Metabarkodlama ve biyoinformatik entegrasyon ile yüksek verimli böcek biyoizleme
High throughput insect biomonitoring with metabarcoding and bioinformatics
- Tez No: 749487
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMRE KESKİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 133
Özet
Belirli bir habitatta yaşayan canlı çeşitliliğini araştırmak ve o habitatın yapısını çözmek hep bir merak odağı olmuştur. Günümüzde dünya üzerinde birçok araştırmacı tarafından yürütülen çalışmalarda tanımlanan türler ve türler arası ilişkiler ortaya konmaktadır. Son yıllarda canlılarla yapılan çalışmalarda moleküler yöntemler kullanılmaktadır. Bu yöntemler sayesinde faunayı, taksonomi uzmanı olmaksızın mevcut yöntemlerden daha hassas ve daha hızlı bir şekilde listelemek mümkün olmaktadır. Bu çalışmalar içerisine böcek türlerinin tespitinde görece uzun süren arazi çalışmaları, tür teşhislerindeki zorluklara karşı yeni bir protokol geliştirilmesi ve mevcut DNA referans kütüphanelerinde kayıt altına alınması ulusal ve uluslararası düzeyde önem taşımaktadır. Bu noktadan hareketle bu çalışmada biyolojik çeşitlilik açısından önemli olan böcekler üzerinden yeni bir protokol oluşturulmuştur. Bu protokol ile çevre araştırmalarında hızlı bir şekilde sonuç alınabilecektir.
Özet (Çeviri)
Researching the diversity of species that living in a particular habitat and solving the structure of that habitat has always been a focus of interest. Today, the defined species and inter-species relations are revealed in studies carried out by many researchers around the world. In recent years, molecular methods have been used in research with species. Thanks to these methods, it is possible to list the fauna more precisely and faster than the existing methods without a taxonomy expert. Among these studies, relatively long field studies in the detection of insect species, developing a new protocol against the difficulties in species identification and recording it in existing DNA reference libraries are of national and international importance. From this point of view, in this study, a new protocol was created on insects, which are important in terms of biological diversity. With this protocol, it will be possible to get results quickly in environmental research and the results will be recorded.
Benzer Tezler
- Yüksek verimli dizileme teknolojilerinin biyo-izlemeye entegrasyonu, yerel veri tabanının oluşturulması ve çalışmaya özel unix tabanlı biyoinformatik iş akışının geliştirilmesi
Integration of high throughput sequencing technologies into bio-tracking, establishment of a local database and development of working-specific unix-based bioinformatic workflow
ESRA MİNE ÜNAL
Doktora
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMRE KESKİN
- Gemi balast suları ile taşınan yabancı türlerin eDNA metabarkodlama yöntemiyle tespiti ve risk analizleri: İzmit körfezi
Detection and risk analysis of non-indigenous species carried by ship's ballast water by eDNA metabarcoding method: Gulf of Izmit
YUSUF KORAY KÜÇÜK
- Termal kaynak mikrobiyomunun çevresel dna metabarkodlama ile belirlenmesi
Identification of thermal spring microbiota with environmental dna metabarcoding
IŞILAY ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRE KESKİN
- Uyuz Gölü'nde çevresel DNA ile biyoçeşitlilik tespiti: Göçmen kuşlar modeli
Biodiversity assessment in Uyuz Lake using environmental DNA: migratory birds model
AYŞEGÜL ER
- Detection of peach fruit mycobiome by using high-throughput sequencing
Şeftali meyve mikobiyomunun yüksek çıktılı dizileme kullanılarak belirlenmesi
SİBEL ÖNCEL
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
GenetikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HİLAL ÖZKILINÇ