İshal şikayetli hastalarda norovirusun araştirilmasi
Investigation of norovirus in patients with diarrhea complaints
- Tez No: 615113
- Danışmanlar: PROF. DR. SEVİN KIRDAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Akut gastroenterit, Antijen, ELISA, Norovirus, PZR, Acut Gastroenteritis, Antigene, ELISA, Norovirus, PCR
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Akut gastroenteritler tüm dünyada yaygın olarak görülen enfeksiyon hastalıkları arasında yer almakta ve ciddi bir halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır. Adnan Menderes Üniversitesi Uygulama ve Araştırma Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Laboratuvarına gastroenterit şüphesi ile gönderilen dışkı örneklerinde Norovirus varlığının ELISA ve real-time PZR yöntemleri ile araştırılması amaçlanmıştır. Eylül 2017-Mayıs 2019 tarihleri arasında, gastroenterit şüphesi ile Hastanemiz Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Laboratuvarına başvuran 92 hastanın dışkı örneklerinde, ticari 3 Üçüncü Jenerasyon Ridascreen Norovirus ELISA (RIDASCREEN&Norovirus 3rdGeneration C1401) ve real-time RT-PZR (BosphoreNorovirus Detection Kit v1) kiti kullanılarak Norovirus varlığı araştırılmıştır. Genotiplendirme Genogrup I ve II'yi belirleyebilen real-time RT-PZR (Bosphore Norovirus Detection Kit v1) kiti ile gerçekleştirilmiştir. Çalışmamızda yer alan örneklerin 55'i (%59,8) erkek, 37'si (%40,2) ise kadın hastalardan elde edilmiştir. Gastroenteritli hastaların yaş medianı 2 (25-75 persantil) olup hastaların yaş aralığı 0-83 yıl aralığında dağılım göstermekteydi. Çalışmamızda ELISA ile 5 örnek %5,4 (5/92) Norovirus pozitif, 87 örnek %94,6 (87/92) Norovirus negatif bulunmuştur. PZR ile 12 örnek %13 (12/92) Norovirus pozitif, 80 örnek %87 (80/92) ise Norovirus negatif olarak saptanmıştır. ELISA ve PZR ile Norovirus pozitif belirlenen hastaların tümü erkek cinsinde olup Norovirus pozitifliği ile cinsiyet arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır (p=0.080, p=0.114). Yaş grupları ile ELISA ve PZR pozitifliği arasında ilişki için istatistiksel analiz yaş gruplarının homojen dağılım göstermemesi nedeniyle yapılamamıştır. Norovirus pozitif bulunan örneklerin tümü NoV genotip II olarak sınıflandırıldı. Çalışmaya dahil edilen hastaların dışkı örneklerinde ELISA ile %5,4, real-time RT-PZR ile %13 oranlarında Norovirus pozitifliği belirlenmiştir. Norovirus pozitif bulunan örneklerin tümü NoV genotip II olarak saptanmıştır. Norovirus pozitifliği ile yaş ve cinsiyet verileri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmamıştır. Bu çalışma ile ilimizde ilk defa Norovirus epidemiyolojisi ortaya konmaya çalışılmıştır. Elde edilen veriler, Norovirus enfeksiyonlarının epidemiyolojisinin daha iyi anlaşılmasını sağlayabilecektir
Özet (Çeviri)
Acute gastroenteritis is one of the most common infectious diseases worldwide and constitutes a serious public health problem. The aim of this study was to investigate the presence of Norovirus in stool samples sent to Adnan Menderes University Department of Medical Microbiology Laboratory with suspicion of gastroenteritis by ELISA and real-time PCR methods. Between September 2017 and May 2019, the presence of norovirus was investigated in fecal samples of 92 patients admitted to the Laboratory of Medical Microbiology with suspicion of gastroenteritis using commercial Third Generation Ridascreen Norovirus ELISA (RIDASCREEN & Norovirus 3rdGeneration C1401) and real-time RT-PCR (Bosphore Norovirus Detection Kit v1) kits. In our study, 55 (59,8%) of the samples were obtained from male patients and 37 (40,2%) from female patients. The median age of the patients with gastroenteritis was 2 (25-75 percentile) and the age range of the patients was 0-83 years. In our study, 5 samples were found to be 5,4% (5/92) norovirus positive and 87 samples were found to be 94,6% (87/92) norovirus negative by ELISA. By PCR, 12 samples were found to be 13% (12/92) norovirus positive and 80 samples were 87% (80/92) norovirus negative. Norovirus positive patients with ELISA and PCR were all male and there was no statistically significant difference between norovirus positivity and gender (p = 0.080, p = 0.114). Statistical analysis of the relationship between age groups and ELISA and PCR positivity could not be done because age groups did not show homogeneous distribution. All samples found to be norovirus positive were classified as NoV genotype II. Norovirus positivity was determined by 5,4% in ELISA and 13% by real-time RT-PCR in stool samples of the patients included in the study. There was no statistically significant relationship between norovirus positivity and age and sex data.
Benzer Tezler
- Antibiyotiğe bağlı ishallerde Clostridium difficile'nin rolünün araştırılması
The Investigation of the role clostridium difficile in antibiotic-associated diarrhea
BÜLENT YERGÖK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET KIYAN
- Determination of Campylobacter ssp. isolates from stool samples and their antibiotic susceptibility
Dışkı örneklerinden Campylobacter spp. izolatlarının elde edilmesi ve bu izolatların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
HUSSEIN ALI KAMIL
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ
DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR SAĞIROĞLU
- İmmünsupresif hastalarda cryptosporıdıum SPP. sıklığının çeşitli tanı yöntemleri ile araştırılması
Investigation of the frequency of cryptosporidium SPP in immunsupressive patients by various diagnostic methods
DUYGU BEDER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA ESENKAYA TAŞBENT
- Gastroenteritli hastalarda, hamburger, süt ve sığır dışkısında escherichia coli O157: H7 serotipinin araştırılması
The Investigation of escherichia coli O157: H7 serotype in the patients with gastroenteritis and in the samples of hamburger, milk and cattle feces
HALE ŞENGÜL
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
Gastroenterolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA SAMASTI
- Kemoterapi alan malign solid tümörlü hastalarda cryptosporidium spp'nin mikroskobik ve serolojik yöntemlerle araştırılması
Investigation of cryptosporidium spp. by microscopic and serological methods in malignant solid tumor patients receiving chemotherapy
MEHMET KARABEY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Mikrobiyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEGÜL AKSOY GÖKMEN