Geri Dön

Primer ve metastatik melanom hücre hatlarında hotspot mutasyonların karşılaştırılması

Comparison of hotspot mutations in primary and metastatic melanoma cell lines

PDF İndir

  1. Tez No: 733809
  2. Yazar: CANAN DOĞAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ENDER ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kanser Biyolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Melanom, cildin yüzeyinde derinin pigment üreten hücreleri olan melanositlerde başlayan bir kanser tipidir. Bu hastalığın genetik temelini oluşturan değişikliklerin çoğu, melanositlerde rastgele elde edilen mutasyonlar olarak meydana gelmekte ve genomik değişikliklerin birikmesi, melanom gelişimine, ilerlemesine ve evrimine katkıda bulunmaktadır. Çalışmamızda WM115/Primer Melanom ve SK-MEL30/Metastatik Melanom hücre hatlarındaki hotspot mutasyonların Ion Ampliseq Cancer Hotspot DNA Panel v2 gen paneli kullanarak, çoğu insan kanseriyle ilişkili 50 gendeki (ABL1, AKT1, ALK, APC, ATM, BRAF, CDH1, CDKN2A, CSF1R, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ERBB4, EZH2, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAS, GNAQ, HNF1A, HRAS, IDH1, JAK2, JAK3, IDH2, KDR, KIT, KRAS, MET, MLH1, MPL, NOTCH1, NPM1, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, PTPN11, RB1, RET, SMAD4, SMARCB1, SMO, SRC, STK11, TP53, VHL) değişikliklerini tespit etmeyi amaçladık. WM115/Primer Melanom hücre hattında 9 adet mutasyon SK-MEL30/Metastatik Melanom hücre hattında ise primer melanom hattından farklı olarak 26 adet mutasyon saptadık. Primer Melanom hücre hattı ile Metastatik Melanom hücre hattı arasında mutasyon artışının olması ve özellikle bu mutasyonların RET sinyal iletim yolağında MET geninde 7 adet, Notch sinyal iletim yolağında NOTCH1 geninde 4 adet RET sinyal iletim yolağında PIK3CA geninde 3 adet olmasının, Malign Melanom metastazında bunların etkin yolaklar olduğu ve bu mutasyonların özellikle ilgili yolaklardaki genlerde birikmesi nedeniyle metastazın gelişmesine katkı sağladığını düşündürmüştür. Bu bulgular göz önüne alındığında, ileri evre Metastatik Melanom tedavisinde bu yolakların seçilmesi hedefe yönelik tedavi açısından önemli bir tedavi alternatifi olabilir.

Özet (Çeviri)

Melanoma is a type of cancer that begins in the melanocytes, the pigment-producing cells of the skin, on the surface of the skin. The mechanisms leading to malignant transformation of melanocytes and melanocytic lesions are a complex interaction of environmental and genetic factors. Most of the changes that underlie the genetic basis of this disease occur as randomly acquired mutations in melanocytes, and the accumulation of genomic changes contributes to the development, progression and evolution of melanoma. In our study, hotspot mutations in WM115/Primary Melanoma and SK-MEL30/Metastatic Melanoma cell lines were examined using the Ion Ampliseq Cancer Hotspot DNA Panel v2 gene panel and we aimed to detect variations in 50 genes (ABL1, AKT1, ALK, APC, ATM, BRAF, CDH1, CDKN2A, CSF1R, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ERBB4, EZH2, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAS, GNAQ, HNF1A, HRAS, IDH1, JAK2, JAK3, IDH2, KDR, KIT, KRAS, MET, MLH1, MPL, NOTCH1, NPM1, HRAS , PDGFRA, PIK3CA, PTEN, PTPN11, RB1, RET, SMAD4, SMARCB1, SMO, SRC, STK11, TP53, VHL), most of which are associated with human cancer. We detected 9 mutations in the WM115/Primary Melanoma cell line and 26 mutations in the SK-MEL30/Metastatic Melanoma cell line, unlike the primary melanoma line. We also detected increase in the number of mutations in the Primary Melanoma cell line and the Metastatic Melanoma cell line including 7 in the RET signal transduction pathway, MET gene, 4 in the Notch Signal Transmission Pathway, NOTCH1 gene, and 3 in the RET Signal Transmission Pathway, PIK3CA gene. These results suggest that these pathways are crucial in malignant melanoma metastasis and the identified mutations contribute to the development of metastasis, especially because of the accumulation of genes in the relevant pathways. In conclusion, choosing these pathways in the treatment of advanced metastatic melanoma may be a novel treatment alternative in terms of targeted therapy.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    428496

    Malign melanomda hipoksik süreç ve ilişkili genlerin araştırılması

    Analysis of hypoxic process and related genes in malignant melanoma.

    MUSTAFA EMRE ERCİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Moleküler TıpKırıkkale Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖNDER BOZDOĞAN

  2. Tez No

    780557

    Melanom hücre hatlarında Lactarius deliciosus mantar ekstraktının CA-IX enzim aktivitesi üzerine etkisinin incelenmesi

    Investigation of the effect of Lactarius deliciosus mushroom extract on CA-IX enzyme activity in melanoma cell lines

    HACI AHMET KILIÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZEN ÖZENSOY GÜLER

  3. Tez No

    822058

    Meta-analysis of mutated genes in breast cancer-induced leptomeningeal carcinoma and the effects of increased CXCLl17 gene expression on A549 cell line

    Meme kanseri nedenli leptomeningeal karsinomada mutasyona uğramış genlerin meta-analizi ve artan CXCLl17 gen ifadesinin A549 hücre hattında etkileri

    EKİN KÖNİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Moleküler TıpAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Moleküler ve Translasyonel Biyotıp Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEYNEP TOKCAER KESKİN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR EMRE ONAT

  4. Tez No

    809469

    Malign melanom hastalarında tümör ile ilişkili antijenlerin belirlenmesi

    Determination of tumor associated antigens in patients with malignant melanoma

    MEHMET KARAÇAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Allerji ve İmmünolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALUK BARBAROS ORAL

  5. Tez No

    301702

    Two faces of ASC: Central innate immunity adaptor ASC turns into melanoma ally and novel mechanism demistifying dsRNA induced NLRP3 inflammasome activation through Bax/Bak mediated cell death

    ASC?ın iki yüzü: Doğal bağışıklık sistemi temel adaptörü ASC melanoma müttefikine dönüşüyor ve Bax/Bak temelli ölüm yolu üzerinden çalışan yeni bir mekanizma, çift sıralı RNA?nın NLRP3 inflamazomunu nasıl çalıştırdığını açıklıyor

    VAROL ULAŞ ÖZKUREDE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NESRİN ÖZÖREN

Geri Dön