Geri Dön

Termofilik geobacillus üyelerinin hücresiz süpernatantlarının antimikrobiyal etkilerinin taranması ve potansiyel bakteriyosin benzeri bir termostabil peptidin kısmi karakterizasyonu

Screening of antimicrobial effects of cell-free supernatants of members of thermophilic geobacillus and partial characterization of a potential bacteriocine-like a thermostable peptide

PDF İndir

  1. Tez No: 744369
  2. Yazar: DENİZ ABACI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ARZU ÇÖLERİ CİHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 66

Özet

Bu çalışmada Geobacillus cinsine özgü türlerin (11 referans, 8 izolat) termostabil bakteriyosin üretim potansiyellerinin taranması amaçlanmıştır. Yapılan tarama sonucunda, Geobacillus sp. C304 izolatının gösterdiği antimikrobiyal etkinliğin kaynağının yeni bir bakteriyosin olarak tanımlanabilecek bir antimikrobiyal peptid olduğu, proteinaz K uygulaması ve kültür süpernatantının nötralizasyonu işlemleriyle dolaylı yollardan kanıtlanmıştır. Söz konusu izolatın ürettiği antimikrobiyal peptidin etkinliğini artırmak adına birtakım optimizasyon çalışmaları yapılmıştır. Bu bağlamda farklı inkübasyon sürelerinde (0., 4., 8., 12., 16., 20., 24., 30., 36., 48., 60., 72.) inkübasyon sıcaklıklarında (50°C, 55°C, 60°C, 65°C) ve farklı besiyeri pH değerlerinde (5.5, 6.0, 6.5, 7.0, 7.5, 8.0, 8.5, 9.0 ve 9.5) bakteriyosin üretim etkinlikleri test edilmiştir. 16 ila 20. saatlerde, 60 °C'de pH 7.5'ta tespit edilen optimum koşulların uygulanması sonrası elde edilen C304 süpernatantının; Staphyloccous aureus ATCC 25923, Enterococcus faecium 23, Enterococcus faecalis ATCC 25912, Bacillus subtilis DSM 1971, Listeria monocytogenes NCTC 5348, S. aureus MRSA ATCC 43300, Bacillus licheniformis DSM 13, Staphylococcus carnosus, Salmonella Enteritidis ATCC 13311, S. Typhimurium DMC4, Escherichia coli ATCC 35150, Salmonella Infantis DMC12, Klebsiella pneumoniae ATCC 7006003, E. coli ATCC 25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Shigella sp. ve Candida albicans patojen suşları üzerindeki antimikrobiyal etkinliği damlatma tekniği kullanılarak analiz edilmiştir. C304 süpernatantının inhibisyon etki gösterdiği suşlar için ayrıca MİK değerleri ve antibiyofilm etkinlik de belirlenmiştir. Ayrıca elde edilen antimikorobiyal içeriğin pH ve sıcaklık toleransları da değerlendirilmiştir. Son olarak C304 süpernatantının referans bir termofilik suş olan Geobacillus toebii DSM 14590 üzerinde sergilediği antimikrobiyal aktivite, Native-PAGE (N-PAGE) analizinde görülen belirgin şeffaf inhibisyon zonu ile teyit edilmiştir. Elde edilen bu sonuçlarla, Geobacillus sp. C304 izolatında tespit edilen bu termostabil bakteriyosinin endüstriyel süreçlerde kullanım potansiyelinin olabileceği gündeme gelmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, the potential of thermostable bacteriocin production by species of the genus Geobacillus (11 references, 8 isolates) was investigated. As a result of monitoring, Geobacillus sp., the source of antimicrobial activity of isolate C304 is an antimicrobial peptide that might be defined as a new bacteriocin, which was indirectly demonstrated by the application of proteinase K and neutralisation of the culture supernatant. A series of optimisation studies were carried out to increase the efficacy of the antimicrobial peptide produced by the isolate. In this context, bacteriocin production activities were tested at different incubation times (0., 4., 8., 12., 16., 20., 24., 30., 36., 48., 60., 72.), incubation temperatures (50 °C, 55 °C, 60 °C, 65 °C) and different pH values of the media (5.5, 6.0, 6.5, 7.0, 7.5, 8.0, 8.5, 9.0 and 9.5). C304 supernatant obtained after applying optimal conditions at pH 7.5 at 60 °C for 16 to 20 hours; Antimicrobial activity against Staphylococcus aureus ATCC 25923, Enterococcus faecium 23, Enterococcus faecalis ATCC 25912, Bacillus subtilis DSM 1971, Listeria monocytogenes NCTC 5348, MRSA ATCC 43300, Bacillus licheniformis DSM 13, Staphylococcus carnosus, Salmonella Enteritidis ATCC 13311, Salmonella Typhimurium DMC4, Escherichia coli ATCC 35150, Salmonella Infantis DMC12, Klebsiella pneumoniae ATCC 7006003, E. coli ATCC 25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Shigella sp. and Candida albicans pathogenic strains were analysed using the drop technique. The MIC values and antibiofilm activity were also determined for the strains where the supernatant of C304 had an inhibitory effect. In addition, the pH and temperature tolerances of the antimicrobial content obtained were also evaluated. Finally, the antimicrobial activity of the C304 supernatant on a thermophilic reference strain, Geobacillus toebii DSM 14590, was confirmed by the clear zone of inhibition in the Native- PAGE (N- PAGE) analysis. With these results, it became clear that this thermostable bacteriocin detected in isolate C304 has the potential to be used in industrial processes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    285396

    Termofilik Geobacillus sp. TF17 suşundan esteraz saflaştırılması ve karakterizasyonu

    Purification and characterization of esterase from a thermophilic bacterium, Geobacillus sp. TF17

    ÇİĞDEM AYNA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ÇOLAK

  2. Tez No

    380450

    Termofilik Geobacillus sp. TF14'ten endüstriyel öneme sahip α-amilazın saflaştırılması, immobilizasyonu ve karakterizasyonu

    Purification, immobilisation and characterization of indutrially important α-amylase from a thermophilic bacteria Geobacillus sp. TF14

    ŞABAN KESKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NAGİHAN SAĞLAM ERTUNGA

  3. Tez No

    389930

    Termofilik Geobacillus sp. TF16 suşundan fitaz enziminin saflaştırılması, karakterizasyonu ve doğal bir besin kaynağındaki fitatı parçalama etkinliğinin incelenmesi

    Purification and characterization of phytase from Geobacillus sp. TF16 and investigation hydrolysis of soymilk phytate

    EMRE DOKUZPARMAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NAGİHAN SAĞLAM ERTUNGA

  4. Tez No

    212027

    Termofilik Geobacillus caldoxylosilyticus TK4 suşundan DNA polimeraz I'in klonlanması ve karakterizasyonu

    Cloning and characterization of the dna polymerase I from thermophilic Geobacillus caldoxylosilyticus TK4

    CEMAL SANDALLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ

  5. Tez No

    294992

    Termofilik Geobacillus thermodenitrificans TH2 suşundan glukoz izomeraz enziminin saflaştırılması ve karakterizasyonu

    Purification and characterization of glucose isomerase from a thermophilic bacterium, Geobacillus thermodenitrificans TH2

    LEYLA KONAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyokimyaKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ÇOLAK

Geri Dön