Investigation of the effects of novel azole compounds on the activity of MPGES-1 enzyme
Azol grubu içeren yeni bileşiklerin MPGES-1 enzim aktivitesi üzerine etkilerinin incelenmesi
- Tez No: 732235
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE OGAN, PROF. DR. İLKAY KÜÇÜKGÜZEL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Azoller, Enzim aktivitesi, Azoles, Enzyme activity
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mikrozomal prostaglandin E2 sentaz-1 (mPGES-1) enziminin inhibisyonu, siklooksijenaz enzimlerin inhibisyonuyla ilişkilendirilen yan etkilerin görülmemesi sebebiyle yeni nesil steroid olmayan anti-enflamatuvar (SOAİ) ilaçların tasarımı için umut vaat etmektedir. Azol bileşikleri, azot içeren heterosiklik bileşiklerdir ve tıpta geniş bir kullanım alanına sahip olup, tıbbi kimyada umut vaat eden bileşikler olarak görülmektedir. Bu çalışmada, çeşitli bilgisayar-destekli ilaç tasarımı teknikleri bir arada kullanılmıştır. Çeşitli moleküler doking programları kullanılarak yapı-temelli sanal tarama gerçekleştirilmiştir. Farmakofor modeller oluşturulmuş ve en iyi modelin Güner-Henry skoru 0.89 olarak hesaplanmıştır. En iyi 10 aday azol bileşiğin bağlanmaları incelenmiş ve en iyi bağlanma gösteren (-8.38 kcal/mol) bileşik üzerinde moleküler dinamik simülasyonları ile daha ileri incelemeler yapılmıştır. Böylece furazan1224 (ZINC001142847306) bileşiğinin substrat olan prostaglandin H2'nin (PGH2) bağlanma bölgesini işgal ettiği gözlemlenmiş ve 100 ns boyunca stabil kaldığı gözlenmiştir. Aktif bölgedeki daimi hidrojen bağları, furazan1224'ün simülasyon boyunca stabilitesini desteklemiştir. Farmakokinetik veriler furazan1224'ün sitokrom P450 3A4 enzimini inhibe etmek sonucu meydana gelen riskleri taşımadığını göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Inhibition of microsomal prostaglandin E2 synthase-1 (mPGES-1) is promising for designing novel non-steroidal anti-inflammatory drugs, as they lack side-effects associated with the inhibition of cyclooxygenase enzymes. Azole compounds are nitrogen-containing heterocycles and have a wide use in medicine and are considered as promising compounds in medicinal chemistry. Various computer-aided drug design strategies are incorporated in this study. Structure-based virtual screening was performed employing various docking programs. Pharmacophore models were generated and Güner-Henry score of the best model was calculated as 0.89. Binding modes of the final 10 azole compounds were analyzed and further investigation of the best binding (-8.38 kcal/mol) compound was performed using molecular dynamics simulation, revealing that furazan1224 (ZINC001142847306) occupied the binding site of the substrate, prostaglandin H2 (PGH2) and remained stable for 100 ns. Continuous hydrogen bonds with amino acids in the active site supported the stability of furazan1224 throughout the trajectory. Pharmacokinetic profile showed that furazan1224 lacks the risks of inhibiting cytochrome P450 3A4 enzyme and central nervous system-related side-effects.
Benzer Tezler
- Bazı yeni fenil, furil ve 1,2,4-triazol sübstitüe aril ve alkil eterlerin sentezi ve biyolojik aktivitelerinin araştırılması
The synthesis of some novel phenyl, furyl and 1,2,4-triazole substituted aryl and alkyl ethers and investigation of their biological activities
HAKAN TAHTACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
KimyaZonguldak Karaelmas ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZDEN ÖZEL GÜVEN
- Fenil, furil ve benzotriazol sübstitüe eterlerin sentezi; biyolojik aktivitelerinin araştırılması
The synthesis of phenyl, furyl and benzotriazole substitüted ethers; investigation of their biological activities
MERAL BAYRAKTAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
KimyaZonguldak Karaelmas ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZDEN ÖZEL GÜVEN
- Benz(azol)-piperazin türevi bazı orjinal bileşiklerin antidepresan-benzeri etkilerinin araştırılması
Investigation of the antidepressant-like effects of some novel benz(azole)–piperazine derivative compounds
HATİCE KARAGÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZGÜR DEVRİM CAN
DOÇ. DR. ASAF EVRİM EVREN
- Investigation of the effects of a novel defrost method on cooling system performance
Tasarlanan yeni bir defrost yönteminin soğutma sistem performansı üzerindeki etkilerinin incelenmesi
MAHADE OMRAN ALI ABDULLA
Doktora
İngilizce
2021
Makine MühendisliğiKarabük ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMRAH DENİZ
- Investigation of antitumor effects of novel isoxazole derivatives and the role of biotin conjugation in their efficacy
Yeni izoksazol türevlerinin antitümör etkilerinin araştırılması ve biyotin konjugasyonunun bu etkiler üzerindeki rolü
MELİKE ERGÜVEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR ÇİZMECİOĞLU