İshali olan immünsupresif hastalarda fırsatçı ve fırsatçı olmayan protozoonların sıklığının konvansiyonel yöntemler ve multipleks PZR ile araştırılması
Investigation of the frequency of opportunistic and NON-opportunistic protozoa in immunosuppressive patients with diarrhea by conventional methods and multiplex PCR
- Tez No: 728297
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖZLEM DERİNBAY EKİCİ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Periodontoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
İmmün yetmezliği olan hastalar normal konaklara göre gastrointestinal enfeksiyonlar açısından daha büyük risk altındadırlar. Bu hastalarda gelişen enfeksiyonlarda paraziter etkenler önemli bir yere sahiptir. Bağırsak parazitlerinin tanımlanması tüm parazitlerin tespitini sağladığı için temel olarak mikroskobik incelemeye dayalıdır. Her ne kadar görsel olması açısından değerli olsa da mikroskobik değerlendirme; yüksek deneyim ve eğitim gerektirmektedir. Diğer yandan geliştirilen polimeraz zincir reaksiyonu tabanlı moleküler yöntemler yüksek duyarlılık ve özgüllüğe sahiptirler. Ancak DNA izolasyonu protozoonların kist ya da ookistlerinin kalın duvar yapısı nedeniyle bakteriyel ve viral etkenlere göre daha zordur ve gaita içerdiği PCR inhibitörleri nedeniyle moleküler çalışmalar için zor bir örnek türüdür. Bu çalışmada bir üniversite hastanesi parazitoloji laboratuvarına rutin parazitolojik inceleme için gönderilen immün yetmezlikli hastalara ait 100 gaita örneği çalışmaya dahil edilmiştir. Bu hastalarda fırsatçı patojenlerden Cryptosporidium spp. ve C. cayetanensis; fırsatçı olmayan etkenlerden E. histolytica, G. intestinalis ve D. fragilis sıklığı en az iki yöntemle araştırılmıştır. Ayrıca modifiye aside dirençli boyada pozitif bulunan C. belli ookistleri kaydedilmiştir. Konvansiyonel yöntemler olarak G. intestinalis ve D. fragilis için wheatley's trikrom boyama, Cryptosporidium spp, C. belli, C. cayetanensis için modifiye aside dirençli Ziehl-Neelsen boyama kullanılmıştır. E. histolytica için mikroskobik bakı geçerli yöntem olarak alınmamış, ELISA yöntemi ile E. histolytica'ya spesifik adezin antijeni araştırılmıştır. Çalışmada ayrıca multipleks real time PCR ile E. histolytica, G. intestinalis, D. fragilis ve Cryptosporidium spp. araştırılırken, C. cayetanensis için de real time PZR çalışması yürütülmüştür. İmmün yetmezlikli hasta örneklerinde çalışılan yöntemlerden en az biriyle toplam 4 örnekte E. histolytica, 12 örnekte G. intestinalis, 8 örnekte D. fragilis, 12 örnekte C. belli, 9 örnekte Cryptosporidium spp. ve 2 örnekte C. cayetanensis tespit edilmiştir. Çalışmada ishali olan immün yetmezlikli hastalarda araştırılan protozoal etkenlerin sıklığı %39 olarak bulunurken, bunlar içerisinde fırsatçı etken sıklığı ise %19 olarak tespit edilmiştir. Çalışma sonuçları; protozoal etkenlerin immün yetmezlikli hasta grubunda önemli bir gastroenterit etkeni olduğunu göstermiştir. Bu hasta grubunda protozoal etkenleri, diğer enfeksiyon etkenlerinden ve enfeksiyona bağlı olmayan ishal nedenlerinden ayırt edebilmek doğru tedavi yaklaşımı açısından önemli olduğundan, birden fazla tanı yönteminin bir arada kullanılmasının faydalı olacağı sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Immunocompromised patients are at greater risk for gastrointestinal infections than normal hosts. Parasitic agents have an important place in the infections that develop in these patients. Identification of intestinal parasites is mainly based on microscopic examination as it enables the detection of all parasites. Although microscopic evaluation is valuable because of being visual, it requires high experience and education. On the other hand, the developed polymerase chain reaction based molecular methods have high sensitivity and specificity. However, DNA isolation is more difficult than bacterial and viral agents due to the thick wall structure of protozoan cysts or oocysts, and stool is a difficult sample type for molecular studies due to PCR inhibitors it contains. In this study, a hundred stool samples of immunocompromised patients who were sent to a university hospital parasitology laboratory for routine parasitological examination were included in the study. In these samples, Cryptosporidium spp., C. cayetanensis as opportunistic agents and E. histolytica, G. intestinalis and D. fragilis as non-opportunistic agents were investigated by at least two methods. In addition, positivity of C. belli oocysts in the modified acid-fast dye have been recorded. Wheatley's trichrome staining for G. intestinalis and D. fragilis, modified acid-fast Ziehl-Neelsen staining for Cryptosporidium spp, C. belli, C. cayetanensis were used as conventional methods. Microscopic examination was not taken as a valid method for E. histolytica, and the specific adhesive antigen for E. histolytica was investigated by ELISA method. In addition E. histolytica, G. intestinalis, D. fragilis and Cryptosporidium spp. were investigated with a multiplex real time PCR, while C. cayetanensis was carried out with a real time PCR. In the study, the frequency of protozoal agents investigated in immunocompromised patients with diarrhea was found to be 39%, while the frequency of opportunistic agents was found to be 19% among them. Study results showed that protozoal agents are an important factor of gastroenteritis in the immunocompromised patient group. Since it is important for the right treatment approach to distinguish protozoal agents from other infectious agents and non-infectious diarrhea causes in this patient group, it was concluded that it would be beneficial to use more than one diagnostic method together.
Benzer Tezler
- İshalli hastalarda cryptosporıdıum spp.'in modifiye ehrlıch-zıehl-neelsen boyama yöntemi, ELISA ve immunokromatografik yöntem ile araştırılması
Investigation of cryptosporidium spp. in diarrheic patients by modified ehrlich-ziehl-neelsen staining, ELISA and immunochromatographic methods
ARSEL ZAIN ALABDEEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FAHRİYE EKŞİ
- İshalli immünsupresif ve immünkompetan olgularda mikroskobik, serolojik ve moleküler yöntemlerle cryptosporidium SPP.'nin araştırılması
Investigation of cryptosporidium SPP in immunosuppressive and immunocompetent cases with diarrhea by microscobic, serological and moleculer methods
AHMET YILMAZ
Doktora
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN USLU
- İnsanlarda ve buzağılarda cryptosporidiosis yaygınlığının farklı yöntemlerle araştırılması ve cryptosporidium türlerinin tiplendirilmesi
Investigation of cryptosporidiosis prevalence in humans and calves by different methods and typing of cryptosporidium species
ABDURRAHMAN EKİCİ
Doktora
Türkçe
2018
ParazitolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN YILMAZ
DOÇ. DR. YUNUS EMRE BEYHAN
- Mardin ilindeki su kaynaklarında cryptosporidium parvum'un varlığının araştırılması
A research on the presence of cryptospori̇di̇um parvum i̇n water resources i̇n mardi̇n
VOLKAN ÇUHADAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
MikrobiyolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ŞENGÜL
- İmmünsupresif hastalarda cryptosporıdıum SPP. sıklığının çeşitli tanı yöntemleri ile araştırılması
Investigation of the frequency of cryptosporidium SPP in immunsupressive patients by various diagnostic methods
DUYGU BEDER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA ESENKAYA TAŞBENT