Chemically induced assay for centriolar satellite mispositioning reveals their functions at the primary cilium
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 667755
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF NUR FIRAT KARALAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Koç Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Sentriyolar uydular, sentrozomlar ve silyumlar etrafında lokalize olan, hareket eden zarsız, elektron yoğun granüler yapılardır. Sentriyolar uyduların proteomu, sentrozom duplikasyonu, hücre bölünmesi, hücresel sinyalleri, birincil siliyum biyojenez ve mikrotübül dinamikleri gibi geniş bir işlev yelpazesinde yer alan 200'den fazla protein bileşeninden oluşur. Siliyopatilerde ve birincil mikrosefali hastalıklarında sentrozomal uydu yapılarının mutasyona uğramış çeşitli proteinleri tanımlanmış ve gelişme bozuklukları ile sentrozomal uydu proteinleri arasında yakın bir bağlantı olduğunu gösterilmiştir. Sentrozomal uydular, 60 yıldan uzun bir süre önce keşfedilmelerinden bu yana yeterince çalışılmamış yapılar olarak kalsa da, son çalışmalar, uyduların sentrozom / silium proteinlerini depoladığını, değiştirdiğini, taşınmasında görev aldığını ve sentrozom / siliyum biyogenezinin ile işlevinin düzenlenmesinde önemli roller oynadığı gösterilmiştir. Proteinlerin taşınması görevini üstlenmesi için sentrozomal uydu yapıları, sentrozom etrafında kümelenir ve hareket halinde bulunur. Bununla birlikte, uydu yapılarının hücre içinde dağılımı, hücre döngüsü ile ilgili moleküller gibi farklı uyaranlara yanıt olarak ve farklı hücre türleri arasında değişiklik gösterir. Bu da uyduların bulundukları bağlama göre farklı görevler üstlenebildiğini göstermektedir. Bu mekansal ve zamansal işlevleri incelemek, özellikle siliyumlu hücrelerde proteinin silinmesi veya susturulması gibi geleneksel yaklaşımları kullanarak zorlayıcı olmuştur. Bu zorlukların üstesinden gelmek için, sentriyolar uyduların hücre çevresine veya hücre merkezine verimli bir şekilde yeniden dağıtımına izin veren, kimyasal bazlı uyarılabilir bir protein taşınma yöntemi geliştirdim. Bu yöntemle, uydu yapılarının yanlış konumlandırması sağlanarak, sentrozomal protein hedeflemesi ve sekestrasyonunda uydu yapılarının rolünü belirlemekle birlikte, siliyum biyogenezinin anahtar düzenleyicilerinin uydu yapıları olduğunu gösterdim. Yanlış uydu konumlandırmasının işlevsel sonuçlarını belirlemek için, uyduların hücre zarına yanlış konumlandırıldığı hücrelerde, siliyum biyogenezini ve mikrotübül dinamiklerini araştırmak için fonksiyonel analizler kullandım. Bu analizlerin sonuçları, uyduların birincil siliyum oluşumu, korunması ve parçalanmasını düzenlediği gösterilmiştir. Birlikte ele alındığında, sonuçlarımız uydu fonksiyonları ile bunların siliye eden hücrelerde pericentrozomal kümelenmeleri arasında doğrudan bir bağlantı olduğunu göstermiş ve ayrıca uyduların akut fonksiyonlarını içeriğe bağlı bir şekilde incelemek için yeni bir araç sağlamıştır. Son olarak, Hedgehog sinyalizasyonu gibi gelişimsel açıdan önemli sinyal yollarının sinyalleme merkezi olarak birincil siliyerin hayati rolleri göz önüne alındığında, sonuçlarımız, uydu proteinlerinin gelişimsel bozukluklarda neden mutasyona uğradığına ışık tutuyor.
Özet (Çeviri)
Centriolar satellites are membrane-less, electron dense granular structures that localize and move around centrosomes and cilia. The satellite proteome is composed of over 200 protein components, which were implicated in a wide range of functions such as centriole duplication, cell division, cellular signaling, primary cilium biogenesis and microtubule dynamics. Importantly, various proteins mutated in ciliopathies and primary microcephaly were also identified as part of the satellite proteome, suggesting an intimate link between centriolar satellite function and development. Although centriolar satellites have remained as understudied structures since their discovery more than 60 years ago, recent work showed that satellites store, modify and traffic centrosome/cilium proteins and play important roles in the regulation of centrosome/cilium biogenesis and function. To mediate their trafficking function, satellite cluster and move around centrosomes in most cell types. However, satellite distribution varies in response to different stimuli such as cell cycle cues and across different cell types, suggesting context-dependent functions for satellites. Dissecting these spatial and temporal functions have been challenging using traditional approaches such as loss-of-function studies, in particular, in ciliated cells. To overcome these challenges, I developed a chemical based inducible trafficking assay that allows efficient redistribution of centriolar satellites to cell periphery or cell center. Using this assay, I showed that satellite mispositioning disrupts centrosomal targeting of key regulators of cilium biogenesis, identifying a direct role for satellites in centrosomal protein targeting and sequestration. To identify the functional consequences of satellite mispositioning, I used functional assays to probe cilium biogenesis and microtubule dynamics in cells where satellites were mispositioned at the membrane. The results of these assays showed that satellites regulate primary cilium assembly, maintenance and disassembly. Taken together, our results showed a direct link between satellite functions and their pericentrosomal clustering in ciliated cells and also provided a new tool for studying acute functions of satellites in a context-dependent way. Finally, given the crucial roles of the primary cilium as the signaling center for developmentally important signaling pathways such as Hedgehog signaling, our results sheds light into why satellite proteins are mutated in developmental disorders.
Benzer Tezler
- Fındık zurufu kompostunun toprak kalitesi üzerine etkisi
The effect of adding of hazelnut husk compost on soil quality
SELAHATTİN AYGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatOrdu ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TAYFUN AŞKIN
- Samsun ve çevresinde üretilen manda yoğurtlarının bazı özellikleri üzerine bir çalışma
A study on some properties of buffalo yoghurts produced samsun and vicinity
GÖKÇE BAYRAM
- High pressure diffusion coefficients of carbon dıoxide in the ionic liquid [bmim][bf4
Karbondi̇oksi̇ti̇n [bmim][bf4] i̇yoni̇k sıvısı i̇çeri̇si̇ndeki̇ yüksek basınç yayınım katsayıları
ÖMER BARIŞ EMEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Kimya MühendisliğiYeditepe ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BETÜL ÜNLÜSÜ
- Çinko katkılı antibakteriyel özellikte hidroksiapatit üretimi ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of zinc-doped antibacterial hydroxyapatite
SÜLEYMAN ÇINAR ÇAĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Makine MühendisliğiMersin ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖNDER ALBAYRAK
- Uçucu organik bileşiklerin nem etkisi göz önünde bulundurularak sınıflandırılmaları ve miktarlarının tespiti
The classification and determination the quantity of volatile organic compounds considering the amounts of moisture
FATİH GÖKÇİMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiDumlupınar ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET ALİ EBEOĞLU