İmmün sistemi sağlam ve immün sistemi baskılanmış yatan hastalarda real time PZR ile Pneumocystis jirovecii pozitif saptanan olgularda multilokus sekanslama ile P. jirovecii genotiplerinin belirlenmesi: Bir moleküler epidemiyolojik çalışma
Determination of Pneumocystis jirovecii genotypes by multilocus sequencing from immunocompetent and immunosupressed patients who were detected P. jirovecii positive by real time PCR: A molecular epidemiological study
- Tez No: 650563
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SAMİYE DEMİR, DOÇ. DR. MERT DÖŞKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Parazitoloji, Biology, Genetics, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 174
Özet
Pneumocystis jirovecii immün sistemi baskılanmış hastalarda Pneumocystis pnömonisine (PcP) neden olan fırsatçı bir mantar türüdür. İmmün sistemi sağlam bireylerde ise kolonize olabilmekte ve hastalığın bulaşmasında rol oynayabilmektedir. Bu çalışmanın amacı, PcP hastalarından (n=84) alınan BAL ve balgam örneklerinden elde edilen P. jirovecii izolatlarının CYB, mt26S ve SOD lokusları baz alınarak multilokus dizi analiziyle genetik çeşitliliğini araştırmaktır. İncelenen 84 izolattan 27 tanesi tüm lokuslar kullanılarak genotiplendirilmiştir. Üç izolat CYB ve mt26S lokusları kullanılarak, bir izolat ise mt26S ve SOD lokusları kullanılarak genotiplendirilmiştir. Mt26S lokusu analizlerinde allel 2,3,7 ve 8 genotipleri bulunurken SOD lokusu analizlerinde SOD 1,2 ve 4 genotipleri tespit edilmiştir. CYB lokusu analizleri sırasında CYB 1,2,5,6 ve 7 genotipleri ve ek olarak yeni bir CYB genotipi bulunmuştur. Multilokus sekanslama sonuçlarına göre bulunan multilokus genotipler ise E, F, M, N, P, V ve mixed gruplarıdır. CYB daha polimorfik bir lokusa sahipken genotiplendirmede en başarı olunan lokus mt26S lokusudur.
Özet (Çeviri)
Pneumocystis jirovecii is an opportunistic fungus that causes Pneumocystis pneumonia (PcP) in immunocompromised patients. In immunocompetent individuals, it can be colonized and play a role in the transmission of the disease. The aim of this study is to investigate the genetic diversity by multilocus sequence analysis of P. jirovecii isolates obtained from BAL and sputum samples from PcP patients (n = 84) based on CYB, mt26S and SOD loci. 27 of 84 isolates were genotyped using all loci. Three isolates were genotyped using CYB and mt26S loci, and one isolate was genotyped using mt26S and SOD loci. While allele 2,3,7 and 8 genotypes were found in Mt26S locus analyzes, SOD 1,2 and 4 genotypes were detected in SOD locus analyzes. During the analyzes of CYB locus, CYB 1,2,5,6 and 7 genotypes and additionally a new CYB genotype were found. The multilocus genotypes found according to the results of multilocus sequencing are E, F, M, N, P, V and mixed groups. While CYB has a more polymorphic locus, the most successful locus in genotyping is the mt26S locus.
Benzer Tezler
- Kronik hepatit b tanılı hastalarda kemik metabolizma parametrelerinin bazılarının sağlıklı bireylerle karşılaştırılması
Comparing some of bone metabolism parameters between chronic hepatitis b patients and healty control
OĞUZ DİKBAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıSelçuk Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA SAİT GÖNEN
- İmmün sistemi baskılanmış ishalli hastalarda enterocytozoon bieneusi ve encephalitozoon intestinalis varlığının IFA ve real time PCR yöntemleri ile araştırılması
Investigation of enterocytozoon bieneusi and encephalitozoon intestinalis in patients with immunocompromised diarrhea by İFA and real time PCR methods
SELAHATTİN AYDEMİR
Doktora
Türkçe
2022
ParazitolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP TAŞ CENGİZ
DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED GALİP HALİDİ
- Toxoplasma gondii'ye özgü aşı adayı antijenlerin kullanıldığı adjuvante multivalan rekombinant protein aşısının oluşturduğu immun yanıt ve korunmanın belirlenmesi
Determination of immune response and protection elicited by adjuvanted multivalent recombinant protein vaccine using toxoplasma gondii specific vaccine candidate antigens
ESRA ATALAY ŞAHAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiEge ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİYE DEVECİ
PROF. DR. ADNAN YÜKSEL GÜRÜZ
- Cryptosporidium spp. türlerinin real time PZR yöntemi ile tanımlanması
Identification of Cryptosporidium species by real time PCR method
GÜLLÜ EVCİL
- Kanser hastalarında ıfa tekniği ile microsporidium spp.'nin sıklığının araştırılması
Investigation frequency of microsporidia SPP. with method of ifat at cancer patients
DERYA GÜL SAĞCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ParazitolojiCumhuriyet ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERPİL DEĞERLİ