Geri Dön

Tavuk orijinli salmonella suşlarında antibiyotik dirençliliğinin konvansiyonel ve moleküler analizi

Molecular and conventional analysis of antibiotic resistance in salmonella strains isolated from chicken

PDF İndir

  1. Tez No: 715153
  2. Yazar: MERVE ÖZDAL SALAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HAKAN YARDIMCI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 63

Özet

Bu araştırmada, tavuk orijinli Salmonella suşlarında antibiyotik dirençliliğinin konvansiyonel ve moleküler olarak analiz edilmesi amaçlandı. Çalışmada, tavuk orijinli 30 S. Infantis suşu, 30 S. Enteritidis ve 35 S. Typhimurium olmak üzere toplam 95 adet suş kullanıldı. Kirby-Bauer disk diffuzyon tekniğine esas alınarak gentamisin, kanamisin, streptomisin, eritromisin, tetrasiklin, siprofloksasin, nalidiksit asit, ampisilin, sefotaksim ve seftazidim, kloramfenikol, sulfonamid ve trimetoprim/sülfametaksazol antibiyotikleri çalışıldı. Antibiyotik dirençliliğin moleküler olarak analizi için tetrasiklin direncinde rol oynayan tet(A), kinolon direncinde rol oynayan gyrA ve aminoglikozid grubundan kanamisin direncinde rol oynayan aphA genlerine spesifik primerlerin kullanıldığı konvasiyonel PCR yöntemi uygulandı. S. Infantis suşlarının 28 (%93)'i streptomisin'e, 29 (%96) 'u sülfanomid'e, 29 (%96) 'u eritromisin'e, 30 (%100)'u sefotaksim'e, 30 (%100)'u ampisilin'e, 30 (%100)'u ceftazidim'e, 27 (%90) 'si trimetoprim/sülfametaksazol'e, (%96) 'u tetrasiklin'e, 23 (%76)'ü gentamisin'e, 20 (%66) 'si kloramfenikol'e, 30 (%100)'u nalidiksik asit'e, 29 (%96) 'u kanamisin'e, 30 (%100)'u siprofloksasin'e dirençli bulunmuştur. S. Enteritidis suşlarının 29 (%96) 'u streptomisin'e, 29 (96)'u sülfanomid'e, 30 (%100)'u eritromisin'e, 30 (%100)'u sefotaksim'e, 29 (%96)'u ampisilin'e, 30 (%100)'u ceftazidim'e, 28 (%93)'i trimetoprim/sülfametaksazol'e, 30 (%100)'u tetrasiklin'e, 25 (%83)'i gentamisin'e, 23 (%83)'ü kloramfenikol'e, 30 (%100)'u nalidiksik asit'e, 28 (%93) 'i kanamisin'e, 30 (%100)'u siprofloksasin'e dirençli bulunmuştur. S. Typhimurium suşlarının 30 (%100)'u streptomisin'e, 30 (%100)'u sülfanomid'e, 30 (%100)'u eritromisin'e, (%100)'u sefotaksim'e, 30 (%100)'u ampisilin'e, 30 (%100)'u ceftazidim'e, 30 (%100)'u trimetoprim/sülfametaksazol'e, 30 (%100) 'u tetrasiklin'e, 30 (%100)'u gentamisin'e, 21 (%60)'i kloramfenikol'e, 30 (%100)'u nalidiksik asit'e, 30 (%100)'u kanamisin'e, 30 (%100)'u siprofloksasin'e dirençli bulunmuştur. Aminoglikozid grubundan kanamisin direncinde rol oynayan aphA geni hiçbir S. Infantis suşunda tespit edilmezken, S. Enteritidis suşundan 5 tanesinde, 35 adet S. Typhimurium suşundan 3 tanesinde saptandı. Tetrasiklin direncinde rol oynayan tetA geni 30 adet S. Infantis suşundan 17 tanesinde, 30 adet S. Enteritidis suşundan 12 tanesinde, 35 adet S. Typhimurium suşundan 1 tanesinde saptandı. Kinolon direncinde rol oynayan gyrA 30 adet S. Infantis suşundan 7 tanesinde, 30 adet S. Enteritidis suşundan 14, 35 adet S. Typhimurium suşundan 22 (%63)'sinde saptandı. Sonuç olarak çalışmaya dahil edilen Türkiye'nin farklı bölgelerinde faaliyet gösteren işletmelerden elde edilen Salmonella suşlarının seçilen antibiyotiklere karşı önemli oranda dirence sahip olduğu ve benzer şekilde çoklu antibiyotik direncine taşıdığı belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, it was aimed to analysed antibiotic resistance via conventional and molecular methods in Salmonella strains originated from chickens. In the study, bedding materials were collected for Salmonella isolation from 523 broiler and laying chicken coops in different region in Turkey. Totally, isolated 95 strains including strains of S. Infantis (n=30), S. Enteritidis (n=30) and S. Typhimurium (n=35) were used as a material. Gentamicin, kanamycin, streptomycin, erythromycin, tetracycline, ciprofloxacin, nalidixic acid, ampicillin, cefotaxime and ceftazidime, chloramphenicol, sulfonamide and trimethoprim/sulfamethoxazole were investigated for antibiotic susceptibility tests of strains based on the Kirby-Bauer method. Analysing for the antibiotic resistance, conventional Polymerase Chain Reaction method was applied with using specific primers against tet(A) gene related with tetracycline resistance, gyrA gene related with quinolone resistance and aphA gene related with kanamycin resistance in aminoglycoside. It was found that out of the 30 strains, 28 (93%), 29 (96%), 29 (96%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 27 (90%), 29 (96%), 23 (76%), 20 (66%), 30 (100%), 29 (96%), and 30 (100%) of the S. Infantis strains were resistant to streptomycin, sulfonamide, erythromycin, cefotaxime, ampicillin, ceftazidime, trimethoprim/sulfamethoxazole, tetracycline, gentamycin, chloramphenicol, nalidixic acid, kanamycin and ciprofloxacin, respectively. It was found that out of the 30 strains, 29 (96%), 29 (96%), 30 (100%), 30 (100%), 29 (96%), 30 (100%), 28 (93%), 30 (100%), 25 (83%), 23 (83%), 30 (100%), 28 (93%), and 30 (100%) of the S. Enteritidis strains were resistant to streptomycin, sulfonamide, erythromycin, cefotaxime, ampicillin, ceftazidime, trimethoprim/sulfamethoxazole, tetracycline, gentamycin, chloramphenicol, nalidixic acid, kanamycin and ciprofloxacin, respectively. It was found that out of the 30 strains, 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 30 (100%), 21 (60%), 30 (100%), 30 (100%), and 30 (100%) of the S. Typhimurium strains were resistant to streptomycin, sulfonamide, erythromycin, cefotaxime, ampicillin, ceftazidime, trimethoprim/sulfamethoxazole, tetracycline, gentamycin, chloramphenicol, nalidixic acid, kanamycin and ciprofloxacin, respectively. aphA gene related with kanamycin resistance in aminoglycoside were detected in 5 strains out of the 30 S. Enteritidis strains and 3 strains out of the 35 S. Typhimurium strains, however, the gene were not detected any S. Infantis strain. tet(A) gene related with tetracycline resistance were detected in 17 strains out of the 30 Salmonella Infantis, 12 strains out of the 30 Salmonella Enteritidis strains and 1 strain out of the 35 S. Typhimurium strains. gyrA gene related with quinolone resistance were detected in 7 strains out of the 30 S. Infantis, 14 strains out of the 30 S. Enteritidis strains and 22 strains out of the 35 S. Typhimurium strains. As a conclusion, Salmonella strains isolated from chicken coops in different region in Turkey had higher resistance rate against to the selected antibiotics and multiple antibiotic resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    501133

