Determination and identification of bacterial soft rot pathogens on potato tubers in Erbil province-Iraq
Irak-Erbil ilinde patates yumrularında bakteriyel yumuşak çürüklük patojenlerinin belirlenmesi ve tanımlanması
- Tez No: 705186
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET AKKÖPRÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Ekonomik açıdan en önemli ürünlerden biri olan Patates dördüncü ana gıda grubu olarak kabul edilir. Patates yumuşak çürüklüğü, Pectobacterium ve Dickeya türleri gibi çeşitli bakteriyel patojenler tarafından oluşturulur. Dünya çapında patates yumrularını etkileyen başlıca yıkıcı hastalıklardan biridir. Bu çalışma, Irak, Erbil bölgesinde patates yumuşak çürüklük hastalığına neden olan bakteriyel patojenleri geleneksel ve moleküler yöntemlerle belirlemeyi amaçlamaktadır. Örnekler Irak-Erbil ilinin çeşitli lokasyonlarındaki depo ve tarlalarda toplanmıştır. İzole edilen aday patojen bakteri izolatları ile biyokimyasal ve fizyolojik testler (KOH, oksidaz, katalaz, aşırı duyarlılık reaksiyonu, patojenite testi ve CVP ortamı) testler yapılmıştır. DNA izolasyonu yapılan patojen bakterilerin 16S rRNA bölgeleri PCR çalışması ile çoğaltılarak dizi analizi çalışması yapılmıştır. Çalışma sonucunda Erbil ilinde baskın yumuşak çürüklük patojeninin Pectobacterium carotovorum subsp. caratovorum olduğu bunu takiben Dickeya dianticola ve Dickeya solani'nin geldiği belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
The potato crop is one of the most economically important crops and is considered the fourth main food crop in the world. Potato soft rot is one of the major destructive diseases affecting potato tubers worldwide caused by several bacterial species such as Pectobacterium and Dickeya species. This study aims to identify the causal agent of potato soft rot disease using conventional methods and molecular approaches and then create a phylogenetic tree for close related strains of bacteria. After the samples were collected in storage and fields in various locations of Erbil province-Iraq, then the bacteria were isolated and cultured for different biochemical and physiological tests, including (KOH, oxidase, catalase, hypersensitivity reaction, pathogenicity test, and CVP medium). The positive results were obtained. Then as a molecular approach, DNA was extracted from the bacterial isolates, and PCR was carried out by using a specific primer to amplify the 16S rRNA gene of pathogenic bacteria. So far, this is the first study where Pectobacterium carotovorum, Dickeya dianticola, and Dickeya solani were identified by using PCR and sequencing approaches in Erbil province-Iraq.
Benzer Tezler
- Hatay ili havuç (Daucus carota L.) üretim alanlarında bakteriyel hastalık etmenlerinin tespiti ve Pectobacterium carotovorum'un biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması
Determination of bacterial disease agents in Hatay province carrot (Daucus carota L.) production areas and investigation of the possibilities of biological control against of Pectobacterium carotovorum
RESUL VARHAN
Doktora
Türkçe
2024
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADEM BOZKURT
- Aydın ve İzmir illeri bezelye üretim alanlarında görülen bakteriyel hastalıkların saptanması
Determination of bacterial diseases on pea growing areas of Aydin and Izmir provinces
DUYGU ERTAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL BENLİOĞLU
- Geleneksel Dolaz peyniri ürün karakteristiklerinin belirlenmesi ve üretim standardizasyonu
Determination of traditional Dolaz cheese characteristics and standardization of the production
ÖZGE DUYGU OKUR
Doktora
Türkçe
2010
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP BANU SEYDİM
- Tulum peynirinden izole edilen laktik asit bakterilerinin tanımlanması ve anti-listerial etkilerinin araştırılması
Identification of lactic acid bacteria isolated from tulum cheese and determination of the anti-listerial activity
ÖZNUR HIZARCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK HEPERKAN
- Karadeniz bölgesine ait geleneksel peynir çeşitlerinden izole edilen laktik asit bakterilerinin identifikasyonu ve starter kültür olarak kullanım potansiyelleri
Identification of lactic acid bacteria isolated from the traditional cheese and determination of starter culture properties from Black Sea region
GÖKHAN ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiGiresun ÜniversitesiBiyosüreç Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELİN KALKAN