An interaction matrix of BTB domain-containing transcription factors
BTB domaın içeren transkripsiyon faktörlerinin etkileşim matriksi
- Tez No: 608240
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET BATU ERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoloji, Genetik, Biochemistry, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
BTB protein bölgesi, ökaryotlarda bulunan bir proten-protein etkileşim birimidir. Geniş bir etkileşim alanına sahip, ayırt edici bir üç boyutlu yapıdadır. Dıştaki amino asitleri çok çeşitlilik göstermekle birlikte; dimerizasyon, oligomerleşme ve NCOR SMRT gibi eşbaskılayıcılarla etkileşim işlevlerine sahip olabilir. BTB sahibi transkripsiyon faktörleri çok çeşitlidir ve bağışıklık sistemi gelişiminden hücre döngüsü kontrolüne kadar bir çok süreçte rol alırlar. Bu işlevleri tam olarak anlamak için, söz konusu proteinlerin etkileşim ağlarının gösterilmesi gerekmektedir. Bu çalışmada, çeşitli BTB bölgesi içeren transkripsiyon faktörleri ve onların etkileşim ağlarını, in vivo ve in vitro ortamlarda yüzey plazmon rezonansı (SPR) ve flörosan ikili-hibriti (F2H) yöntemlerini içeren, özel ve sistematik deneyler geliştirmek amaçlanmıştır. Bu doğrultuda BTB protein bölgelerinin kendi içlerinde ve diğer farklı BTB bölgeleriyle gerçekleştirdikleri dimerizasyon matrisini oluşturduk.
Özet (Çeviri)
The BTB domain is a protein-protein interaction unit found in eukaryotes. It forms a distinct multimeric structure with a large interaction surface. The exposed residues of each monomer are highly variable and can allow dimerization, oligomerization, and interactions with several other proteins such as NCOR and SMRT corepressors. BTB-containing transcription factors are diverse and control various physiological processes ranging from immune system development to cell cycle regulation. To understand the structural basis of these functions, we assessed the interaction networks of these proteins. In this study, we developed specific and systematic assays to screen the interactions between various BTB domain-containing transcription factors and their interaction partners in vitro and in vivo, using surface plasmon resonance (SPR) and fluorescent two-hybrid (F2H) assays. We constructed a homo- and hetero-dimerization matrix of several BTB domains of interest.
Benzer Tezler
- Primer diffüz büyük b hücreli lenfoma olgularında PD-1/ PD-l1 ekspresyonunun, tümör mikroçevresinin ve prognostik özelliklerinin değerlendirilmesi
Evaluation of PD-1/ PD-l1 expression, tumor microenvironment and prognostic properties in diffuse large b cell lymphoma
GÜLDİDAR BASMACI
- Duygu-biliş etkileşim ölçeği'nin geliştirilmesi ve duygu bilişin üniversite öğrencilerinde cinsiyet, yaş ve bölüm açısından incelenmesi
Construction of an emotion cognition interaction scale and study its administration results in gender, age, and the department of the university students attend
AYŞE ZEYNEP IŞIK
- Gıda matrisi ve mikroplastik etkileşiminin incelenmesi
Investigation of food matrix and microplastic interaction
NAZIM SERGEN MISIRLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FAHRİYE CEYDA DUDAK ŞEKER
- 5-kloro-urasil molekülünün montmorillonit tarafından soğurulması ve kil matrisi ile etkileşmesinin kırmızı-altı spektrokopisi ile incelenmesi
IR spectroscopic invesitigation of adsorption of 5-chlorouracil onto montmorillonie and its interaction with the clay matrix
ROZA GÜL MİLLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Kültür ÜniversitesiFizik Bölümü
PROF. DR. SEVİM AKYÜZ
- Konut alanlarında morfolojik yapı, mekânsal bütünleşme ve sosyal etkileşimin ölçekler arası yaklaşımla değerlendirilmesi: Muğla-Menteşe örneği
Evaluation of morphological structure, spatial integration, and social interaction in residential areas using an inter-scale approach: the case of Mentese, Mugla
NUR SELİN SERDAROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiKentsel Tasarım Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İSMAİL EREN KÜRKÇÜOĞLU