Memelilerde oreksinerjik sistem evriminin biyoinformatik yöntemlerle incelenmesi
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 665580
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR ÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Oreksinerjik sistem, oreksin reseptörleri, ÇDH (Çoklu Dizi Hizalaması), varyasyon, filogenetik analiz, Orexinergic system, orexin receptors, MSA (Multiple Sequence Alignment), variation, phylogenetic analysis
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Üsküdar Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Oreksinerjik sistem uyku-uyanıklılığı kontrol eden nörotransmiter sistemleri içerisinde önemli bir rol tutan ve diğer nörotransmiter sistemleri üzerinde düzenleyici rol üstlenen bir nöropeptiderjik sistemdir. Oreksinin (preproorexin (PPO) G-protein-kenetli iki reseptörü tanımlanmaktadır: OX1R ve OX2R. Bu nöropeptidler, uyku / uyanıklık döngüsü, termoregülasyon, beslenme davranışı, bağımlılık davranışı, stres tepkileri, ağrı algısı, üreme, endokrin ve bağışıklık sistemleri dahil olmak üzere birçok fizyolojik sürecin düzenlenmesinde rol oynar. Oreksin A (OXA) ve oreksin B (OXB) uyku/uyanıklık döngüsünün düzenlemesinde benzer şekilde rol oynamasına rağmen, bu nöropeptitlerin gıda tüketimi, termoregülasyon ve endokrin sistem fonksiyonları gibi süreçlere katılımının doğasında bazı farklılıklar vardır. Oreksinerjik sistemin farklı memeli türlerinde ne gibi değişiklikler veya benzerliklere sahip olduğu son yıllarda gündemde olan bir konudur. İnsan türlerinde oreksinerjik sistemde tanımlanan birden fazla (köpeklerde tek bölge) doğal varyasyon bölgeleri mevcuttur. Bu doğal varyasyonlar proteinlerde farklı fonksiyon değişimi, yapısal değişim, sinyalleşme sistemini ve reseptör - ligand ilişkisini insan türünde etkilediği gibi yakın bulunan diğer türlerde de etkileyebilir. Yapılan tez çalışmasının amacı bu bölegeleri inceleyerek türler arası evrimsel bir iz bulmak ve elde edilen sonuçlarla ilerde oreksinerjik sistem üzerinde yapılan çalışmalara fayda katmaktır. Buna yönelik, oreksinerjik sistemin protein bileşenlerinin (PPO , OX1R ve OX2R) seçilen memeli türleridne filogenetik analizi yapıldı. Aynı zamanda her protein için türler arası MAFFT programı aracılığıyla dizi hizalaması yapılarak detaylı bölge incelenmesi gerçekleştirildi. Bununla beraber, oreksinerjik sistemde tanımlanan tüm doğal varyason bölgeleri tek tek incelenerek tüm türlerde bu bölgelerle ilgili analiz yapıldı. Son olarak her üç hedef protein için memeli türleri arasında MEGAX programı aracılığıyla filogenetik ağaçlar yapıldı.
Özet (Çeviri)
The orexinergic system is a neuropeptidergic system that plays an important role in the control of sleep-wakefulness states and it regulates other neurotransmitter systems. Two specific G-protein coupled receptors are identified for orexin A and B: OX1R and OX2R. These neuropeptides are involved in the regulation of many physiological processes, including the sleep / wakefullness cycle, thermoregulation, feeding behavior, addictive behavior, stress responses, pain perception, reproductive, endocrine and immune systems. Although orexin A and orexin B play similar roles in the regulation of sleep/wakefulness, there are differences in the nature of these neuropeptides' participation in the other vital processes, such as food consumption, thermoregulation and endocrine system functions. What kind of changes or similarities the orexinergic system has in different mammal species is an issue that has been on the agenda in recent years. There are many mutation and variation sites in the human orexinergic system (one site in dogs). These mutations and variations can affect a variety of functional changes, structural changes, signaling, and receptor-ligand relationships in humans, as well as in other species in the vicinity. The aim of the study is to find an evolutionary trail between species by studying these regions and to contribute to future studies of the orexinergic system with the obtained results. For this purpose, phylogenetic analysis of the orexinergic system proteins (orexin precursor protein, OX1R and OX2R) was performed among selected vertebrate species. At the same time, detailed regional analysis was performed by performing sequence alignment through the inter-species MAFFT program for each target protein separately. In addition, all mutation and variation regions defined in the orexinergic system were examined one by one and the analysis of these regions was performed in all selected species. Finally, phylogenetic trees were constructed among mammals species for all three target proteins through the MEGAX software.
Benzer Tezler
- Ratlarda postnatal gelişim sürecinde testis morfolojisinin stereolojik yöntemle incelenmesi
Investi?gati?on of development of the testi?s in the postnatal period of rats with stereological method
ESİN AKSAKAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
AnatomiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiAnatomi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARUN ÇIRALIK
- Molecular determinants of DNA methylation mechanismsin mammals
Memelilerde DNA metilasyon mekanizmasını belirleyen moleküler faktörler
DENİZ DOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyofizikDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EZGİ KARACA EREK
- Çinko eksik diyetle beslenen gebe sıçanların erkek yavrularında, çinko eksikliği ve uygulamasının testis ve karaciğerde relaksin ailesi peptidleri, oksidan sistem ve testosteron düzeyleri ile ilişkileri
The relationship of zinc deficiency and supplememation on testis and liver relaxin family peptides, oxidant system and testosterone levels in the male offspring pregnant rats fed with zinc deficient diet
HAMİYET KÖSE
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDULLAH SİVRİKAYA
- Peri-implantasyon döneminde sıçan endometriumunda wnt-β katenin yolağının angiogenetik faktörler üzerindeki rolü
The role of wnt-β catenin signaling on the angiogenetic factors in the rat endometrium during peri-implantation period
OZAN ÖNDER
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Histoloji ve EmbriyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CELAL KALOĞLU
- Memelilerde prion geninin (PRNP) biyoinformatik analizi
Bioinformatics analysis of prion gene (PRNP) in mammalian species
IŞIL TAKAN