Geri Dön

Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella SPP. izolatlarının ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosilin'e fenotipik duyarlılığının belirlenmesi ve direnç genlerinin in house PCR yöntemiyle araştırılması

Determination of phenotypic susceptibility to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin, fosfomycin and temocillin in which producing extended spectrum beta-lactamase isolates of eschericha coli and klebsiella spp. and investigation of resistance genes by in house pcr method

PDF İndir

  1. Tez No: 656983
  2. Yazar: ARZU TANRIVERDİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜLNUR TARHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adıyaman Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Amaç: Antibiyotik direnci tüm dünyada ciddi bir problem teşkil etmekte ve önemi giderek daha çok anlaşılmaktadır. Escherichia coli, Klebsiella spp. gibi direnç gelişiminin fazla görüldüğü Enterobakterilerde direncin sık görülen sebeplerinden biri Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üretimidir. Yeni antibiyotiklerin keşfinin zor ve maliyetli olması, yeni gelişen antibiyotiklere hızlı bir şekilde direnç gelişimi gibi sebepler, dikkatleri direnç saptanmayan veya direncin daha yavaş görüldüğü ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosilin gibi antibiyotiklere çevirmiştir. Bu çalışma, Adıyaman ilinde izole edilen GSBL pozitif E. coli ve Klebsiella spp. izolatlarının ertapenem, merpenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosiline olan in vitro duyarlılığının ve direnç genlerinin in house PCR yöntemi ile belirlenmesi amacı ile yapılmıştır. Materyal ve metod: Bu çalışmada, Adıyaman Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji laboratuvarında 10/2018-01/2019 tarihleri arasında çeşitli poliklinik ve yatan hastalardan alınan klinik örneklerden izole edilen GSBL pozitif 82 adet E. coli ve 37 adet Klebsiella spp. izolatı değerlendirildi. Bu izolatların ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin ve fosfomisin duyarlılığı BD Phoenix® otomatize sistemi ile belirlendi. Karbapenem türevlerine dirençli izolatlarda OXA-48 geni ve kolistine direnç saptanan izolatlarda mcr-1 gen varlığı in house PCR yöntemi ile araştırıldı. Bulgular: Çalışmamıza katılan toplam 119 GSBL pozitif E. coli ve Klebsiella spp. izolatının % 28.5'i ertapeneme, % 9.2'si meropenem, imipenem ve kolistine, % 26.8'i temosiline, 101 GSBL pozitif suşun % 2.9'u ise fosfomisine dirençli bulunmuştur. PCR testi sonucuna göre kolistin dirençli suşlarda mcr-1 genine rastlanmamıştır. Karbapenem dirençli GSBL pozitif E. coli izolatlarının % 23.5'i, K. pneumoniae izolatlarının % 47'sinde OXA-48 genine rastlanırken, K. oxytoca izolatlarında ise OXA-48 geni tespit edilememiştir. Sonuç: Çalışmamıza katılan izolatlardaki ertapenem direnci diğer karbapenemlere göre daha yüksek çıkmıştır. Temosilin ülkemizde kullanılmamasına rağmen, temosiline karşı yüksek direnç saptanmıştır. mcr-1 geni sıklığı dünyada nadiren görülmekle beraber, çalışmamızda mcr-1 genine rastlanmamıştır. OXA-48 geni imipenem dirençli suşlarda ertapenem ve meropenem dirençli suşlara göre daha az saptanmıştır, ayrıca E. coli suşlarında K. pneumoniae suşlarına oranla daha az görülmüştür.

