Bazı bitkisel ligandların ve türevlerinin antihelmintik etkilerinin ın sılıco moleküler modelleme yöntemiyle tahmin edilmesi
Prediction on the anthelmintic effects of some herbal ligands and their derivatives with in silico molecular modelling method
- Tez No: 716094
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET ONUR GİRİŞGİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 417
Özet
Helmintik enfeksiyonlar dünya üzerinde oldukça yaygındır ve 2 milyardan fazla insan en az bir helmint türü ile enfektedir. Bu çalışmada bitkisel ligand iskeletleri kullanılarak piyasadaki en sık kullanılan antihelmintik ilaçlardan daha düşük dozda etki edebilen, daha az yan etkili, ulaşılması kolay ve güvenilir yeni bir antihelmintik ilaç adayının in silico modelleme yöntemleriyle modellenmesi ve bazı bitki özütlerinin kılkurtları üzerindeki antihelmintik etkisinin gösterilmesi hedeflenmiştir. Direnç gelişimi, yeni antihelmintiklerin keşfini gerektirdiği için, antihelmintik direnç gelişimi durumunda ortaya çıkabilecek mutant proteinlerin inhibe edilmesi amacıyla en potent bitkisel ligandlar kenetleme simülasyonları vasıtasıyla araştırılmıştır. Eriositrin molekülü türevlerinin çizilmesi amacıyla iskelet olarak kullanılmıştır. Bazı hedef proteinlerin 3 boyutlu yapısı bilinmediğinden, sekonder yapısı homoloji modelleme ile tahmin edilmiştir. Sonuç olarak kukurbitasin-B'nin fevkalade iyi bir skor değeri ile (Ki= 57,11 pikomolar ve ΔG= -13,97 kcal/mol) rat karnitin palmitoil transferaz 2 enzimini inhibe edebildiği, direnç gelişiminde arteannuin-B'nin Mebendazolden daha potent bir ilaç adayı olduğu, tasarlanan 24 eriositrin türevinden E05'in eriositrinden daha düşük Ki değerine sahip olduğu, oreganolün seçici bir inhibitör adayı olduğu ve fumarat redüktaz için selektivite indeksinin 20 310,53 bulunduğu ve in vivo deneylerde Artemisia annua L. n-hekzan özütünün 1200 mg/kg dozunun kılkurtlarına karşı %36,91'lik bir antinematodal etki gösterdiği ilk kez bu çalışmada ortaya çıkarılmıştır.
Özet (Çeviri)
Helminthic infections are quite common around the world and more than 2 billion people are infected with at least one helminth species. In this study, it was aimed to model a new anthelmintic drug candidate, which can act at lower doses than the most commonly used anthelmintic drugs in the market, with less side effects, easy to access and reliable, using herbal ligand scaffolds, and to show the anthelmintic effect of some plant extracts on pinworms. Since development of resistance requires the discovery of new anthelmintics, the most potent herbal ligands were investigated via docking simulations to inhibit mutant proteins that may arise in the event of anthelmintic resistance development. Eriocitrin was used as a scaffold for drawing derivatives. The secondary structures of some target proteins were predicted by homology modeling because their 3D structures are unknown. As a result, in this study, it was revealed for the first time that cucurbitacin-B can inhibit rat carnitine palmitoyl transferase 2 enzyme with an exceptionally good score value (Ki= 57,11 picomolar and ΔG=-13,97 kcal/mol), and arteannuin-B is a more potent drug candidate than Mebendazole in the development of resistance. Among the 24 designed eriocitrin derivatives, E05 has a lower Ki value than eriocitrin, oreganol is a selective inhibitor candidate and the selectivity index for fumarate reductase is 20 310,53, and in vivo experiments, Artemisia annua L. n-hexane extract was an antinematodal effect of 36,91% at the 1200 mg/kg dose against pinworms.
Benzer Tezler
- Para ve orto konumunda klor brom veya metil içeren schiff baz lıgandlarının antibakteriyel aktivitelerinin araştırılması
Investigation of antibacterial activities of schiff base ligands containing chlorine, bromine or methyl in para and ortho positions
RAGHEED FAIZ HADI BUTTO
- Türkiye'deki bazı geleneksel bitkilerin antidiyabetik etki mekanizmalarının In Siliko yöntemler ile belirlenmesi ve besin bileşeni olarak potansiyel kullanımları
Determination of the antidiabetic effect mechanism of sometraditional plants in Turkey by In Silico methods and their potential use asnutritional components
LEMAN ZEYNEP BAKKAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Beslenme ve DiyetetikBiruni ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ABDULİLAH ECE
- 4-amino-3-hidrazino-5-merkapto-1,2,4-triazol'ün bazı imin bileşiklerinin sentezi ve bazı metal komplekslerinin incelenmesi
Investigation of some imine compounds of 4-amino-3-hydrazino-5-mercapto-1,2,4-triazole and some of its metal complexes
ESİN PERPELEK
- Çanakkale kaynaklı galanthus nivalis L. subsp. cilicicus (baker) gottlieb-tantenhain örneği üzerinde farmakognozik araştırmalar
Pharmacognostical studies on galanthus nivalis L. subsp. cilicicus (baker) gottlieb-tantenhain of Çanakkale origin
GÜLEN İREM KAYA
Doktora
Türkçe
2003
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. BELKIS GÖZLER
PROF.DR. BİJEN KIVÇAK
- Bazı bitkisel yağların Bemisia tabaci (Gennadius) (Hemiptera: Aleyrodidae) ve bazı önemli doğal düşmanlarına karşı toksik etkileri üzerine çalışmalar
Studies on toxic effects of some plant oils against Bemisia tabaci (Gennadius) (Hemiptera: Aleyrodidae) and its some important natural enemies
EMRE ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatBursa Uludağ ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NİMET SEMA GENÇER