Geri Dön

Cold tolerance related mi RNA expression patterns in cultivated and wild tomato genotypes

Bazı yabani ve kültür domates genotiplerinde soğuk toleransı ile ilgili miRNA ifade analizleri

  1. Tez No: 745531
  2. Yazar: HOUTAN VAFAEIFARD
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HÜLYA İLBİ, DOÇ. DR. AYLİN KABAŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Bitki Islahı Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 83

Özet

Kültür domatesi (Solanum lycopersicum L.), dünyada genetik ve moleküler ıslah çalışmalarında hedef bitki olarak kullanılan popüler sebzelerden biridir. Domates, tropik kökenli olduğu için soğuk stresine karşı hassastır. Soğuk stresi, bitkinin büyüme ve gelişmesine kolayca zarar verebilmektedir. Bu çalışmada, Solanum habrochaites (LA 1777) ve Solanum pimpinellifolium (LA 1579) yabani genotipleri ile Solanum lycopersicum cv. Anit F1 ve Solanum lycopersicum cv. Lice kültür çeşitlerinde, soğuk stresinin miRNA ifadeleri üzerine etkileri araştırılmıştır. Bu genotiplere ait genç bitkiler, 4°C'de 4, 6 ve 8 saat soğuk stresine maruz bırakıldıktan sonra miRNA 167, miRNA 169, miRNA 172, miRNA 393 ve miRNA 397'nin ekspresyon düzeyleri, Real-time PCR ile değerlendirilerek, bu miRNA'ların soğuk toleransı ile bağlantılı genlerin ekspresyonunu kontrol etmekten sorumlu olup olmadıkları araştırılmıştır. Ayrıca bu bitkilerde bazı morfo-fizyolojik özellikler de gözlenmiştir. S. habrochaites (LA 1777), S. pimpinellifolium (LA 1579) ve S. lycopersicum cv. Anit F1 genotiplerinde farklı soğuk stres seviyelerinde miRNA 167, 169 ve 172 ve 397'de önemli artış belirlenmiştir, Buna karşın, S. lycopersicum cv.Lice genotipinde bu miRNA'ların ifade düzeyinde artış belirlenmemiştir. Ayrıca bu çalışmada yaprak yaş ve kuru ağırlığı, kök yaş ve kuru ağırlığı, yaprak alan indeksi, klorofil içeriği ve çiçeklenme günündeki değişimler S. lycopersicum cv.Lice'de soğuk stresine bağlı olarak istatistiki önemde değişiklik göstermiştir. S. pimpinellifolium (LA 1579) genotipinde soğukla ilişkili miRNA ekspresyonu seviyeleri ve değerlendirilen morfo-fizyolojik parametrelerdeki önemli farklılıklar, bu genotipin soğuk stresine tolerant olabilceğini, buna karşın S. lycopersicum cv.Lice genotipinin soğuk stresine duyarlı olabileceğini göstermiştir.

Özet (Çeviri)

The cultivated tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the popular vegetables in the world that has been used as a target plant in genetic and molecular breeding studies. As this plant originated from the tropics, it is susceptible to chilling stress. Chilling stress can easily damage its growth and development. In the present study, The expression level of miRNA 167, miRNA 169, miRNA 172, miRNA 393, and miRNA 397 in wild genotypes of Solanum habrochaites (LA 1777) and Solanum pimpinellifolium (LA 1579) and cultivated genotypes of Solanum lycopersicum cv. Anit F1 and Solanum lycopersicum cv. Lice were assessed at 4, 6, and 8 hours after chilling treatment (4°C) via Real-time quantitative PCR to determine if these miRNAs are responsible for controlling the expression of the genes associated with chilling tolerance. Also, some morpho-physiological traits were observed in these plants. Significant upregulation of miRNA 167, 169 and 172, and 397 were observed at different levels of chilling stress in the tolerant genotypes of S. habrochaites (LA 1777) and S. lycopersicum cv. Anit F1. and also, in S. pimpinellifolium (LA 1579) while this level of up-regulation was not seen in S. lycopersicum cv. Lice. Also, the changes in the fresh and dry weight of leaf and root, specific leaf weight, leaf area index, the chlorophyll content, and flowering day measured in this study were significant in S. lycopersicum cv. Lice compared to the other genotypes. The observed levels of cold-related miRNA expression in S. pimpinellifolium (LA 1579) and significant differences in the evaluated morpho-physiological parameters indicated the tolerance of S. pimpinellifolium (LA 1579) and susceptibility of S. lycopersicum cv. Lice to chilling stress.

Benzer Tezler

  1. Identification of abiotic stress related mirnas in thellungiella halophila ecotypes

    Thellungiella halophila ekotiplerinde abiyotik stresle ilişkili mirna'ların belirlenmesi

    FERHUNDE AYSİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BotanikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN

  2. Diploid ve suni tetraploid adi otlak ayrığı (Agropyron cristatum (L.) Gaertn.)'da mitoz kromozomlarının yapısı ve mayoz bölünmenin tohum oluşumu ile ilgisi

    The Structure of mitotic chromosomes and seed setting which relates of meiotic division in diploid and artificial tetraploid crested wheatgrass (Agropyron Cristatum (L.) Gaertn.)

    AYŞE NİHAL GÖMÜRGEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1991

    BotanikGazi Üniversitesi

    PROF.DR. ŞAHABETTİN ELÇİ

  3. Klasik ve moleküler yöntemler kullanılarak bazı yaygın fiğ (Vicia sativa L.) hatlarının soğuğa tolerantlik performanslarının belirlenmesi

    Determination of cold tolerance performances of some common vetch (Vicia sativa L.) lines using classical and molecular methods

    DİLEK BORAZAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSKENDER TİRYAKİ

  4. Kışlık buğdayda soğuğa dayanıklılık ile ilgili qtl'lerin belirlenmesi

    Determination of qtl's related to winter tolerance in winter wheat

    PARISA BOLOURI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatAtatürk Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAMİL HALİLOĞLU

  5. Differential expression of cold resistant related genes in Populus nigra L. clones

    Populus nigra L. klonlarında soğuğa dirençli genlerin farklı ifadeleri

    EVRİM ZEYBEK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEKİ KAYA