Intramolecular hydrogen bonding incyclic peptides and depsipeptides
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 708711
- Danışmanlar: DR. LASZLO FABİAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Moleküler Tıp, Biochemistry, Bioengineering, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: University of East Anglia
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 28
Özet
Özet yok.
Özet (Çeviri)
Most of the cyclic peptides (CPs) and depsipeptides (CDPs) have low oral bioavailability. Intramolecular hydrogen bonds (IMHBs) in CPs/CDPs can increase their bioavailability. By investigating crystal structures in Cambridge Structural Database (CSD), 143 CPs and 19 CDPs containing IMHBs were identified. CPs with odd-numbered amino acids (aa) contain IMHBs at a higher ratio. Examination of aa showed that existence of alanine was positively affecting and existence of glycine was negatively affecting the IMHB formation. There are 326 H-bonded pseudo-rings in CPs, 58% of which are 10-membered rings (C10) and 17% of which are 14- membered rings (C14). Observation of C14 was unexpected. Among all peptides deposited to CSD, C10 are the most likely rings to be observed, with 43% frequency. Ramachandran plots of φ/ψ torsions in different pseudorings revealed the conformational preferences of these rings. Molecular dynamic simulations were run on a selected CP with two different force fields (RSFF2 and ff19SB) for 50 ns. RSFF2 was found to better reproduce the crystal structure conformation of CP. It was mostly stable during the simulation but partially lost its rigidity after some time.
Benzer Tezler
- Intramolecular hydrogen bonding in cyclic peptides and depsipeptides
Başlık çevirisi yok
ÖMER MİRAÇ APAYDIN
- The synthesis and characterization of methacrylate based hydrogen bonded liquid crystalline polymers
Metakrilat bazlı hidrojen bağlı sıvı kristal polimerlerin sentez ve karakterizasyonu
CEREN AYTAÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik ÜniversitesiPolimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. B. FİLİZ ŞENKAL
- Synthesis and characterization of methacrylate based hydrogen bonded liquid crystal polymers
Yeni kalgon bazlı sıvı kristal polimerlerin sentezi ve incelenmesi
BURAK KORKMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAHİRE FİLİZ ŞENKAL
- Cellulose membranes for organic solvent nanofiltration
Organik çözücü ile nanofiltrasyon uygulamalarına yönelik selüloz membranların hazırlanması
FAQIH MUHAMMAD SUKMA
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Kimya MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. PINAR ZEYNEP ÇULFAZ EMECEN
- Syntheses and characterization of benzimidazole containing polymers: A comparitative study on donor unit effect and influence of H-bonding
Benzimidazol içeren polimerlerin sentezi ve karakterizasyonu: Donör ünitesinin ve H-bağının etkileri üzerine karşılaştırmalı bir çalışma
AYDA GÖYÇEK NURİOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
KimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT KAMİL TOPPARE
DOÇ. DR. ALİ ÇIRPAN