Geri Dön

Yeşil floresan protein ifadeleyen escherichia coli hücre fabrikalarda fenotipik heterojenitenin adaptasyona etkisi

Impact of phenotypic heterogenity in green flouresance protein expressing escherichia coli cell factories on adaptation

PDF İndir

  1. Tez No: 678870
  2. Yazar: SENİHA GÖZDE ERTÜZÜN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EVREN DORUK ENGİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 109

Özet

Gelişen Biyoteknoloji uygulamalarının getirdiği en büyük katkılardan biri heterolog protein üretimidir. Sentetik biyoloji ve genetik mühendisliği sayesinde heterolog protein eldesi için kolay manipüle edilebilen, hızlı, düşük maliyetli ve yüksek verimli mikrobiyal hücre fabrikaları üretimi mümkün hale gelmiştir. Mikrobiyal hücre fabrikalarından elde edilen birçok kimyasal ve bileşen, endüstriyel ve sağlık sektörleri başta olmak üzere birçok alanda rol almaktadır. Hücre fabrikaların oluşturulmasında kullanılmak üzere kurgulanan hücrelerin gürbüz, yüksek biyokütle ve verime sahip olmalarının yanında ürettikleri peptidlerin fonksiyonel ve çözünür nitelikte olmaları büyük önem taşır. İfadelenecek gen her ne kadar rasyonel tasarımlarla hücreye aktarılmış olsa da hücre bankalarının istenilen özelliklerde oluşturulması büyük ölçüde evrimsel süreçler ile mümkün olmaktadır. Bu tez çalışmasında, T7 promotörü kontrolünde yeşil floresan protein üreten ΔrecA ve ΔmutS genotipe sahip E. coli hücre fabrikaları elde edilmiştir. Hücrelerin düşük ve yüksek heterolog rekombinant protein ifade heterojenitesi gösterdikleri fermantasyon koşulları optimize edilmiş ve bu koşullarda pasajlar boyunca indüklenen kültürlerin proteomik ve genomik parmak izi profillemesi yapılmıştır. Böylece, genetik olarak stabil ΔrecA bakteriler ile nokta mutasyonlar geliştirmeye yatkın ΔmutS hücre fabrikalarının adaptasyon hızları karşılaştırılmıştır.

Özet (Çeviri)

Heterologous protein production is one of the biggest contributions that developing biotechnology applications bring. Thanks to synthetic biology and genetic engineering, it becomes possible to produce easy to manipulate, fast, cost effective and high yield protein producing microbial cell factories. The chemicals and products obtaining from microbial cell factories have been used for industrial and health purposes and in other areas. It is incredibly important that the cells that is programmed to be cell factories should be robust with having high biomass and yield, besides being able to produce functional and soluble peptides. Although how well the circuit is designed, creating such microbial cell factories is up to evolutional processes, mostly. In this thesis study, two genetically different Escherichia coli cell factories, one has ΔrecA genotype and other has ΔmutS genotype, that produce green fluorescent protein under T7 promoter were created. The fermentation conditions which made the cells produce high and low recombinant protein expression heterology were optimized and the cells were passaged under these conditions. Then the passaged cultures were analyzed by genomic and proteomic finger printing. Therefore, adaptation rate of genetically stabile ΔrecA cell factories and the ΔmutS cell factories that tend to have point mutation were compared.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    339907

    Detecting g-protein coupled receptor interactions using enhanced green fluorescent protein reassembly

    Geliştirmiş yeşil floresan proteinin yeniden birleşmesi kullanılarak g proteine kenetli reseptörlerin eşleşmesinin tespiti

    GÖZDE KUMAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Bölümü

    YRD. DOÇ. DR. ÇAGDAS DEVRİM SON

    YRD. DOÇ. DR. TÜLİN YANIK

  2. Tez No

    625878

    Model bı̇r yeşı̇l flöresan proteı̇n ı̇çı̇n aptamer üretı̇mı̇nı̇n ve optı̇k bı̇yosensörlerde uygulanmasının araştırılması

    Investigation of aptamer production for a model green fluorescent protein and its application to optic biosensors

    DİLBER ECE AKGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET MUTLU

  3. Tez No

    242460

    İki farklı genin (Güçlendirilmiş yeşil floresan protein geni, insan gamma interferon geni) ayrı ayrı veya birlikte mikroenjeksiyonunun transgenik fare eldesi üzerine etkilerinin araştırılması

    Effects of seperate or simultaneous injection of two different genes (Enhanced green-fluorescence protein gene, human gamma interferon gene) on transgenic mice recovery

    KORHAN ARSLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    GenetikErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAYDAR BAĞIŞ

    PROF. DR. MUNİS DÜNDAR

  4. Tez No

    815597

    UnaG floresan proteinin ITO yüzeylere immobilizasyonu

    Immobilization of UnaG fluorescent protein on ITO surfaces

    ONUR YÜCEDAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyomühendislikKaramanoğlu Mehmetbey Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YAKUP ULUSU

    DR. NUMAN ECZACIOĞLU

  5. Tez No

    909620

    Rekombinant DNA teknolojisi ile floresan protein üretimi

    Fluorescent protein production with recombinant DNA technology

    EBRU KABOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GAYE ÖNGEN ÖZGEN

    PROF. DR. SERAP EVRAN

Geri Dön