Geri Dön

Non-albicans candida türlerinin moleküler tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi

Molecular typing of non-albicans candida species and determination of antifungal susceptibilities

PDF İndir

  1. Tez No: 737074
  2. Yazar: HULUSİ GÜVEN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ ORAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 107

Özet

Son yıllarda Candida türlerine bağlı enfeksiyonlarda çoklu ilaç direncinin ortaya çıkması, başarılı ve etkili tedavi seçeneklerini ortadan kaldırmıştır. Bu nedenle, Candida türlerinin doğru tanımlanması, yalnızca mevcut antifungallere duyarlılıktaki farklılık nedeniyle değil, aynı zamanda epidemiyolojik açıdan da önemlidir. Bu çalışmanın amacı, Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gelen ve klinik örneklerden izole edilen non-albicans Candida türlerinin DNA dizi analizi ile belirlenmesi, sonuçların BD Phoenix otomatik tanımlama sistemi ile karşılaştırılması ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesidir. Fenotipik olarak tanımlanmış toplam 82 örnek çalışmaya dahil edilmiştir. Çalışmada, mantar rDNA'sının 5.8S bölümünde ITS genini amplifiye etmek için ITS1 ve ITS4 primerleri kullanılmıştır. İzolatların amfoterisin B, flukonazol, itrakonazol ve vorikonazole duyarlılıkları mikrobroth dilüsyon metoduna göre araştırıldı. Örnek alınan hastaların demografik verileri incelendiğinde; yaş ortalaması 57,61±26,3 olarak belirlendi. Örneklerin 42 (%51,22)'si kadın hastalardan izole edilmiştir. Erkek hastaların yaş ortalaması 59,77±27,49 ve kadın hastaların yaş ortalaması 55,55±25,40 olarak hesaplandı. Örneklerin 62 (%75,61)'si yoğun bakım ünitelerinden, 5 (%6,10)'i Hematoloji ve Onkoloji Kliniği ve 15 (%18,29)'i diğer klinik bölümlerden gönderilmiştir. İzolatların 54 (%65,85)'ü kandan, 25 (%30,49)'i idrardan, 2 (%2,44)'si yaradan ve 1 (%1,22)'i ise kataterden izole edildi. BD Phoenix 100 otomatik tanımlama sistemi ile tanımlanan türler sıklık sırasına göre; 25 (%30,49)'i C. tropicalis, 25 (%30,49)'i C. parapsilosis kompleks, 17 (%20,73)'si C. glabrata kompleks, 4 (%4,88)'ü C. krusei, 4 (%4,88)'ü C. kefyr, 4 (%4,88)'ü C. firmetaria, 1 (%1,21)'i C. lambika ve 2 (%2,44)'si C. norvegensis idi. DNA dizi analizine göre tanımlanan türler ise; 30 (%36,38)'u C. tropicalis, 25 (%30,49)'i C. parapsilosis kompleks, 19 (%23,17)'u C. glabrata kompleks, 5 (%6,10)'i C. kefyr ve 3 (%3,66)'ü C. krusei idi. BD Phoenix sistemi moleküler yöntemle karşılaştırıldığında; 82 örnekten 62 (%75,60) tanesinin doğru tanımlandığı belirlendi. İki yöntem arasındaki kappa katsayısı 0,655 olarak hesaplandı ve sonuçlar uyumlu bulundu (p

Özet (Çeviri)

The emergence of multi-drug resistance in infections due to Candida species in recent years has eliminated successful and effective treatment options. Therefore, the correct identification of Candida species is important not only because of the difference in susceptibility to available antifungals, but also from an epidemiological point of view. The aim of this study is to determine the non-albicans Candida species isolated from clinical samples and sent to Kahramanmaras Sutcu Imam University Microbiology Laboratory by DNA sequence analysis, compare the results with the BD Phoenix automatic identification system and determine their antifungal susceptibility. A total of 82 phenotypically defined samples were included in the study. In the study, primers ITS1 and ITS4 were used to amplify the ITS gene in the 5.8S section of fungal rDNA. The susceptibility of the isolates to amphotericin B, fluconazole, itraconazole and voriconazole was investigated using the microbroth dilution method. When the demographic data of the sampled patients were examined; the mean age was determined as 57.61±26.3 years. Forty-two (51.22%) samples were isolated from female patients. The mean age of male patients was 59.77±27.49 and mean age of female patients was calculated as 55.55±25.40. Of the samples, 62 (75.61%) were sent from intensive care units, 5 (6.10%) from Hematology and Oncology Clinic and 15 (18.29%) from other clinical departments. Of the isolates 54 (65.85%) were isolated from blood, 25 (30.49%) from urine, 2 (2.44%) from wound and 1 (1.22%) from catheter. Species identified by the BD Phoenix 100 automatic identification system; 25 (30.49%) C. tropicalis, 25 (30.49%) C. parapsilosis complex, 17 (20.73%) C. glabrata complex, 4 (4.88%) C. krusei, 4 (4.88%) C. kefyr, 4 (4.88%) C. firmetaria, 1 (1.21%) C. lambika and 2 (2.44%) C. norvegensis. Species identified according to DNA sequence analysis were; 30 (36.38%) C. tropicalis, 25 (30.49%) C. parapsilosis complex, 19 (23.17%) C. glabrata complex, 5 (6. 10%) C. kefyr and 3 (3.66%) were C. krusei. When the BD Phoenix system is compared with the molecular method; It was determined that 62 (75.60%) of 82 samples were correctly identified. The kappa coefficient between the two methods was calculated as 0.655 and the results were found to be compatible (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    848097

    Mastitisli anadolu mandaları ve süt ineklerinden Candida türlerinin izolasyonu, moleküler tiplendirilmesi, virülens faktörleri ve antifungal dirençliliklerinin araştırılması

    Isolation, molecular typing, detection of virulence factors and antifungal resistance of Candida species from anatolian buffaloes and dairy cows with mastitis

    OĞUZ KAĞAN TÜREDİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Veteriner HekimliğiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESRA ŞEKER

  2. Tez No

    686690

    Kandidalarda SAP (1-10) genlerinin ve biyofilm oluşumunun saptanması: Sağlık bakımı ile ilişkili enfeksiyonlarda kandan ve diğer örneklerden izole edilenlerin karşılaştırılması

    Expression of SAP genes (1-10) and biofilm formation in candida spp: Comparison of health care associated infection isolates from bloodstream with isolates from other sources

    AHMED MOUSTAPHA NSANGOU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DUYGU FINDIK

  3. Tez No

    482956

    Mastitisli sığır sütlerinden izole edilen candıda türlerinin moleküler tanısı

    Molecular diagnosis of candida species which isolated from cattle mastitic milk

    PERİHAN CİLVEZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ

  4. Tez No

    390096

    Klinik örneklerden izole edilen Albicans dışı Candida türlerinin tanımlanmasında konvansiyonel yöntemler, MALDI-TOF-MS ve dizi analizi yöntemlerinin araştırılması

    The investigation of MALDI-TOF-MS, sequence analysis and conventional methods for the identification of non-Albicans candida species isolated from clinical samples

    AYŞE BARIŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURİ KİRAZ

  5. Tez No

    347837

    Candıda türlerinin tanımlanmasında 26S RDNA dizi analizi temel alınarak 'API ID 32C' ve 'maldı tof ms' yöntemlerinin duyarlılık ve maliyet etkinliklerinin araştırılması

    Evaluation of sensitivity and cost effectiveness of 'API id 32C' and 'maldi tof ms' methods on the basis of 26s rdna sequence analysis in identification of candida species

    EYLEM TURHAN ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU

Geri Dön