Suda çözünen ftalosiyanin bileşiklerin paralel ve hibrit g-quadrupleks dna moleküllerin etkileşiminin incelenmesi
Investigation of the interaction of water soluble phthalocyanine compounds parallel and hybrid g-quadruplex dna molecules
- Tez No: 712501
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ESRA BAĞDA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 70
Özet
G-quadrupleks DNA'lar telomerler gibi genomun guanince zengin dizilerinde açığa çıkan ikincil DNA katlanmalarıdır. Kanser hücrelerinin artan metabolik faaliyetleri nedeni ile G-quadrupleks yapılarının oluşum sıklığı artmaktadır. G-quadrupleks yapılarının oluşması ve yapılarının çeşitli ligantlarla stabil hale gelmesi, DNA'nın transkripsiyon, translasyon gibi süreçlerde gerekli olan düz zincirleri haline geçmesini engelleyeceği için, hücre proliferasyonunda sekteler yaratabilmektedir. Dolayısı ile bu DNA yapıları önemli antikanser ilaç hedefleridir. Düzlemsel yapıları ve konjüge π sistemleri ile ftalosiyaninler G-quadrupleks için önemli ligandlardır. Suda çözünürlüğü ve singlet oksijen verimi yüksek ftalosiyaninlerin G-quadruplekslerle etkileşimleri incelemek fotodinamik tedavide kullanım potansiyeli olan bileşiklerin bu potansiyellerini açığa çıkarmak açısından önemlidir. Tez kapsamında suda çözünür MnPc ve ZnPc bileşiklerinin paralel ve hibrit konformasyona sahip G-quadrupleks DNA'larla etkileşimleri incelendi. Etkileşimler moleküler absorpsiyon spektroskopisi ile incelenerek KD sabitleri hesaplandı. DNA-ftalosiyanin etkileşimlerine dair stokiyometrik oranlar Job yöntemi ile belirlendi. G-quadrupleks konformasyonuna ftalosiyanin etkisi CD spektroskopisi ile incelendi. Kapiler jel elektroforez çalışmaları ile etkileşimlerin varlığı desteklendi.
Özet (Çeviri)
G-quadruplex DNAs are secondary DNA structures that occur in guanine-rich sequences of the genome, such as telomeres. Due to the increased metabolic activities of cancer cells, the frequency of formation of G-quadruplex structures is increasing. Since the formation of G-quadruplex structures and their stabilization with various ligands will prevent DNA from turning into straight chains, which are necessary in processes such as transcription and translation, it may cause disruptions in cell proliferation. Therefore, these DNA constructs are important anticancer drug targets. With their planar structure and conjugated π systems, phthalocyanines are important ligands for the G-quadruplex. Examining the interactions of phthalocyanines with high water solubility and high singlet oxygen yield with G-quadruplexes is important in terms of revealing these potentials of compounds with potential for use in photodynamic therapy. Within the scope of the thesis, the interactions of water-soluble MnPc and ZnPc compounds with G-quadruplex DNAs with parallel and hybrid conformation were investigated. KD constants were calculated by examining the interactions by molecular absorption spectroscopy. Stoichiometric ratios of DNA-phthalocyanine interactions were determined by the Job method. The effect of phthalocyanine on the G-quadruplex conformation was investigated by CD spectroscopy. The existence of interactions was supported by capillary gel electrophoresis studies.
Benzer Tezler
- Synthesis of pyridine substituted phthalocyanines and their DNA binding properties
Piridin sübstitüe ftalosiyaninlerin sentezi ve DNA bağlanma özelliklerinin incelenmesi
MARYAM MOEINI ALISHAH
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA BAYIR
- Suda çözünür kuaterner amin türevli tetra sübstitüe metalli ftalosiyaninlerin sentezi
Synthesis of water-soluble tetra substituted metallophthalocyanines derived with quaternary amine
BETÜL HİKMETUMUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESİN HAMURYUDAN
- Simetrik ve asimetrik ftalosiyaninlerin sentezi
Synthesis of symmetrically and unsymmetrically substituted phthalocyanines
YASİN ARSLANOĞLU
- Farklı sübstitüe ftalonitril ve ftalosiyanin türevlerinin sentezi
Synthesis of different substituted phthalonitriles and phthalocyanines
MELİKE BÜŞRA ZORLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESİN HAMURYUDAN
- Alkil ftalodinitril türevlerinin sentezi ve ftalosiyaninlerinin hazırlanması
Synthesis of the alkylphthalodinitrile derivatives and phthalocyanines
HATİCE AKIN DİNÇER
Doktora
Türkçe
2005
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiDOÇ.DR. ESİN HAMURYUDAN
PROF.DR. MAKBULE BURKUT KOÇAK