Geri Dön

Renal hücre karsinomunun maldı kütle spektrometresi ile glikan düzeyinde incelenmesi

Investigation of renal cell carcinoma by maldi mass spectrometers at the glican level

PDF İndir

  1. Tez No: 720056
  2. Yazar: AHMET ÇALIŞKAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ HACI MEHMET KAYILI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biochemistry, Bioengineering, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karabük Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 87

Özet

Renal hücreli böbrek kanseri, böbrek kanseri tipleri içerisinde görülen en yaygın türdür. Renal hücreli karsinomda kanser dokuları üzerinde N-glikozilasyon profillerinin incelendiği çalışma sayısı çok azdır. Bu tez kapsamında, böbrek kanseri glikan profillerinin MALDI kütle spektrometresi ile incelenmesi amaçlanmıştır. Bu kapsamda, parafilm ile kaplanmış ve formalin ile sabitlenmiş dokular çalışmada kullanılmıştır. İlk olarak, dokulardan parafilm uzaklaştırılmıştır ve dokulardan proteinlerin ekstraksiyonu, kloroform/methanol yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Ekstrakte edilen glikoproteinlerden N-glikanlarının salınımı sonrası glikanlar, 2-amino benzoik asit (2-AA) ile etiketlendi. Son olarak sırasıyla selüloz ve gözenekli grafitize karbon içeren malzemeler ile saflaştırma işlemlerinden geçirildi. 2-AA etiketli N-glikanların analizleri MALDI-MS ile gerçekleştirildi. Analizler sonucunda toplam 33 adet N-glikan tespit edildi. Tespit edilen N-glikanların yapısal doğrulamaları tandem MS/MS analizleri ile gerçekleştirilmiştir ve N-glikanlar yapısal özelliklerine göre gruplandırılmıştır. Bu analizler sonucunda tespit edilen N-glikanların göreceli bollukları, toplam alan normalizasyon yaklaşımı kullanılarak hesaplanmıştır. İstatiksel analizler nötr N-glikanlara ve bu glikanlardan türetilen N-glikan gruplarına uygulanmıştır. Çoklu T testi ve Mann Whitney U testi ile yapılan istatiksel analizler (p

Özet (Çeviri)

Renal cell kidney carcinoma is the most common type of kidney cancer. The number of studies examining N-glycosylation profiles on cancer tissues in renal cell carcinoma is very few. In this thesis, it is aimed to investigate kidney cancer N-glycan profiles with MALDI mass spectrometry. In this context, tissues covered with parafilm and fixed with formalin were used in the study. First, the parafilm was removed from the tissues and the extraction of the proteins was performed by the chloroform/methanol method. After the release of N-glycans from the extracted glycoproteins, the glycans were labeled with 2-amino benzoic acid (2-AA). Finally, they were purified with materials containing cellulose and porous graphitized carbon, respectively. Analyzes of 2-AA-labeled N-glycans were performed by MALDI-MS. As a result of the analyses, a total of 33 N-glycans were detected. Structural confirmations of detected N-glycans were performed by tandem MS/MS analyzes and N-glycans were grouped according to their structural features. The relative abundances of N-glycans detected as a result of these analyzes were calculated using the total area normalization approach. Statistical analyzes were applied to neutral N-glycans and N-glycan groups derived from these glycans. Statistical analyzes with multiple T test and Mann Whitney U test (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    446608

    Mechanism of boron derivatives for the treatment of renal cell carcinoma

    Renal hücre karsinomunun tedavisinde boron türevlerinin mekanizması

    SIDIKA TAPŞIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Tıbbi BiyolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN

  2. Tez No

    158269

    IL-2 ekspresyonu için gen taşıyıcı sistem geliştirilmesi

    Development of gene carrier system for the expression of IL-2

    GÜZİN ÖZGEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Eczacılık ve FarmakolojiMarmara Üniversitesi

    Farmasötik Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. JÜLİDE AKBUĞA

  3. Tez No

    532333

    Akciğer adenokarsinomunda rassf1a ve sparcl1 geni metilasyon düzeylerinin belirlenmesi

    Determination of rassfa1 and sparcl1 gene methylation levels in lung adenocarcinoma

    GÜLZADE EKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiKastamonu Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ASUMAN ÖZGÖZ

  4. Tez No

    663946

    Kolon kanseri hücre hattında normoksi ve hipoksi koşullarında TGF-β sitokininin ADAMTS-5 gen ifadesine olan etkisinin belirlenmesi

    Determination of the effect of TGF-β cytokine on ADAMTS-5 gene expression in colon cancer cell line under normoxic and hypoxic conditions

    HATİCE ERDOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SÜMEYYE AYDOGAN TÜRKOĞLU

  5. Tez No

    644220

    Renal hücre karsinomunda aday tümör baskılayıcı BNC1, SCUBE3, SFRP1 ve PCDH8 genlerinin epigenetik analizi

    Epigenetic analysis of BNC1, SCUBE3, SFRP1 and PCDH8 candidate tumor suppressor genes in renal cell carcinoma

    MERVE BALİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ

Geri Dön