Geri Dön

Identification of cellular stress related biomolecules for eventual use in targeted therapies of hepatocellular carcinoma

Hepatosellüler karsinom hedefli tedavilerinde kullanılmak üzere hücresel stres kaynaklı biyomoleküllerin belirlenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 695605
  2. Yazar: DAMLA GÖZEN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON, PROF. DR. RENGÜL ATALAY
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Biotechnology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Enformatik Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 122

Özet

Hepatosellüler karsinom (HCC) en sık görülen ve ölümcül kanser türlerindendir. HCC hücreleri oksidatif stres gibi farklı stres durumlarına karşı genellikle dirençlidirler. HCC tedavisinde kullanılan geleneksel yöntemlerin etkinliği kanser hücrelerinin kazandığı direnç ve hedef dışı etkilerden dolayı düşüktür. Bu tez çalışmasındaki amaç, HCC hücre hatlarının oksidatif stresle alakalı gen ifade profillerini inceleyerek yeni tanı ve tedavi yöntemlerinde hedeflenebilecek genleri belirlemektir. Reaktif oksijen türlerine dirençte kritik olan genlerin belirlenmesi için Selenyum eksikliğine bağlı oksidatif stres modeli incelenmiştir. Transkriptom gen ifade analizi verileri incelenerek Selenyum eksikliğine bağlı oksidatif strese duyarlı ve dirençli HCC hücre hatları arasında farklı ifade edilen genler belirlenmiştir. Bu genler ağ analizi yöntemleri ile incelenmiş ve 27 genin anahtar rollerinin olduğu bulunmuştur; bunlardan 16'sının daha önceki çalışmalarda karaciğer kanser hastalarının sağ kalımında etkili olduğu gösterilmiştir. Ayrıca, bu genlerin çoğunun ifadesinin p53-MDM2 yolağında görevli genlerle ilişkili olduğu bulunmuş ve p53-MDM2 interaksiyon inhibitörlerinin 4 HCC hücre hattı üzerindeki sitotoksik etkileri potansiyel tedavi olarak test edilmiştir. İki bileşiğin HCC hücre apoptozuna yol açtığı ve p53'ün nükleusa lokalizasyonunu sağladığı gösterilmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada belirlenen genler yeni tanı ve tedavi yaklaşımlarında hedeflenmek üzere önerilmektedir ve p53-MDM2 inhibitörleri HCC tedavisinde potansiyel taşımaktadır.

Özet (Çeviri)

Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common and deadly cancer types. HCC cells generally display increased resistance to various stress conditions such as oxidative stress. There are conventional therapies used in treatment of HCC but their efficacies are low due to resistance gained by cancer cells and off-target effects. In this thesis study, the aim is to analyze oxidative stress-related gene expression profiles of HCC cell lines to determine genes that could be targeted in novel diagnostic and therapeutic strategies. Selenium (Se) deficiency dependent model of oxidative stress was utilized to identify the genes that are involved in resistance to oxidative stress. The results of a transcriptome-wide gene expression data were analyzed in which differentially expressed genes (DEGs) were identified between HCC cells that are either resistant or sensitive to Se-deficiency dependent oxidative stress. They were further investigated for their importance by cell signaling network analysis. 27 genes were defined to have key roles; 16 of which were previously shown to have impact on patient survival with primary liver cancer. Moreover, the expression of the majority of these genes were found to be correlated with p53-MDM2 pathway. Hence cytotoxic effects of novel small molecules targeting p53-MDM2 protein-protein interaction were tested on 4 HCC cells. Two compounds were shown to induce apoptosis in HCC cells and led to nuclear localization of p53. Altogether, genes identified in this study are proposed to be novel targets for diagnostic and therapeutic approaches and the p53-MDM2 inhibitors have potentials in HCC treatment.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    384326

    Çinko ve selenyumun antioksidan özelliklerinin oksidatif stres indüklü DNA radikallerinin immün-spin-yakalama yöntemi kullanılarak incelenmesi

    Investigation of antioxidant properties of zinc and selenium on oxidative stress-induced dna radicals by immuno-spin-trapping technique

    VEDİA DELETİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyofizikAnkara Üniversitesi

    Biyofizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BELMA TURAN

  2. Tez No

    336854

    The role of Protein Kinase R in lipotoxicity

    Protein Kinaz R'nin lipotoksisitedeki rolü

    BÜŞRA YAĞABASAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyoteknolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. EBRU ERBAY

  3. Tez No

    563513

    Mechanisms of autophagy control through microRNAs under cellular stress

    Hücresel stres koşulları altında otofajinin mikroRNAlar ile kontrolü

    DENİZ GÜLFEM ÖZTÜRK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyomühendislikSabancı Üniversitesi

    PROF. DR. DEVRİM GÖZÜAÇIK

  4. Tez No

    657868

    Süs bitkilerinde abiyotik ve biyotik stresle ilişkili miRNA'ların in siliko belirlenmesi

    In silico determination of abiotic and biotic stress related miRNAs in ornamental plants

    SERVET BOZKURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyoteknolojiAmasya Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEVGİ MARAKLI

  5. Tez No

    498488

    Psödoeksfoliasyon sendromu ve glokomu ile clusterin genetik polimorfizmleri ve clusterin gözyaşı ve aköz humor seviyeleri arasındaki ilişkinin incelenmesi

    Investigation of the relationship between clusterin genetic polymorphisms and clusterin level of tear and aqueous humor in pseudoexfoliation syndrome and glaucoma

    SİNEM DEMİRKAYA BUDAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiTOBB Ekonomi ve Teknoloji Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİRSEN CAN DEMİRDÖĞEN

Geri Dön