Oral skuamöz hücreli karsinomda GNG7 geninin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin incelenmesi
Investigation of methylation and expression levels of theGNG7 gene in oral squamous cell carcinoma
- Tez No: 704253
- Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Onkoloji, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Deneysel ve Moleküler Onkoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Çalışmamızda, Demokan ve arkadaşlarının 2013 yılında yayınladıkları Kuzey Amerikalı baş boyun kanserli hastalar ile yaptıkları çalışmalarında bu grubun bir alt grubu olan oral kavite kanserli hastalarda (n=9) tümör süpresör bir gen olan GNG7'nin %88,9 oranında metilasyonuna rastlanmış, söz konusu genin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin daha geniş sayıda oral skuamöz hücreli karsinomlu (OSCC) Türk hasta grubunda incelenmesi amaçlanmıştır. İnvaziv/non-invaziv yöntem geliştirerek OSCC'de tanı/erken teşhiste GNG7'nin biyomarker olarak kullanılabilirliğinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Çalışmamızda OSCC tanısı almış 50 hastaya ait ameliyat sonrasında elde edilmiş tümör, eşlenik normal doku örnekleri ve ameliyat öncesi toplanan serum örnekleri ile 10 sağlıklı bireyin normal mukoza ve serum örneklerinden DNA izolasyonu yapılarak GNG7 geninin metilasyon ve ekspresyon seviyeleri incelenip, metilasyona bağımlı/bağımsız ekspresyon analizleri gerçekleştirildi. Metilasyon analizi için QMSP, ekspresyon düzeylerinin analizi için ise QRT-PCR yöntemleri uygulanmıştır. Tümör dokusunda eşlenik normal dokuya oranla hastaların %48'inde (24/50) ekspresyon seviyesinde azalış, %32'sinde (16/50) ekspresyon seviyelerinde artış tespit edilmiştir. Dokuz hastaya (%18) ait tümör dokusunda genin promoter bölgesinde metilasyon gözlenirken, eşlenik normal doku ve serum örneklerinde metilasyona rastlanmadı. Metilasyon saptanan 9 hastanın 7'sinde (%77,8) ekspresyon oranında azalma gözlenirken, 2 hastada ekspresyon artışı bulundu. Tüm hastaların normal doku ve serum örnekleri ile sağlıklıların doku ve serum örneklerinde GNG7metilasyonu tespit edilmedi. Metilasyon gözlenen OSCC hastalarında sağlıklı bireylere oranla 35 kat ekspresyonunda azalma saptandı. Ekspresyon seviyesinde artış ile nüks arasında (p=0,05) ve sigara kullanımına bağlı olarak ekspresyon seviyelerindeki artış ve azalış arasında ileri derecede istatistiksel anlamlılık tespit edilmiştir (p=0,0001).GNG7 geninin OSCC hastalarının alt gruplarında yapılacak daha geniş popülasyon içeren çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. GNG7 geninin, OSCC'nin tanı/erken teşhis ve takibinde biyomarker olarak kullanılabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Demokan et al. identified 88.9% methylation of GNG7, a tumor suppressor gene, among patients with oral cavity cancer (n=9), a subgroup of head and neck cancer patients, in their study with North American head and neck cancer patients published in 2013. We hope to define the applicability of GNG7 as a biomarker for diagnosis / early diagnosis of OSCC by establishing an invasive/noninvasive technique. In this investigation, we collected tumor, normal, and serum samples from 50 patients with OSCC who were diagnosed and treated, as well as normal mucosal tissue and serum samples from 10 healthy individuals. The ratio of methylation and expression of the GNG7 gene, as well as the downregulation of the expression ratio due to methylation, were studied after the DNA was isolated. To demonstrate methylation, the QMSP method was utilized, and the QRT-PCR method was used to define expression levels. While decreased expression levels were found in 48% (24/50) of tumor tissue after the study, increased expression levels were found in 32% (16/50). No significant change in expression levels was observed in 20% (10/50) of the patients. Methylation was identified in the promoter region of the gene in 18% (9/50) of the patients' tumor tissues. Reduced expression levels were seen in 7 of 9 (77.8%) of the patients who had methylation. In matched-normal OSCC tissue and serum samples, as well as normal mucosa and serum samples from healthy people, no methylation was identified. The gene's expression was shown to be 35 fold lower in OSCC patients with methylation than in the general population. After research with larger numbers of OSCC patients, it may be able to use the GNG7 gene, which has no methylation in healthy people, as a biomarker for OSCC early diagnosis and follow-up.
Benzer Tezler
- Oral skuamöz hücreli karsinomda ve risk taşıyan bireylerde PI3K ve wnt sinyal yolakları ile ilişkili miRNA ve proteinlerin biyobelirteç olarak araştırılması
Investigation of miRNAs and protein biomarkers associated with PI3K and wnt signaling pathways in oral squamous cell carcinoma and risk groups
HATİCE ZİŞAN ASAL KILIÇ
- Oral skuamöz hücreli karsinomda GABRB2 geninin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin incelenmesi.
Investigation of methylation and expression levels of GABRB2 gene in oral squamous cell carcinoma
SENA ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Genetikİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
- Oral skuamöz hücreli karsinomda Glycophorin C (GYPC) geninin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin incelenmesi.
Investigation of methylation and expression levels of Glycophorin C (GYPC) gene in oral squamous cell carcinoma.
METEHAN KARATAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
- Oral skuamöz hücreli karsinomda thioredoxin interacting protein (TXNIP) geninin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin incelenmesi
Investigation of methylation and expression levels of thioredoxin interacting protein (TXNIP) gene in oral squamous cell carcinoma
İLKER ERDİNÇ ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Kulak Burun ve Boğazİstanbul ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT ULUSAN
- Oral skuamöz hücreli karsinomda znf238 geninin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
ÖNDER ERYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Onkolojiİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA DEMOKAN