Geri Dön

Miyeloid malignitelerde, TET2 ve DNMT3A genleri ile hsa-miR-29 ifade düzeylerinin araştırılması

Investigation of TET2 and DNMT3a genes and hsa-miR-29 expression levels in myeloid malignancies

PDF İndir

  1. Tez No: 756095
  2. Yazar: BESİME DENİZ BABACAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÖZLEM İZCİ AY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Genler, Lösemi-miyeloid, Lösemi-miyeloid-akut, Mikro RNA, Miyelodisplastik sendromlar, Neoplazmlar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, RNA, Gene expression, Genes, Leukemia-myeloid, Leukemia-myeloid-acute, Micro RNA, Myelodysplastic syndromes, Neoplasms, Polymerase chain reaction, RNA
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Hematolojik maligniteler, kemik iliğinde bulunan miyeloid veya lenfoid hücrelerin kontrolsüz ve aşırı çoğalmasına bağlı olarak gelişen hastalıktır. Son on yılda yapılan çalışmalarla hematolojik malignitelerin patobiyolojisi daha iyi anlaşılmakla birlikte prognostik faktörleri de belirlenmeye başlanmıştır. Özellikle genlerdeki ekzon ve onları çevreleyen intron bölgelerinin taranması ile yapılan hedeflenmiş dizi analizlerinin geliştirilmesiyle hastalık hakkında daha fazla bilgi sahibi olmamız sağlanmıştır. Bu tez çalışmasında, Akut Miyeloid Lösemi (AML), Miyelodisplastik Sendrom (MDS), Kronik Miyeloid Lösemi (KML), Esansiyel Trombositoz (ET) ve Polisitemi Vera (PV) hastalarında, DNA metilasyonunda önemli rol oynayan TET2 ve DNMT3A genlerinin ve hematopoetik farklılaşmalarda etkin rol oynayan miR29'ların ekspresyon düzeyleri, hastalardan alınan kemik iliği örneklerinde real- time kantitatif PCR yöntemi ile araştırıldı. Çalışma grubumuza, Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi İç Hastalıkları Bölümü Hematoloji Bilim Dalı'na başvuran ve tanı alan, 28 AML, 34 MDS, 19 KML, 10 ET ve 11 PV olmak üzere toplam 102 hasta ve 13 kontrol grubu dâhil edildi. Hasta ve sağlıklı bireylerden alınan kemik iliği örneklerinden total RNA izolasyonu ve cDNA sentezi gerçekleştirildi. Saptanan ekspresyon düzeyleri; Toplam hasta (AML, MDS, KML, ET, PV)- kontrol, AML-kontrol, MDS-kontrol, KML-kontrol, ET-kontrol, PV-kontrol grupları arasında, SPSS-11.5 Windows veya Statistica 6.1 paket programlar kullanılarak istatistiksel olarak değerlendirildi. Araştırma sonuçlarına göre DNMT3A (p<0,001), TET2 (p<0,001), miR-29a (p<0,001), miR-29b (p<0,001) ve miR-29c'nin (p<0,001) ifade düzeylerindeki tüm gruplar kıyaslandığında istatistiksel olarak anlamlı bulundu. DNMT3A, TET2, miR-29a, miR-29b ve miR-29c'nin ifadelerinin korelasyonları incelendiğinde; DNMT3A sırasıyla miR-29a,b,c ve TET2 ile korele (r=0,278, p=0,003, r=-0,072, p=0,446, r=0,176, p=0,059, r=0,097, p=0,303) bulundu. TET2 sırasıyla miR-29a,b,c ile korele (r=0,378, p<0,001, r=-0,276, p=0,003, r=0,307, p=0,001) bulundu. miR-29a,b,c kendi aralarında korele (miR-29a,b (r=-0,346, p=0,000), miR-29a,c (r=0,274, p=0,003) ve miR-29b,c (r=-0,437, p=0,000) ) bulundu. Bunun sonucunda, elde ettiğimiz verilerin gelecekte bu alanda yapılacak çalışmalara ön veri sunabileceğini düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

