Geri Dön

İnflamatuvar bağırsak hastalığı ve mikrobiyota ilişkisi

The relationship of inflammatory bowel disease and microbiota

PDF İndir

  1. Tez No: 623707
  2. Yazar: TUĞBA AVAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BELMA DURUPINAR
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 190

Özet

İnflamatuvar bağırsak hastalıkları Ülseratif kolit ve Crohn hastalığı olmak üzere iki ana gruba ayrılan, kronik seyirli, remisyon ve alevlenmelerle seyreden hastalık grubudur. Bu hastalığın patogenezinde, bireyin genetik yatkınlığı, çevresel faktörler, intestinal mikrobiyota ve immün yanıtların hepsi iç içe geçmiş durumdadır. Bu çalışmanın amacı, inflamatuvar bağırsak hastalığı olan bireylerde ve sağlıklı kontrollerde bağırsak mikrobiyotasının önemli bakteri türleri olan Akkermansia mucinophilia, Bacteroides fragilis, Bifidobacterium spp, Eschericha coli, Faecalibacterium prausnitzii, Fusobacterium nucleatum, Lactobacillus spp ve Prevotella intermedia bakımından kantitatif karşılaştırmasını yapmak ve mikrobiyota değişiminin hastalık etiyopatogenezi üzerine etkisini belirlemektir. Çalışmaya, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Gastroenteroloji kliniğine başvuran 22 hasta ve 22 sağılıklı kontrol olmak üzere toplam 44 bireyden alınan gaita örneği dahil edilmiştir. Gaitadan DNA izolasyon işlemi için, özel gaitadan ekstraksiyon kiti (QIAmp DNA Stool Mini Kit, QIAgen, Almanya) kullanıldı. Hedef bölge amplifikasyonu için çalışmada yer alan bakterilere spesifik primerler kullanıldı. Ekstraksiyon işlemi sonrası tüm bakterilerin gerçek zamanlı PZR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) yöntemi ile kantitasyon işlemi CFX96™ Real-Time PCR System cihazında (BIO-RAD, ABD) kullanılarak gerçekleştirildi. Kantitasyon sonucunda hasta grubunda Bifidobacterium spp (p=0,046), B. fragilis (p=0,033), A. Mucinophilia (p=0,009) ve F. prausnitzii (p˂0,001) bakterileri için istatistiksel olarak anlamlı düşüş gözlendi. F. nucleatum (p=0,598), P. intermedia (p=0,551), E. coli (p=0,652) ve Lactobacillus spp (p=0,888) bakterileri için istatistiksel olarak anlamlı fark görülmedi. Bu çalışmadan elde edilen sonuçlar, mikrobiyotanın inflamatuvar bağırsak hastalığı üzerindeki potansiyel rolünü destekler nitelikte olup, bir sonraki çalışmalar için kaynak niteliğindedir.

Özet (Çeviri)

Inflammatory bowel diseases which are divided in two main groups as Ulcerative colitis and Crohn's disease are in a group of diseases that continue with chronic progression, remission and exacerbations. In the pathogenesis of this disease, the genetic predisposition of the individual, environmental factors, intestinal microbiota and immune responses are all intertwined. The aim of this study is to make a quantitative comparison in terms of the important bacterial species of intestinal microbiota like Akkermansia mucinophilia, Bacteroides fragilis, Bifidobacterium spp, Eschericha coli, Faecalibacterium prausnitzii, Fusobacterium nucleatum, Lactobacillus spp. and Prevotella intermedia in individuals with inflammatory bowel disease and in healthy controls and to determine the effect on the disease etiopathogenesis of microbiota exchange. Fecal specimens from 22 patients and 22 healthy controls totally 44 individuals applying to the Gastroenterology Department of Medicine Faculty in Ondokuz Mayıs University were included in the study. For the stool DNA isolation process, a special stool extraction kit (QIAmp DNA Stool Mini Kit, QIAgen, Germany) was used. Bacteria-specific primers in the study were used for target site amplification. After extraction, quantitation process was implemented by real-time PCR (Polymerase Chain Reaction) method of all bacteria and using CFX96 ™ Real-Time PCR System device (BIO-RAD, USA). Statistically significant decline was observed in the quantitation result of the patient group for the bacteria Bifidobacterium spp. (p = 0.046), B. fragilis (p = 0.033), A. mucinophilia (p = 0.009) and F. prausnitzii (p˂0.001). There was no statistically significant difference between F. nucleatum (p = 0.598), P. intermedia (p = 0.551), E. coli (p = 0.652) and Lactobacillus spp. (p = 0.888). The results obtained from this study support the potential role of microbiota on inflammatory bowel disease and serve as a source for further studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    818331

    Türk inflamatuvar bağırsak hastalarının bağırsak mikrobiyomlarının sağlıklı bireylerle genomik düzeyde karşılaştırılması

    Comparison of gut microbiota between Turkish patients with inflammatory bowel disease and healthy individuals at genomic level

    MUNKHTSETSEG BANZRAGCH YAĞCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Biyoteknolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞULE ARI

    PROF. DR. ÖZGÜR KURT

  2. Tez No

    812048

    Ülseratif kolit hastalığında fusobacterium nucleatum miktarının tümör nekroz faktör (TNF) alfa tedavisi üzerindeki etkilerinin araştırılması

    Investigating the effects of fusobacterium nucleatum levels on tumor necrosis factor (TNF) alpha therapy in ulcerative colitis disease

    BİLGE ŞENYÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SUNDE YILMAZ SÜSLÜER

  3. Tez No

    850914

    İnsan mikrobiyomu ve hastalık ilişkisinin tahmininde makine öğrenmesi uygulamaları

    Machine learning approaches to predict the human microbiome and disease associations

    METEHAN ÜNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolAnkara Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GAZİ ERKAN BOSTANCI

    DOÇ. DR. CEREN ÖZKUL KOÇAK

  4. Tez No

    862666

    Obstrüktif uyku apne sendromlu (OUAS) hastaların bağırsak florasında desülfovibrio miktarındaki değişimin desatürasyon ile ilişkisi

    The relationship between the change in the amount of desulfovibrio and desaturation in the intestinal flora of patients with obstructive sleep apnea syndrome (OSAS)

    BARAN SINIR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    NörolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Nörobilim Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. PINAR ORTAN

  5. Tez No

    550550

    Kalp yetersizliğinde bağırsak mikrobiyatası ve inflamatuvar belirteçlerle ilişkisi

    Intestinal microbiasis and its relationshiph with inflammatory indicator in heart failure

    OĞUZ KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    KardiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Kardiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMAİL DOĞU KILIÇ

Geri Dön