    Tavuk ve insan orijinli Salmonella enterica subspecies Enterica serovar infantis suşlarında antibiyotik direnç genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance genes in Salmonella enterica subspecies Enterica serovar infantis strains isolated from chicken and human by polimerase chain reaction method

    MESUT AKGEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET AKAN

  2. Tez No

    634176

    Tavuk orijinli salmonella enteritidis suşlarında siprofloksasin direncinin araştırılması

    Investigation of ciprofloxacin resistance in salmonella enteritidis strains of chicken origin

    BETÜL KÜÇÜK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAMİT KAAN MÜŞTAK

  3. Tez No

    849546

    İstabul'dan temin edilen tavuk etlerinde salmonella spp.suşlarında prevaşlans , serotiplendirme ve antibiyotik duyarlılığının araştırılması

    Salmonella spp in chicken meat provided from İstanbul investigation of prevalence, serotyping and antibiotic sensitivity in strains

    SELMAN BAHADIR ORHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ AYDIN

  4. Tez No

    829372

    Tavuk yumurtalarında salmonella varlığının yetiştirme tipine göre tespiti

    Detection of salmonella presence in chicken eggs according to poultry rearing type

    SANİYE DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Gıda Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜZİN İPLİKÇİOĞLU ARAL

  5. Tez No

    752370

    Türkiye'deki tavuk orijinli salmonella enteritidis suşlarının MLVA ve PFGE ile genotiplendirilmesi ve antimikrobiyal direncin saptanması

    Antimicrobial resistance and genotyping by MLVA and PFGE of chicken originated salmonella enteritidis in Turkey

    SEYYİDE SARIÇAM İNCE

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAMİT KAAN MÜŞTAK

Geri Dön