Geri Dön

İzole 13q delesyonu saptanan KLL olgularında NOTCH1 ve SF3B1 genlerinde mutasyon analizi

Mutations analyzing of NOTCH1 and SF3B1 genes in cases with KLL detected isole 13q deletion

PDF İndir

  1. Tez No: 624326
  2. Yazar: GÜLÇİN GÜNDEN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Hematoloji, Genetics, Hematology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 64

Özet

Kronik lenfositik lösemi (KLL) lenfoid seriden köken alan ve karakteristik genetik değişikliklerin bulunduğu bir lösemi tipi olarak tanımlanmaktadır. Kronik lenfositik lösemide genetik değişiklikler, kromozomal aberasyonlar ve gen mutasyonlarıdır. Literatürlerde en sık gözlenen kromozomal aberasyonlar ise 13. ve 11. kromozumun uzun kol delesyonu (del13q, del11q), 17. kromozomun kısa kol delesyonu (del17p) ve 12. kromozomun trizomisi olarak bildirilmiştir. Belirtilen anomalilerden izole del13q iyi prognostik olarak kabul edilmektedir. Fakat bazı literatürlerde 13. kromozomun uzun kolundaki delesyonun büyüklüğü ile delesyona ek anomalilerin varlığının prognozu etkilediği bildirilmiştir. Kronik lenfositik lösemi belirtilen kromozomal aberasyonların yanında sıklıkla NOTCH1, SF3B1, BIRC3, TP53 ve XPO1 genlerinde mutasyonlar saptanmıştır. Belirtilen genler içinde NOTCH1 ve SF3B1 genlerinin hücre siklüsünde, apoptoz ve RNA splicing gibi hücresel işlevlerde önemli mekanizmalarda görevli olduğu bilinmektedir. Bu nedenle NOTCH1 ve SF3B1 genlerindeki mutasyonların hastalığın patogenezinde önemli etkilerinin olması beklenilmektedir. Ek olarak literatürlerden elde edinilen bilgiler doğrultusunda belirlediğimiz genlerin hastaların tedaviye başlama süreleri ve sağkalım süresi üzerine etkileri bulunduğu da bildirilmektedir. Biz de çalışmamızda FISH yöntemiyle belirlediğimiz izole del13q saptanan kırk üç hastada kötü prognostik etkisi olan NOTCH1 ve SF3B1 genlerinde mutasyon profilini Sanger Sekanslama yöntemiyle inceledik. Belirtilen hasta grubunda NOTCH1 genininde en sık görülen 7541_7542delCT mutasyonunu bir hastada (%2.4) saptarken, SF3B1 geninde mutasyon saptayamadık. Çalışmamızda SF3B1 ve NOTCH1 genlerinde hasta sayısının ve mutasyon oranlarının az olması nedeni ile del13q oranları, Rb delesyon varlığı, hastalık evreleri, tedaviye başlama süresi ve OS parametreler ile ilişkisi istastiksel olarak değerlendirilememiştir. Ancak olgu serimizde sadece 1 hastada NOTCH1 geninde mutasyon bulunması; ilgili mutasyon ile del13q hasta grubu arasında bir ilişkinin olmadığını düşündürmektedir. Yapılan literatür değerlendirmesinde çalışmamız Türk populasyonunda FISH yöntemi ile izole del13q saptanan KLL hastalarında ilgili genlerin mutasyonel durumunu değerlendiren ilk çalışma olarak görülmekte ve bu yönü ile literatüre katkı sağlamaktayız.

Özet (Çeviri)

Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is defined as a type of leukemia originating from the lymphoid series with characteristic genetic changes. Genetic changes, chromosomal aberrations and gene mutations in chronic lymphocytic leukemia. The most common chromosomal aberrations in the literature have been reported as deletion of the long arm of the 13th and 11th chromosomes (del13q, del11q), deletion of the short arm of the 17th chromosome (del17p) and trisomy of the 12th chromosome. Del13q isolated from the mentioned anomalies is considered to be good prognostic. However, in some literature, it has been reported that the size of the long arm of chromosome 13 and the presence of additional anomalies affect the prognosis. In addition to chromosomal aberrations with chronic lymphocytic leukemia, mutations in the genes of NOTCH1, SF3B1, BIRC3, TP53 and XPO1 are frequently detected. Among the mentioned genes, NOTCH1 and SF3B1 genes are known to be involved in cell cycle, apoptosis and important mechanisms in cell process such as RNA splicing. Therefore, mutations in NOTCH1 and SF3B1 genes are expected to have important effects on the pathogenesis of the disease. In addition, it has been reported that the genes we identified in accordance with the information obtained from the literature have effects on the duration of treatment and survival time of the patients. In our study, we investigated the mutation profile of NOTCH1 and SF3B1 genes with poor prognostic effect in forty-three patients with isolated del13q detected by FISH method by Sanger Sequencing method. We detected 7541_7542delCT mutation in NOTCH1 gene in one patient (2.4%), but we could not detect mutations in SF3B1 gene. In our study, due to the low number of patients and mutation rates in SF3B1 and NOTCH1 genes, del13q rates, presence of Rb deletion, disease stages, duration of treatment and OS parameters could not be evaluated statistically. However, in our case series, only 1 patient had mutations in NOTCH1 gene; suggest that there is no relationship between the relevant mutation and the del13q patient group. In the literature review, our study is seen as the first study evaluating the mutational status of related genes in CLL patients with isolated del13q detected by FISH method in Turkish population and we contribute to the literature with this aspect.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    621250

    Kronik lenfositik lösemi olgularında 13Q delesyon büyüklüğünün CGH+SNP array yöntemi ile araştırılması

    Investigation of 13q deletion size in patients with chronic lymphocytic leukemia by CGH + SNP array method

    SEVGİ IŞIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    GenetikEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS

  2. Tez No

    520454

    İzole 13q delesyonu bulunan KLL vakalarında Retinoblastoma geni delesyonunun incelenmesi

    Examination of the Retinoblastoma gene deletion in CLL cases with isolated 13q deletion

    NUR SENA İNCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GenetikEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS

  3. Tez No

    267456

    Kronik lenfositik lösemili hastalarda floresan ın situ hibridizasyon yöntemi ile sitogenetik anomalilerin tespiti ve sitogenetik anomalilerin klinikle korelasyonu

    The detection of cytogenetic anomalies in chronic lymphocytic leukemia patients by fluorescence in situ hybridization method and the clinical correlation of cytogenetic anomalies

    CANAN BELİN CİRİT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    HematolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİROL GÜVENÇ

  4. Tez No

    267008

    13q delesyonlu multipl miyelom hastalarında bortezomib etki mekanizmasının araştırılması

    The investigation of bortezomib activation mechanisim in 13q deletion positive multiple myeloma patients

    ZEYNEP FİLİZ ZADEOĞLULARI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GenetikDokuz Eylül Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ALİ ÖZCAN

  5. Tez No

    256332

    FVII promotor bölge gen değişimlerinin Behçet hastalarında tromboz oluşumundaki rolünün araştırılması

    The role of FVII gene polymorphism in Behçet patients with thrombosis

    ZEHRA VELİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEJAT AKAR

Geri Dön