Renal hücreli karsinomda MikroRNA-124 ekspresyonu
MiR-124 expression levels in renal cell carcinoma
- Tez No: 722325
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜLER ÖZTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizyoloji, Physiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Medeniyet Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
GİRİŞ-AMAÇ: Renal hücreli karsinom, %40'ın üzerinde ölüm oranlarıyla en yüksek mortaliteye sahip ürolojik kanser türüdür. Renal hücreli karsinomda etkili olan yolaklardan biri olan Wingless/INT (Wnt) yolağının inhibisyonuyla renal kanser hücre ölümü ya da hücre büyümesinin durdurulabileceği gösterilmiştir. Wnt yolağı ile ilişkilendirilmiş tümör süpresör etkili miR-124, gen ifadesinin düzenlenmesinde görev almaktadır. Çalışmamızda miR-124'ün renal hücreli karsinomda ekspresyon analizi yapılarak kanser ile olan ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. GEREÇ VE YÖNTEMLER: 30 kişiden alınan aynı böbreğe ait tümörlü ve sağlıklı doku örnekleri çalışmaya dahil edildi. RNA,“QIAGEN lysis agent”ile dokulardan izole edildi. Reverse transkriptaz (RT) enzimi ile cDNA elde edildi ve cDNA ürünü gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PZR) ile ölçüldü. miR-124 ekspresyonu ΔΔCT (Delta Delta Eşik Döngüsü) metodu ile belirlendi ve istatiksel analizler için SPSS 22 (Spearman's rho ve Wilcoxon rank sum test) programı kullanıldı. BULGULAR: miR-124'ün renal hücreli karsinomda kat değişimi 0.355 bulundu (Z=-4,453, p˂0.001). miR-124'ün 28 tümör dokusunda kontrol dokusuna oranla daha az eksprese edildiği görüldü. Azalmış ekspresyon seviyeleri ile vücut kitle indeksi (p=0.023, r=-0.413), tümör evresi (p=0.022, r=-0.417), tümör çapı (p=0.009, r=-0.468) ve nötrofil değerleri (p=0.023, r=-0.415) arasında negatif korelasyon bulundu. SONUÇLAR: Çalışmamızda renal hücreli karsinomda miR-124 ekspersyonunun tümör büyüklüğü ve evresine bağlı olarak azaldığı gösterildi. İleriki çalışmalarla desteklenmesi durumunda tümör süpresör miR-124'ün renal hücreli karsinomda biyobelirteç olarak kullanılabileceğini düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
AIM: Renal cell carcinoma is the urological cancer type with the highest mortality rates over 40%. It has been shown that the inhibition of the Wnt pathway, one of the pathways that are effective in renal cell carcinoma, may kill or prevent the growth of renal cancer cells. The tumor-suppressor mir-124 associated with the Wnt pathway is involved in the regulation of gene expression. We aimed to reveal the relation between miR-124 expression and renal cell carcinoma. MATERIAL-METHODS: 30 tumor and 30 surrounding healthy kidney tissues from the same subjects were included in the study. RNA was isolated from the tissues by“QIAGEN lysis agent”. cDNA was generated by reverse transcriptase (RT) enzyme and the PCR product was measured by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The expression of mir-124 was determined by the ΔΔCT (Delta Delta Threshold Cycle) method. SPSS 22 (Spearman's rho and Wilcoxon rank sum test) program was used for statistical analysis. RESULTS: The fold change of miR-124 was found 0.355 (Z=-4,453, p˂0.001). miR-124 was found lower expression levels in 28 tumor tissues than controls and decreased expression levels correlated with body mass index (p=0.023, r=-0.413), tumor stage (p=0.022, r=-0.417), tumor diameter (p=0.009, r=-0.468) and neutrophil values (p=0.023, r=-0.415). CONCLUSIONS: In our study, we found that miR-124 expression in renal cell carcinoma decreased with tumor size and stage. We consider the tumor suppressor miR-124 may be used as a biomarker in renal cell carcinoma if supported by further studies.
Benzer Tezler
- Berrak hücreli tip renal hücreli karsinom'da RNA temelli biyobelirteçlerin biyoinformatik ve moleküler analiz yöntemleri ile araştırılması
Research with bioinformatic and molecular analysis methods of RNA based biomarkers in clear cell renal cell carcinoma
UFUK ÜNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Tıbbi BiyolojiUludağ ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLŞAH ÇEÇENER
- Berrak hücreli renal hücreli karsinomada yağ asit metabolizması ilişkili AMPK ve miR-33a ifadelerinin klinikopatolojik parametrelerle ilişkisinin TCGA veri setinde ve hücre hatlarında moleküler düzeyde analizi
Molecular analysis of the relationship between fatty acid metabolism related AMPK and miR-33a expressions and clinicopathological parameters in clear cell renal carcinoma in the TCGA data set and cell lines
MUSTAFA ZAFER TEMİZ
Doktora
Türkçe
2024
Moleküler Tıpİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE BERRAK RENCÜZOĞULLARI
- Determination and comparison of the relationship between COVID-19 and breast cancer, triple negative breast cancer and clear cell renal cell carcinoma by in silico approaches
COVID-19 ile meme kanseri, üçlü negatif meme kanseri ve berrak hücreli renal hücreli karsinom arasındaki ilişkinin in siliko yaklaşımlar ile belirlenmesi ve karşılaştırılması
AMMAR YASIR AHMED AHMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
GenetikKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEVİNÇ AKÇAY
- Böbrek hücreli karsinom ve böbrek hücreli karsinom metastazlarında mikroRNA-21 ve mikroRNA-210 ekspresyonunun histolojik tümör tipi ve prognozla ilişkisi
The relationship of microRNA-21 and microRNA-210 expression to histologic tumor type andprognosis in renal cell carcinoma and renalcell carcinoma metastases
TAHA CUMHAN ŞAVLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
PatolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DR. SEVİM BAYKAL KOCA
- Karboplatin'in baş ve boyun kanseri üzerindeki anti-kanser etkisinin MiR-145 ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the anti-cancer effects of carboplatin on head and neck cancer cells in association with MiR-145
AHSEN KILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
GenetikErzurum Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖMER FARUK KARATAŞ