Otomatize kültür sistemlerinde üreme sinyali alınan steril sıvı kültür şişelerinden maldı-tof MS ile hızlı bakteri tanımlanması
Rapid identification of bacteria with maldi-tof MS from sterile liquid culture bottles with reproductive signal in automatized culture systems
- Tez No: 751549
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜRŞİT HASBEK
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
MALDI-TOF MS (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi) ile birçok mikroorganizma konvansiyonel yöntemlere kıyasla çok daha kısa sürede tanımlanabilmektedir. Son yıllarda, pozitif kan kültürü şişelerinden MALDI-TOF MS ile doğrudan etken mikroorganizma tanımlanmasını amaçlayan çalışmalarda başarılı sonuçlar elde edilmektedir. Bununla birlikte, literatürde BOS, plevral sıvı ve eklem sıvısı gibi diğer steril vücut sıvısı örneklerine ait pozitif kültür şişelerinden doğrudan mikroorganizma tanımlanmasını hedefleyen kısıtlı sayıda çalışma bulunmaktadır. Bizim çalışmamızda, pozitif kültür şişesinden doğrudan mikroorganizma tanımlanması amacıyla kullanılacak bir hızlı tanımlama protokolünün geliştirilmesi ve bu protokolün steril vücut sıvısı kültürlerinde kullanılabilirliğinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya toplam 97 pozitif steril sıvı kültür şişesi dahil edilmiştir. Çalışmamızda kullanılan hızlı tanımlama protokolü ile tür düzeyinde %53.6 ve cins düzeyinde ise %81.4 başarı elde edilmiştir. Bu protokol gram pozitif ve gram negatif bakteriler için tür düzeyinde %44.6 ve %71.9; cins düzeyinde ise %80 ve %84.4 başarı sağlamıştır. Cins düzeyinde tanımlama başarısı her iki grup açısından birbirine yakın olmakla birlikte (p>0.05); çalışmamızda kullanılan hızlı tanımlama protokolü, özellikle gram negatif bakteriler için tür düzeyinde daha başarılı sonuçlar vermiştir (p
Özet (Çeviri)
With MALDI-TOF MS, many microorganisms can be identified in a much shorter time compared to conventional methods. In recent years, successful results have been obtained in studies aiming to directly identify the causative microorganism with MALDI-TOF MS from positive blood culture bottles. However, there are a limited number of studies in the literature targeting the direct identification of microorganisms from positive culture bottles of other sterile body fluid samples such as CSF, pleural fluid and joint fluid. In our study, it was aimed to develop a rapid identification protocol to be used to directly identify microorganisms from positive culture bottles and to evaluate the usability of this protocol in sterile body fluid cultures. A total of 97 positive sterile liquid culture bottles were included in the study. With the rapid identification protocol used in our study, 53.6% success was achieved at the species level and 81.4% at the genus level. This protocol was 44.6% and 71.9% at the species level for gram positive and gram negative bacteria; at the genus level, 80% and 84.4% success were achieved. Although the success of identification at the genus level was close to each other in terms of both groups (p>0.05); the rapid identification protocol used in our study gave more successful results at the species level, especially for gram negative bacteria (p
Benzer Tezler
- Negatif sinyal ve yalancı pozitif üreme sinyali veren otomatize kan kültür şişelerinde moleküler yöntemler ile bakteriyemi ve fungemi etkeni mikroorganizma varlığının araştırılması
Investigation of the presence of bacteremia and fungemia- related microorganisms with molecular methods in automated blood cultures with false positive and negative growth signals
MERVE ERTÜRK MELEZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ALTAY ATALAY
- BACTEC Plus Aerobic / F ve BACTEC Plus Anaerobic / F otomatize erişkin kan kültür şişelerindeki izolatların üremelerinin ve üreme zamanlarının karşılaştırılması
Comparison of the growth and growth durations of the isolates in the BACTEC Plus Aerobic / F and BACTEC Plus Anaerobic / F of the automated adult blood culture bottles
SUAT YILDIZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
MikrobiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜL DURMAZ
- Otomatik kan kültürü sistemlerinde negatif çıkan kan kültürlerinin inkübasyon süreleri uzatılarak hacek grubu bakterilerin araştırılması
Investigation of hacek group bacteria by increasing the incubation times of negative blood cultures in automatic blood culture systems
GÜLNİHAL ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN
- Yalancı pozitif üreme sinyali veren otomatize kan kültürü şişelerinde polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile bakteri ve mantar varlığının araştırılması
Evaluation of the presence of bacterial and fungal dna in subculture-negative automated blood culture bottles with positive signals
DERYA ÇÖLOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. Z. CEREN KARAHAN
- Steril vücut sıvılarından üretilen etkenlerin hızlı antibiyotik duyarlılık test sonuçlarının değerlendirilmesi
Evaluation of rapid antibiotic susceptibility test results of agents produced from sterile body fluids
HATİCE ŞEYMA BAYKUŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATİFET YASEMİN ÖZTOP