Investigating G-quadruplex structures in Mcl-1 pre-mRNA
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 712058
- Danışmanlar: DR. CYRİL DOMİNGUEZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Microbiology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: University of Leicester
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Özet yok.
Özet (Çeviri)
Programmed cell death (apoptosis) is a process that causes morphological changes on cells. The Bcl-2 family proteins are significant regulators of apoptosis which either induce or inhibit programmed cell death. The Bcl-2 family member protein, Mcl-1 (myeloid cell leukaemia-1) is an anti-apoptotic protein which has a significant role in the control of apoptosis. Mcl-1 can undergo alternative splicing to produce two antagonistic isoforms, Mcl-1L and Mcl-1S. The Mcl-1L isoform is anti-apoptotic, whilst the alternatively spliced Mcl-1S isoform is proapoptotic. Previous unpublished studies in the laboratory suggested that Mcl-1 splicing could be influenced by the presence of G-quadruplex (G4), a four-stranded structure formed at Guanine-rich (G-rich) regions in DNA and RNA sequences. Bioinformatic studies suggest that within the Mcl-1 pre-mRNA G4 may be forming in the G-rich region of its sequence and might alter the 5' splice site selection. Therefore, G4 might influence whether the anti-apoptotic Mcl1L or the pro-apoptotic Mcl-1S is produced. To ascertain the effect of the G4 on Mcl-1 alternative splicing, we have investigated the presence of G4 in the Mcl-1 pre-mRNA, using Electromobility Shift Assay (EMSA), with G4 specific antibody (BG4). Following this, potential G4's were identified by replacing guanines with 7-deaza-G. This would prevent the formation of G4's. Furthermore, the location of potential G4's were mapped by using RNase H assay. In this study, we have identified 1 or 2 G4s in the Mcl-1 pre-mRNA. These G4s are located in the putative regions Q2 or Q5, suggesting that they are effecting splicing.
Benzer Tezler
- Investigating the effects of environmental conditions on PIM1 DNA structures and the Doxorubicin binding
Çevresel koşulların PIM1 DNA yapıları ve Doksorubisin bağlanması üzerindeki etkilerinin araştırılması
SABA OROUJI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGÜL PERSİL ÇETİNKOL
PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Optimization of molecular modeling strategies for challenging blind docking
Zorlu kör kenetleme için moleküler modelleme stratejilerinin optimizasyonu
ECEM SEKKİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimyagerlik Ana Bilim Dalı
DOÇ. ÖZGÜL PERSİL ÇETİNKOL
DR. ANTOINE PAUL GUILLAUME MARION
- Synthesis of highly fluorescent N, S co-doped carbon quantum dots and their application in fluorometric detection of G-quadruplex forming HER2 promoter region
Yüksek fluorsanlı N,S ortak katkılı karbon kuantum noktalarının sentezi ve G-dörtlü yapısı oluşturan HER2 promoter bölgesinin florometrik tespitinde uygulaması
ZEYNEP İREM BULUT
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
KimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGÜL PERSİL ÇETİNKOL
- Denovo sentezlenen antrakinon türevlerinin pankreas kanseri hücre kültüründe etkinliğinin araştırılması
Investigation of the efficacy of Denovo synthesized anthraquinone derivatives in pancreatic cancer cell culture
SAMET DEMİRCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Genel CerrahiPamukkale ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BURHAN KABAY
- Denovo sentezlenen suda çözünebilir ftalosiyanin bileşiklerinin pankreas tümör modelinde etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of denovo synthesized water-soluble phthalocyanine compounds in a pancreatic tumor model
SERKAN GİRAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Genel CerrahiPamukkale ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVDA YILMAZ