An interaction matrix of BTB domain-containing transcription factors
BTB domaın içeren transkripsiyon faktörlerinin etkileşim matriksi
- Tez No: 608240
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET BATU ERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoloji, Genetik, Biochemistry, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 125
Özet
BTB protein bölgesi, ökaryotlarda bulunan bir proten-protein etkileşim birimidir. Geniş bir etkileşim alanına sahip, ayırt edici bir üç boyutlu yapıdadır. Dıştaki amino asitleri çok çeşitlilik göstermekle birlikte; dimerizasyon, oligomerleşme ve NCOR SMRT gibi eşbaskılayıcılarla etkileşim işlevlerine sahip olabilir. BTB sahibi transkripsiyon faktörleri çok çeşitlidir ve bağışıklık sistemi gelişiminden hücre döngüsü kontrolüne kadar bir çok süreçte rol alırlar. Bu işlevleri tam olarak anlamak için, söz konusu proteinlerin etkileşim ağlarının gösterilmesi gerekmektedir. Bu çalışmada, çeşitli BTB bölgesi içeren transkripsiyon faktörleri ve onların etkileşim ağlarını, in vivo ve in vitro ortamlarda yüzey plazmon rezonansı (SPR) ve flörosan ikili-hibriti (F2H) yöntemlerini içeren, özel ve sistematik deneyler geliştirmek amaçlanmıştır. Bu doğrultuda BTB protein bölgelerinin kendi içlerinde ve diğer farklı BTB bölgeleriyle gerçekleştirdikleri dimerizasyon matrisini oluşturduk.
Özet (Çeviri)
The BTB domain is a protein-protein interaction unit found in eukaryotes. It forms a distinct multimeric structure with a large interaction surface. The exposed residues of each monomer are highly variable and can allow dimerization, oligomerization, and interactions with several other proteins such as NCOR and SMRT corepressors. BTB-containing transcription factors are diverse and control various physiological processes ranging from immune system development to cell cycle regulation. To understand the structural basis of these functions, we assessed the interaction networks of these proteins. In this study, we developed specific and systematic assays to screen the interactions between various BTB domain-containing transcription factors and their interaction partners in vitro and in vivo, using surface plasmon resonance (SPR) and fluorescent two-hybrid (F2H) assays. We constructed a homo- and hetero-dimerization matrix of several BTB domains of interest.
Benzer Tezler
- Mekansal değerlendirmede algısal yargılara dayalı bir model
A Conceptual model relating to perceptual judgements in evaluation of spatial effects
SEMRA AYDINLI
- Değişimin sürekliliğinde zamansal kırılma noktaları değişen insan ve kentlerin karşılıklı etkileşimi
Temporal breaking points in continuty of change interaction of changing human and city
S. BANU BAŞESKİCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiBina Bilgisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA TURGUT
- Sondaj çamuru uygulamaları için kil-polimer etkileşimlerinin belirlenmesi
Determination of the clay-polymer interaction for drilling mud applications
EREN KARGI
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVİM İŞÇİ TURUTOĞLU
- Bale üzerine mesleki kariyer planlamada ebeveynlerin toplumsal, ekonomik, kültürel sermayelerinin etkisi
The effect of parents' social, economic, cultural capitals on career planning on ballet
BURCU GEDİKLİ
Doktora
Türkçe
2024
Bale ve DansHacettepe ÜniversitesiSosyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELİHA DEMET ULUSOY
- Reconstruction of urban space through the dialectics of global and local: evolution of urban space in Sultanahmet-İstanbul
Küresel ve yerel arasındaki diyalektik içinde kentsel mekanın yeniden kurulması: İstanbul Sultanahme'de kentsel mekanın evrimi
BERİN F. GÜR
Doktora
İngilizce
1999
Jeoloji MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖNÜL EVYAPAN