Molecular characterization of cattle and sheep hydatid cyst samples obtained from slaughter houses in Elazığ
Elazığ'da mezbahanelerden toplanan sığır ve koyun hidatik kist örneklerinin moleküler karekterizasyonu
- Tez No: 624385
- Danışmanlar: PROF. DR. SAMİ ŞİMŞEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Veteriner Hekimliği, Parasitology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fırat Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 91
Özet
Echinococcosis, Dünya Sağlık Örgütü tarafından dünyadaki on yedi ihmal edilmiş tropikal hastalıktan biri olarak kabul edilen, Echinococcus cinsinin cestod türlerinin neden olduğu ve her yıl önemli ekonomik ve tıbbi kayıplardan sorumlu, hayatı tehdit eden zoonotik bir enfeksiyondur. Echinococcus spp'nin genetik varyasyonlarını incelemek için farklı moleküler teknikler kullanılmış, Echinococcus spp'nin genotiplenmesi için farklı nükleer ve mitokondriyal bölgeler kullanılarak araştırmalar yapılmıştır. Bu çalışmanın amacı, Echinococcus spp'nin tanımlanması, moleküler analizi ve genotiplenmesidir. Elazığ'daki mezbahalardan toplanan koyun ve sığır örneklerinde 446 bp mitokondriyal sitokrom c oksidaz alt birim 1 (mt-CO1) geni çoğaltılmıştır. Neticede PZR band kalitesine göre 90 örnek seçildi ve daha sonra örnekler gen dizilimi için ticari firmaya gönderildi. Bu çalışmada 5 örneğin sekansı iki kez yapılmasına rağmen başarılı olunmadı, bu nedenle izolat türlerini tanımlamak için 85 numuneye (19 koyun, 66 sığır) sekanslama yapıldı. Sekans analizi sonucunda, 85 izolattan 84'ü E. granulosus sensu stricto olarak belirlenirken bir koyun izolatının, Türkiye'de ilk kez bildirilen E. canadensis'in G6 genotipi olduğu tespit edildi. Bununla birlikte, sadece farklı hayvan örneklerinde değil, aynı sığırlardan toplanan örneklerde de tek nükleotid polimorfizmi gözlemlendi. Sığırların ikisinde hem akciğerde hem de karaciğerde çoklu organ enfeksiyonu gözlendi. Haplotip analalizi neticesinde ise, 66 sığır izolatında E. granulosus s.s.'un16 haplotipi tespit edilmiş, 19 koyun örneğinde 8 haplotip belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Echinococcosis is a life threatening zoonotic infection, recognized as seventeen neglected tropical diseases in the world by WHO, caused by the immature worms of cestodes species of genus Echinococcus and is responsible for significant economic as well as medical losses each year. Different molecular techniques have been used to study the genetic variations of Echinococcus spp, investigations have been made using different nuclear as well as mitochondrial regions for genotyping of the Echioncoccus spp. The purpose of this study is the identification, molecular analysis and genotyping of the Echinococcus spp. in sheep and cattle samples collected from slaughterhouses of Elazig, Turkey by using 446 bp of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (mt-CO1) gene. 90 samples have been selected on the basis of cyst quality and PCR band quality and the samples were then sent for gene sequencing. 5 samples were not sequenced properly so alignment has been performed on 85 samples (19 sheep, 66 cattle) to identify the species of isolates. Out of 85 isolates, 84 were recognized as E. granulosus sensu stricto and one sheep isolate was found to be G6 genotype of E. canadensis which is reported for the first time in Turkey. However single nucleotide polymorphism has been observed in not only samples of different animals but also in samples collected from same cattle. Multiple organ infection has been observed in two of the cattle both in lungs and liver. As a result of haplotype analysis, 16 haplotypes of E. granulosus s.s. have been detected in 66 cattle isolates whereas 8 haplotypes were identified in 19 sheep samples.
Benzer Tezler
- Manisa ve çevresinde echinococcus granulosus izolatlarının moleküler tanısı
Molecular identification of echinococcus granulosus isolates in Manisa province
MUSTAFA ÖZTATLICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiCelal Bayar ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURAY ALTINTAS
- İnsan, koyun ve sığır kistik ekinokokozis izolatlarının nad-1 gen bölgesinin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of the NAD1 gene region of human, sheep and cattle cystic echinococcosis isolates
GALİP SARISU
Doktora
Türkçe
2017
Moleküler TıpYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP TAŞ CENGİZ
YRD. DOÇ. DR. YUNUS EMRE BEYHAN
- Afyonkarahisar'da sığır, manda, koyun ve keçilerde bulunan echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of Echinococcus granulosus isolates found in cattles, buffalos, sheep and goats in Afyonkarahisar
KÜRŞAT KARTAL
- Kuzeydoğu Anadolu Bölgesinde koyun ve sığırlarda kistik echinococcosisin moleküler karakterizasyonu
Molekular characterisation of cystic echinococcosis in sheep and cattle in the Northeastern Anatolia Region in Turkey
CUMA SALTAN
Doktora
Türkçe
2024
ParazitolojiKafkas ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GENCAY TAŞKIN TAŞÇI
- Echinococcus granulosus'un sığır ve koyun izolatlarının moleküler karakterizasyonu, haplotip analizi ve miRNA ekspresyon düzeylerinin belirlenmesi
Molecular characterization of cattle and sheep isolates of echinococcus granulosus, haplotype analysis, and determination of miRNA expression levels
BÜNYAMİN İREHAN