiple stresses in nature. Transcription factors (TFs) and microRNAs (miRNAs) play a key role in regulating the response mechanisms of plants to environmental stresses. These constructs are responsible for the expression and / or repression of genes involved in many processes such as growth and development, adaptation to environmental stresses and tolerance. This thesis study, TSWV infection, drought stress and and TSWV/drought application of TSMV-sensitive Alsancak and TSWV-resistant Sedir tomato cultivars of SlMYB44, SlMYB73, SlMYB96, SlMYB101 and Sly-miR159 genes expression levels were determined. For this purpose, leaf samples were taken from tomato plants on the 7., 14. and 21. days of TSWV infection and on the 0., 3., 5. and 7. days of drought stress and TSWV/drought application. Changes in gene expression levels were determined by real-time RT-PCR using 2-∆∆CT method. As a result of the analyzes, it was determined that SlMYB44, SlMYB73, SlMYB96, SlMYB101 and Sly-miR159 genes were expressed at different levels according to the stress type during both single and multiple stress applications in tomato.
Benzer Tezler
- Domates'te Cucumber mosaic virus (CMV)'un biyolojik ve moleküler karakterizasyonu
Biological and molecular characterization of Cucumber mosaic virus (CMV) in tomato
SACHIN SHARMA
- Gen düzenleme teknolojisi (CRISPR) ile elde edilen domates genotiplerinin canavar otuna (Phelipanche spp.) karşı dayanıklılık ve gen ekspresyon seviyelerinin belirlenmesi
Determination of the resistance and gene expression levels of tomato genotypes obtained by CRISPR/CAS9 technology against broomrape (Phelipanche spp.)
ESRA ÇİĞNİTAŞ
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YASİN EMRE KİTİŞ
- Diyarbakır domates alanlarında zararlı yeşilkurt [Helicoverpa armigera (Hübner) (Lep.; Noctuidae)]'un popülasyon gelişimi, parazitoit ve predatörlerinin belirlenmesi
Determination of population development, parasitoid and predators of harmful tomato fruit borer [Helicoverpa armigera (Hübner) (Lep.; Noctuidae)] in Diyarbakir tomato fields
ÖZLEM BEKTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDAL SERTKAYA
- Domateste (Solanum lycopersicum L.) potasyum, salisilik asit ve humik asit uygulamalarının Fusarium solgunluğuna (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici), bitki gelişimi ve besin elementi alımına etkileri
Effects of potassium, salicylic acid and humic acid applications on Fusarium wilt (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici), plant growth and nutrient uptakes in tomato (Solanum lycopersicum l.)
EFDAL GÜLSER
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyomühendislikYüzüncü Yıl ÜniversitesiToprak Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMRA DEMİR
PROF. DR. ŞEFİK TÜFENKÇİ
- Investigating the role of hydrogen sulfide (H2S) to improve drought tolerance at biochemical and gene expression levels in tomato plant (Solanum lycopersicum L.)
Hidrojen sülfür'ün (H2S) kuraklık toleransı sağlamadaki etkilernin biyokimyasalve gen ifadesi düzeyinde domates (Solanum lycopersicum L.) bitkisinde araştırılması
MUHAMMED ANDİÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaNecmettin Erbakan ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA YÖNTEM
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATİH ERCİ