Hematological malignancies are a disease that develops due to uncontrolled and excessive proliferation of myeloid and lymphoid cells in the bone marrow. Although the pathobiology of hematological malignancies has been better understood with the studies conducted in the last decade, prognostic factors have begun to be determined. With the development of targeted sequence analysis, especially by scanning the exons in the genes and the intron regions surrounding them, we have provided more information about the disease. In this thesis study, in patients with Acute Myeloid Leukemia (AML), Myelodysplastic Syndrome (MDS), Chronic Myeloid Leukemia (CML), Essential Thrombocytosis (ET) and Polycythemia Vera (PV) patients, the expression levels of TET2 and DNMT3A genes, which play an important role in DNA methylation, and miR29s, which play an active role in hematopoietic differentiation, were investigated by real-time quantitative PCR method in bone marrow samples taken from patients. To our working group, a total of 102 patients, 28 AML, 34 MDS, 19 CML, 10 ET and 11 PV, and 13 control groups, who applied and diagnosed to the Department of Hematology, Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, Research and Application Hospital, Mersin University. Total RNA isolation and cDNA synthesis were performed from bone marrow samples taken from patients and healthy individuals. Detected expression levels; Total patients (AML, MDS, KML, ET, PV) - control, AML-control, MDS-control, KML-control, ET-control, PV control groups, statistically using package programs such as SPSS-11.5 Windows or Statistica 6.1. was evaluated. According to the results of the study, when all groups in expression levels of DNMT3A (p<0.001 ), TET2 (p<0.001), miR-29a (p<0.001), miR-29b (p<0.001) and miR-29c (p<0.001) were compared was found to be statistically significant. When the correlations of the expressions of DNMT3A, TET2, miR- 29a, miR-29b and miR-29c were examined; DNMT3A was correlated with miR-29a,b,c and TET2, respectively (r=0.278, p=0.003, r=-0.072, p=0.446, r=0.176, p=0.059, r=0.097, p=0.303). TET2 was correlated with miR-29a,b,c, respectively (r=0.378, p<0.001, r=-0.276, p=0.003, r=0.307, p=0.001). miR-29a,b,c correlated among themselves (miR-29a,b (r=-0.346, p=0.000), miR-29a,c (r=0.274, p=0.003) and miR-29b,c (r= -0.437, p=0.000) ) were found. As a result, we think that the data we have obtained can provide preliminary data for future studies in this field.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    827820

    Hematolojik malignitelerin yeni nesil dizileme yöntemi kullanılarak genetik olarak değerlendirilmesi

    Genetic evaluation of hematological malignities using the new generation sequencing method

    SÜMEYYE ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikAtatürk Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MELİKE KARAMAN

    DOÇ. DR. ÇİĞDEM YÜCE KAHRAMAN

  2. Tez No

    847493

    Akut Lösemilerde prognostik önemi bilinen genlerdeki varyantların Yeni Nesil Dizileme (YND) yöntemi ile tespit edilmesi

    Detection of variance in genes known for prognostic significance in Acute Leukemias by the Next Generation of Sequencing (NGS) method

    KÜBRA YILDIZ KAYACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikKocaeli Üniversitesi

    Tıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDA EREN KESKİN

  3. Tez No

    341762

    Akut miyeloid lösemili hastalarda JAK2 V617F mutasyonu sıklığının araştırılması

    Analysis of JAK2 V617F mutation prevalance in patients with acute myeloid leukemia

    HALİME ÖZÇAM

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Hematolojiİstanbul Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİH AKTAN

  4. Tez No

    267616

    Hematolojik malignitelerde GADD45 epigenetik disregülasyonu

    Epigenetic dysregulation of GADD45 in hematologic malignancies

    ENİSE ÇAVUŞOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Tıbbi BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. CAN ERZİK

    PROF. DR. BEYAZIT ÇIRAKOĞLU

  5. Tez No

    314355

    Miyeloid ve lenfoid malign hastalıklarda lokal hematopoetik renin anjiyotensin sistem mRNA ekspresyon düzeyleri

    Mrna expression levels of local renin-angiotensin system in lymphoid and myeloid haematological malignancies

    BURAK UZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    HematolojiHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SALİH AKSU

Geri Dön