Geri Dön

Ülseratif kolit ve irritabl bağırsak sendromunda Dientamoeba fragilis'in direk mikroskopi ve moleküler yöntemlerle araştırılması, genotiplendirme ve sistein peptidaz virülans faktörünün incelenmesi

Investigation of Dientamoeba fragilis with microscopical and molecular methods in patients with ulcerative colitis and irritable bowel syndrome, genotyping and cysteine peptidase virulence factor

PDF İndir

  1. Tez No: 645735
  2. Yazar: ELİF TUĞÇE ÜNALAN ALTINTOP
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SİBEL ERGÜVEN
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Dientamoeba fragilis patojenitesi tartışmalı sık görülen bir bağırsak protozoonudur. Bu parazitin iki genotipi bulunmakta olup dünya genelinde Genotip 1 sık gözlenmektedir. Bu çalışmanın amacı aktif ve remisyonda ülseratif kolit (ÜK) ve irritabl bağırsak sendromu (İBS) hasta gruplarında D. fragilis'i farklı yöntemlerle araştırmak ve genotip dağılımını ortaya koymaktır. Türkiye'de D. fragilis genotipleriyle ilgili yayınlanmış bir veri bulunmamaktadır. Çalışmamızda hastalardan toplanan dışkı örneklerine serum fizyolojik ve Lugol solüsyonu ile taze bakı ve trikrom boyama uygulanarak örnekler mikroskobik olarak değerlendirilmiştir. Tüm örneklerde D. fragilis varlığı konvansiyonel PCR, nested-PCR ve qPCR yöntemleriyle araştırılmıştır. Blastocystis türleri varlığı konvansiyonel PCR yöntemiyle araştırılmıştır. Pozitif bulunan örneklerin genotipleri DNA dizi analizi yöntemiyle BLAST algoritmasına göre belirlenmiştir. Çalışma sonucunda 4 İBS, 2 aktif ÜK ve 2 remisyonda ÜK hastasında D. fragilis; 3 İBS, 5 aktif ÜK ve 1 remisyonda ÜK hastasında Blastocystis türleri saptanmıştır. Bir aktif ÜK ve 1 İBS hastasında iki parazit birlikte saptanmıştır. Gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır. D. fragilis izolatların tümü Genotip 1 olarak bulunmuş olup Blastocystis izolatlarının tümü ST3 olarak saptanmıştır. Sistein peptidaz, serin peptidaz ve metallopeptidaz virülans gen bölgelerinin nested PCR yöntemiyle araştırılması sonucu altı örnekte pozitiflik saptanmıştır. Altın standart yöntem olan qPCR ile karşılaştırıldığında nested PCR duyarlılığı %75 olup tanı ve genotiplendirme için alternatif yöntem olarak değerlendirilmiştir.

Özet (Çeviri)

Dientamoeba fragilis is a common intestinal protozoon whom pathogenicity is still debated. Two genotypes of this parasite have been determined, Genotype 1 is common worldwide. Microscopy, culture and molecular methods are used for diagnosis. The aim of this study is to investigate D. fragilis in patients with active and remittent ulcerative colitis (UC) and irritabl bowel syndrome (IBS) by different diagnostic methods and investigate its genotypes. There is not any published data on the genotypes of D. fragilis in Turkey. The stool samples were investigated microscopically by saline-Lugol and trichrome staining methods. All samples were scanned for D. fragilis via conventional, nested and qPCR method. Blastocystis spp were investigated by conventional PCR. Positive samples were genotyped via sequencing with BLAST algorithm. Our results revealed that 4 IBS, 2 active UC and 2 remittent UC patients were infected with D. fragilis, whereas 3 IBS, 5 active UC and 1 remittent UC patients were infected with Blastocystis spp. One active UC and one IBS patient were infected with both of the parasites. The difference between the groups were not statistically significant. All D. fragilis isolates were Genotype 1 and Blastocystis isolates were ST3. Cysteine, serine and metallopeptidase virulence genes were investigated by nested-PCR and 6 of the isolates were found to be positive. Nested PCR, with its 75% of sensitivity was concluded to be an alternative to qPCR which is the golden method for the identification of D. fragilis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    514336

    İnflamatuvar bağırsak hastalıklarında ince bağırsakta aşırı bakteri çoğalmasının rolü

    The role of small intestinal bacterial overgrowth in inflammatory bowel diseases

    SİNEM ÖREN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GastroenterolojiBaşkent Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKÜ DAĞLI

  2. Tez No

    576405

    İrritabl barsak sendromunda çocukluk çağı travmasının rolü

    The role of childhood trauma in irritable bowel syndrome

    VOLKAN SENEGER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Gastroenterolojiİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYNUR GÖRMEZ

  3. Tez No

    622329

    İnflamatuvar barsak hastalıklarında kitotriozidaz enzim aktivitesi

    Enzymatic activity of chitotriosidase in inflammatory bowel diseases

    MERYEM BALCELİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GastroenterolojiMersin Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ENVER ÜÇBİLEK

  4. Tez No

    735241

    Ülseratif kolit, irritabl bağırsak sendromu ve crohn hastalığında dientamoeba fragilis yaygınlığı

    Prevalence of dientamoeba fragilis in ulcerative colitis, irritable bowel syndrome and crohn's disease

    MELİS CENGİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ParazitolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YUNUS EMRE BEYHAN

  5. Tez No

    266804

    Ülseratif kolit ve irritabl barsak sendromlu hastalarda intestinal mast hücre değerlendirmesi

    Evaluation of intestinal mast cells the patients with ulcerative colitis and irritable bowel syndrome

    ONUR AYDINLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GastroenterolojiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜLYA ÇETİNKAYA

Geri Dön