Üriner sistem enfeksiyonlarında enterobacterales ailesi etkenlerinin karbapenem direnci sıklığı ve direnç mekanizmalarının araştırılması
Investigation of carbapenem resistance frequency and resistance mechanisms of enterobacterales family in urinary tract infections
- Tez No: 663374
- Danışmanlar: PROF. DR. NEVRİYE GÖNÜLLÜ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Üriner sistem enfeksiyonu, Enterobacterales, Karbapenem direnci, CIM, PCR, Enterobacter, Karbapenemler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Üriner sistem, Üriner sistem enfeksiyonları, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-bakteriyel, Urinary system infection, Enterobacterales, Carbapenem resistance, CIM, PCR, Enterobacter, Carbapenems, Polymerase chain reaction, Urinary tract, Urinary tract infections, Drug resistance, Drug resistance-bacterial
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Üriner Sistem Enfeksiyonlarında Enterobacterales Ailesi Etkenlerinin Karbapenem Direnci Sıklığı ve Direnç Mekanizmalarının Araştırılması Amaç: Çalışmamızda üriner sistem örneklerinden izole ettiğimiz karbapenem dirençli Enterobacterales kökenlerinde, genotipik/fenotipik yöntemlerle direncin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Temmuz 2019-2020 sürecinde üriner sistem örneklerinden izole edilen, 46 Enterobacterales kökeni karbapenem direnci tespiti için CIM ve modifiye CIM uygulanmıştır. blaOXA-48, blaNDM, blaVIM, blaKPC, blaIMP genlerinin saptanması multipleks PCR'la gerçekleştirilmiştir. Karbapenem dirençli olan ve araştırılan karbapenem direnç geni saptanmayan olgulara tüm genom analizi yapılmıştır. Bulgular: 3242 Enterobacterales kökeninin 150 (%5)'si karbapenem dirençli saptanmış, 46'sı çalışmaya alınmıştır. Kökenlere CIM uygulandığında, 2 ve 4 saatlikte 43 (%94) köken pozitif bulundu. Modifiye CIM uygulandığında 4 saatlikte 44 (%97), 2 saatlikte 43 (%94) köken pozitif bulundu. PCR'la araştırılan direnç genlerinden blaOXA-48, blaNDM saptanırken blaVIM, blaKPC, blaIMP bulunamadı. blaOXA-48 %54 (25), blaNDM %26 (12), blaOXA-48 ve blaNDM birlikteliği %13 (6)'tü, %7 (3)'sinde ise araştırılan genlerden hiçbiri saptanmadı, bu kökenlere tüm genom analizi yapıldı. 1.kökende blaOXA-534, blaCMY-99 ve blaKPC-3, 2.kökende blaOXA-370 bulunurken 3.kökende direnç geni saptanmadı. Sonuç: İdrar kültürlerindeki Enterobacterales üyelerinde karbapenem direnci yüksek bulunmuştur. En sık direnç geni blaOXA-48 olmasına rağmen blaNDM-1 de sık olarak saptanmıştır. Ülkemizde daha önce belirlenmeyen direnç genleri belirlenmiştir. Direnç oranlarını takip etmek ve mekanizmaları saptamak bu etkenlerin yayılımı konusunda ve tedavi yaklaşımı belirlenmesinde büyük önem taşımaktadır. IX
Özet (Çeviri)
Investigation of Carbapenem Resistance Frequency and Resistance Mechanisms of Enterobacterales Family in Urinary Tract Infections Objectives: To determine the carbapenem resistance in Enterobacterales strains isolated from urinary system samples by genotypic/phenotypic methods. Method: CIM and modified CIM were applied to 46 Enterobacterales strains isolated from urinary tract samples between July 2019 and july 2020. blaOXA-48, blaNDM, blaVIM, blaKPC, blaIMP genes were investigated by multiplex PCR. Samples whithout resistance genes were analysed by whole genome sequensing. Results: 150 (5%) of 3242 Enterobacterales strains were found to be carbapenem resistant, 46 were included in the study. According to CIM, 43 (94%) strains were found positive at 2 and 4 hours. According to modified CIM, 44 (97%) strains were found positive in 4 hours and 43 (94%) in 2 hours. While blaOXA-48, blaNDM were detected among the resistance genes investigated by PCR, blaVIM, blaKPC, blaIMP were not found. blaOXA-48), blaNDM and blaOXA-48 and blaNDM combination were found in 54% (25 strains), 26% (12 strains), 13% (6 strains) percentages, respectively. In 7% (3) none of the investigated genes was detected and whole genome sequencing was performed. blaOXA-534, blaCMY-99 and blaKPC-3 genes in strain 1, blaOXA-370 gene in strain 2 and no resistance gene in strain 3 was detected. Conclusion: Carbapenem resistance was high in Enterobacterales strains isolated from urinary samples. Although the most frequent resistance gene was blaOXA-48, blaNDM-1 was also detected frequently. We identified resistance genes that were not previously detected in our country. Following up the rates and mechanisms of resistance is valuable to determine the spread and the therapeutic approach of these pathogens. XI
Benzer Tezler
- Yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen klebsiella SPP., escherichia coli, acinetobacter baumannii, pseudomonas aeruginosa izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının in vitro yöntemlerle saptanması ve fosfomisine direnç mekanizmalarının araştırılması
Investigation of in vitro antibiotic susceptibilities of escherichia coli, klebsiella pneumoniae, acinetobacter baumannii and pseudomonas aeruginosa isolated from urine cultures of inpatients and determination of the mechanisms of resistance to fosfomycin.
ŞEYMA NİGİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLŞEN HAZIROLAN
PROF. DR. DENİZ GÜR
- Yoğun bakım ünitesinde yatan hastalarda gelişen antibiyotik dirençli Enterobacteraleskan dolaşımı enfeksiyonları ve risk faktörleri
In patients hospitalized in the intensive care unit emerging antibiotic resistant Enterobacterales bloodstream infections and risk factors
FAHRİYE MELİS GÜRSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRAGÜL AKINCI
- Geriatrik hastalarda gram negatif bakterilerin neden olduğu kan dolaşım enfeksiyonları: Epidemiyoloji ve mortalite için risk faktörleri
Bloodstream infections caused by gram negative bacteria in geriatric patients: Epidemiology and risk factors for mortality
MUHAMMED ENES KARDAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLKNUR ERDEM
- Erişkin hastalarda idrar kültürlerinden izole edilen bakteriyel etkenler ve antibiyotik direnç profilleri; retrospektif bir analiz
Bacterial pathogens isolated from urine cultures in adult patients and their antibiotic resistance profiles: A retrospective analysis
DİLARA MAMUK SARITAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
Aile HekimliğiSağlık Bilimleri ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELMA PEKGÖR
DR. AYŞE RÜVEYDA UĞUR