Sarımsakta depolama süresince allinaz geni ifadesindeki değişikliğin belirlenmesi
Determination of changes in alliinase gene expression during storage in garlic
- Tez No: 625914
- Danışmanlar: PROF. DR. MERYEM İPEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 34
Özet
Sarımsak kendine özgü keskin ve karakteristik bir kokuya sahiptir. Sarımsağa kokusunu kükürtlü bileşiklerden allisin vermektedir. Allinaz geninin kodladığı enzim sarımsakta allin öncül kükürtlü bileşiği allisine dönüştürür. Bu yüksek lisans tez çalışmasının amacı, sarımsakta depolama süresince allinaz geni ifadesindeki değişimin Real-Time PCR analizi ile belirlenmesi ve kükürtlü bileşiklerden allin ve allisin içeriği ile karşılaştırılmasıdır. Tez çalışmasında, Kastamonu ve PI515971 sarımsak genotipleri 4°C ve 21°C'de 12 hafta depolanmıştır. Depolama sonunda alınan örneklerden, toplam RNA izolasyonu ve cDNA sentezi yapıldıktan sonra allinaz geni ifadesindeki değişimler aktin geni referans alınarak Real-Time PCR analizleri ile belirlenmiştir. Real-Time PCR analiz sonuçlarına göre, Kastamonu ve PI515971 sarımsak genotiplerinde 4°C ve 21°C'de depolanan örneklerde başlangıca göre göreceli allinaz gen ifade düzeyinde önemli bir artış görülmüştür. Kastamonu genotipinde, depolama öncesi örneklerinde 12,85 olan göreceli gen ifade düzeyi 4°C'de yaklaşık 2,5 kat artarak 32,37 düzeyine, 21°C'de yaklaşık 3 kat artarak 39,15 düzeyine çıkmıştır. 4°C ile 21°C uygulamaları arasında fark istatiksel olarak anlamlı bulunmuştur. PI515971 sarımsak genotipinde ise depolama öncesi örneklerinde göreceli allinaz ifadesi 18,08 iken 4°C'de yaklaşık 5 kat artarak 87,9 düzeyine, 21°C'de 5 kat artarak 88,9 düzeyine çıkmıştır. PI515971 sarımsak genotipinde, 4°C ile 21°C uygulamaları arasında istatistiksel olarak fark bulunmamıştır. Ayrıca allinaz gen ifadesindeki artış ile allin ve allisin miktarındaki artış arasında yüksek pozitif korelasyonlar saptanmıştır. Sonuç olarak allinaz gen ifadesine etki yönünden depolama sıcaklıkları arasında çok fazla fark olmadığı ve 4°C ile 21°C' de depolamada göreceli allinaz gen ifade düzeyindeki artışın allisin ve allin miktarlarındaki artışla paralel olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Garlic has a distinctive pungent and characteristic odor. Allicin which is one of major sulfur compounds in garlic gives garlic odor. The enzyme coded by allinase gene coverts alliin precursor to the allicin. The aims of this master thesis were to determine the allinase gene expression during storage in garlic by Real-Time PCR analysis and to compare with alliin and allicin contents. In this thesis, Kastamonu and PI515971 garlic genotypes were stored at 4ºC and 21ºC for 12 weeks. After total RNA isolation and cDNA synthesis from the samples taken at the end of the storage, changes in relative allinase gene expression were determined by Real-Time PCR analysis by using actin reference gene. According to the results of Real-Time PCR analysis, significant increases in the relative allinase gene expression were observed in Kastamonu and PI515971 samples stored at 4ºC ve 21ºC compared to pre storage samples. The relative gene expression level of Kastamonu genotype was 12,85 in pre-storage samples and increased about 2,5 times to 32,37 at 4ºC, and increased approximately 3 times to 39.15 at 21ºC. A significant difference was found between 4ºC and 21ºC treatments. In the PI515971 garlic genotype, the expression was 18,08 in pre-storage samples and it increased about 5 times to 87,9 at 4ºC and increased about 5 times to 88,9 at 21ºC. There is no significant difference between 4ºC and 21ºC treatments in PI515971 garlic genotype. In addition, significant correlations were detected between increase of allinase expression level and increase of alliin and allicin contents. In conclusion, there is no significant difference between storage temperatures in terms of effect to allinase gene expression level and the increase in relative allinase gene expression during storage at 4ºC and 21ºC occurred in parallel with increase in contents of alliin and allicin.
Benzer Tezler
- Sarımsakta depolama süresince tiamin biyosentezinde görev alan THIC geninin ifade düzeyindeki değişiminin belirlenmesi
Determination of changes in expression level of THIC gene involled in thiamine biosynthesis pathway during storage in garlic
SAİME KOÇÇAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiUludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERYEM İPEK
- Sarımsakta çiçeklenme ile ilişkili genlerin ifade düzeyinin analizi
Gene expression level analysis of flowering related genes in garlic
OSMAN KIRIKOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiBursa Uludağ ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERYEM İPEK
- Sucuk üretiminde etin sarımsakla muamelesinin protein fosforilasyonu, fizikokimyasal ve biyokimyasal niteliklere etkisi
Effect of meat treatment with garlic on protein phosphorylation, physicochemical and biochemical properties in sucuk production
AHMET DURSUN
Doktora
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA GÜLER
- Marine edilmiş pişirmeye hazır tavuk etlerinin modifiye atmosfer paketleme ile muhafazası
Preservation of marinated chicken drumsticks with modified atmosphere packaging
ESRA DOĞU
- Tereyağının bazı özellikleri ve oksidasyon stabilitesi üzerine taşköprü sarımsağı ve sentetik antioksidan ilavesinin etkileri
The effects of taşköprü garlic and synthetic antioxidant addition on some properties and oxidation stability of butter
SERAP AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiKastamonu ÜniversitesiSürdürülebilir Tarım ve Tabii Bitki Kaynakları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DEREN TAHMAS KAHYAOĞLU