Genetics of hereditary sensory and autonomic neuropathy (HSAN)
Herediter duysal ve otonomik nöropati (HSAN) genetiği
- Tez No: 652461
- Danışmanlar: PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
Kalıtsal Duysal Nöropati (HSN), ağırlıklı olarak duyu sinirlerini etkiler ve en bilinen semptomları, kas güçsüzlüğü, zayıflama ve ağrısız yaralanmalara ek olarak duyu kaybıdır. Otonomik semptomlar genellikle HSN ile birlikte seyreder, bu nedenle hastalık, Kalıtsal Duyusal ve Otonom Nöropati (HSAN) olarak da bilinir. Bu çalışmada, hastalıktan sorumlu geni belirlemek için başlangıçta HSAN tanısı alan bir Türk ailesi araştırıldı. Akraba evliliğine sahip ebeveynler, otozomal çekinik kalıtımı düşündüren üç hasta ve bir sağlıklı çocuğa sahiptir. HSN ile birlikte öksürük ve gastroözofageal reflü (GER) ailede ek semptomlar olarak bildirilmiştir. Hastalık, bu fenotipe sahip hastalarda daha önce kromozom 3p22-24 bölgesine haritalanmış, ancak sorumlu gen henüz tanımlanamamıştır. Otozomal çekinik, otozomal baskın ve X'e bağlı kalıtıma dayalı olmak üzere, ailede tüm ekzom dizileme (WES) yöntemi kullanılarak aday gen varyantlarını belirlenmiştir. WES verileri ayrıca homozigotluk haritalaması için HOMWES programı kullanılarak da incelenmiştir. Her aday varyantın rolü, segregasyon analizi ile değerlendirilmiştir. Ne yazık ki, bu analizler 12 farklı aday varyantın dışlanması ile sonuçlanmış, WES sonuçları doğrudan dizileme ile karşılaştırıldığında yüksek oranda yanlış pozitif sonuç gözlenmiştir. Çalışmanın son ayında, hastaneye yatışının ardından hastaya serebellar ataksi, nöropati ve bilateral vestibüler arefleksi sendromu (CANVAS) tanısı konulmuştur. Yapılan haplotip analizi ile, ailenin hasta üyelerinde CANVAS haplotipinin varlığı ortaya çıkmıştır. Bu bulgu, RFC1 genindeki (AAGGG) diziliminin çok sayıda tekrarlanması ile genişlemesi sonucunda bu ailedeki bozukluktan sorumlu olduğunu işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
Hereditary Sensory Neuropathy (HSN), predominantly affects sensory nerves and is characterized by sensory loss in addition to muscle weakness, wasting and painless injuries. Autonomic symptoms are commonly associated with HSN, thus, it is also known as Hereditary Sensory and Autonomic Neuropathy (HSAN). A Turkish family initially diagnosed with HSAN was investigated in this study to identify the gene responsible for the disorder. The consanguineous parents had three affected and one unaffected children suggesting autosomal recessive inheritance. Along with HSN, cough and gastroesophageal reflux (GER) have been reported as additional symptoms in family. The disease was mapped previously to chromosome 3p22-24 in patients with this phenotype, however, the gene could not have been identified, yet. We have identified the causative candidate gene variants using whole exome sequencing (WES) data in the HSN family based on autosomal recessive, autosomal dominant, and X-linked inheritance. WES data were further evaluated using HOMWES program for homozygosity mapping. The causative role of each variant was evaluated by segregation analysis. Unfortunately, these analyses gave inconclusive results with exclusion of 12 different candidate variants. A high rate of false positive results was observed when WES results were compared with that of direct sequencing. In last month of the study, upon hospitalization, the patient was re-diagnosed as cerebellar ataxia with neuropathy and bilateral vestibular areflexia syndrome (CANVAS). The haplotype analysis showed the presence of CANVAS associated core haplotype among the affected members of the family. This finding indicated that repeat expansion of the (AAGGG) unit in RFC1 gene is responsible for the disorder in this family.
Benzer Tezler
- Mutation, exome sequencing and linkage analyses in Turkish CMT families
Türk CMT ailelerinde mutasyon, ekzom dizileme ve bağlantı analizleri
ALPEREN ERDOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. ESRA BATTALOĞLU
- Functional and morphological evaluation of Drosophila CMT models
Drosophila CMT modellerinin işlevsel ve morfolojik değerlendirmesi
ELİF BEGÜM GÖKERKÜÇÜK
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU
DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS
- Development of a drosophila CMT model via overexpression and knocking-in of GDAP1 gene
GDAP1 geninin yüksek anlatımı ve knock-ın yöntemiyle drosophila CMT modelinin oluşturulması
HÜSEYİN KAYA AKYÜZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU
DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS
- Sendromik olmayan otozomal resesif işitme kaybı olan beş ailede genom boyunca genotipleme analizi
Genomewide genotyping analysis in five families with nonsyndromic autosomal recessive deafness
ASLI SIRMACI
- Charcot-marie-tooth hastalarının klinik ve genetik olarak değerlendirilmesi
Clinical and genetic evaluation of patients with Charcot-Marie-Tooth
ZEYNEP BİLİMLİ CİNGÖZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FARUK İNCECİK