Özet (Çeviri)

Aim: Antibiotic resistance continues to be a serious problem all over the world its importance is increasingly understood. Escherichia coli and Klebsiella spp. one of the common causes of resistance in Enterobacteria, where resistance development is high, is the production of expanded spectrum beta-lactamase (ESBL). The discovery of new antibiotics is difficult and costly, and the rapid development of resistance to newly developed antibiotics has turned attention to antibiotics such as ertapenem, meropenem, imipenem, colistin and temocillin, where resistance is not detected or resistance is seen more slowly. The aim of this study was to determine the in vitro susceptibility of the isolates to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin, fosfomycin and temosilin and to identify resistance genes by in house PCR method of ESBL positive E. coli and Klebsiella spp. isolated in Adıyaman. Material and Methods: In this study, 82 E. coli and 37 Klebsiella spp. isolated from clinical samples taken from various outpatient and inpatients between 10/2018-01/2019 in Adıyaman University Training and Research Hospital Microbiology Laboratory was evaluated. The susceptibility of these isolates to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin and fosfomycin was determined with the BD Phoenix® automated system. Temocillin susceptibility test was performed by disk diffusion method in all ESBL positive isolates. The presence of OXA-48 and mcr-1 genes in isolates with carbapenem derivatives and colistin resistance were investigated by in house PCR method. Results: In our study, the resistance rates of ertapenem and meropenem, imipenem and colistin of 119 ESBL positive E. coli and Klebsiella spp. were found as 28.5 % and 9.2 %, respectively. Temocillin resistance was found as 26.8% in these isolates. 3 (2.9 %) of 101 ESBL strains examined in the study were found resistant to fosfomycin. According to the results of the PCR test, no mcr-1 gene was found in colistin resistant strains. While the OXA-48 gene was found in 23.5 % of carbapenem resistant ESBL positive E. coli isolates and 47 % of K. pneumoniae isolates, OXA-48 gene was not detected in K. oxytoca isolates. Conclusions: The ertapenem resistance in the isolates included in our study was higher than other carbapenems. Although temocillin is not used in our country, high resistance to temocillin has been found. Although the frequency of mcr-1 gene is rarely seen in the world, the mcr-1 gene was not found in our study. The OXA-48 gene was less detected in imipenem resistant strains compared to ertapenem and meropenem resistant strains.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    418509

    Sebzelerde Genişlemiş Spektrumlu Beta Laktamaz (GSBL) üreten Enterobacteriaceae spp. izolatlarının antibiyotiklere dirençlilik durumlarının incelenmesi

    The analysis of antibiotic resistance situations of the Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) producing Enterobactericeae spp. isolates' in vegetables

    ÇİĞDEM SÖKMEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Mikrobiyolojiİstanbul Aydın Üniversitesi

    Gıda Güvenliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYDAR ÖZPINAR

  2. Tez No

    637373

    Toplum kökenli ve nozokomiyal sepsislerde etkenler ve direnç sorunu

    Pathogens and resistance problems in communi̇ty-acqui̇red and nosocomial sepsis

    MELTEM KARSLIOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYDIN DEVECİ

  3. Tez No

    358965

    Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli ve Klebsiella spp.'nin toplum taşıyıcılığı sıklığının ve enzim tiplerinin araştırılması

    Prevelance of the carriage of Extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella spp.in the community and investigating the types of enzymes

    DERYA ÇAKIR ERDOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiBülent Ecevit Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. FÜSUN CÖMERT

    DOÇ. DR. ELİF AKTAŞ

    DOÇ. DR. CANAN KÜLAH

  4. Tez No

    359361

    Kan kültürlerinden izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında plazmid aracılı beta-laktamaz direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of plasmid-mediated beta-lactamase resistance genes among extended spectrum beta-lactamase (ESBL) producing escherichia coli and klebsiella spp. isolates from blood cultures

    DİLEK KOCABAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CELAL KURTULUŞ BURUK

  5. Tez No

    453640

    Peynir örneklerinden izole edilen enterobakterilerde geniş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) ve AMPC dirençlilik durumlarının incelenmesi

    Investigation of the resistance status of extended spectrum beta-lactama (ESBL) and ampc in enterobacteriaceae isolated from cheese samples

    AYLİN ÖZADAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Beslenme ve Diyetetikİstanbul Aydın Üniversitesi

    Gıda Güvenliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. PROF.DR.HAYDAR ÖZPINAR

  6. Tez No

    361477

    Fosfomisinin üriner sistem enfeksiyonu etkeni olan enterobacterıaceae ailesi üyelerine karşı invitro etkinliği

    Başlık çevirisi yok

    BURCU KAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER KÜÇÜKBASMACI

Geri Dön