Türkiye'nin farklı illerinde izole edilen Vibrio anguillarum suşlarının PCR ve sekans analizi ile tanımlanması ve serotiplendirilmesi
Serotype and identification with sequence analysis and PCR of strains Vibrio anguillarum isolated in different provinces Turkey
- Tez No: 756911
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MİKAİL ÖZCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Su Ürünleri, Aquatic Products
- Anahtar Kelimeler: Fenotipik parametreler, Genotip, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Oncorhynchus mykiss, Vibrio anguillarum, Phenotypic parameters, Genotype, Reverse transcription polimerase chain reaction, Oncorhynchus mykiss, Vibrio anguillarum
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Türkiye'nin farklı bölgelerindeki Gökkuşağı Alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) kafes işletmelerinde Vibrio anguillarum suşlarının izole edilmesini, fenotipik ve genotipik özelliklerine göre tanımlanması ve serotiplendirilmesini amaçlanmaktadır. Bu amaçla 8 farklı alabalık işletmesinden Gökkuşağı alabalıklarından örnekler alınmıştır. Vibrio anguillarum izolasyonu için; Brain Heart (Infusion) Agar (BHIA), Triptik Soy Agar (TSA) Triptik Soy Broth (TSB), ve kanlı agar kullanılmıştır. Bu besiyerleri hazırlanırken % 1.5-3.5 tuz eklenmiştir. Gökkuşağı alabalıklarından karaciğer, dalak, böbrek ve bağırsaklardan elde edilen saf suşların fenotipik özelliklerinin incelenmesi için biyokimyasal tanımlama testleri ve Biolog Sistemi (The biolog GENIII micro plate) uygulanmıştır. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR)'nda Vibrio anguillarum suşuna ait spesifik primer kullanılmıştır. Bu primer yardımıyla 8 adet suşun tamamının moleküler olarak Vibrio anguillarum olduğu teyit edilmiştir. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile doğrulanan suşların sekans analizi yapılmış ve sekans analizi sonucunda Vibrio anguillarum olduğu tespit edilen suşların tümüne ATCC-43305 SEROTİP-O1 ve ATCC-43306 SEROTİP-O2 standart suşlar ile oluşturulan hyperimmune serumlara lam aglütünasyon testleri yapılmıştır. Bu testin sonucunda toplam 8 adet suştan 5 tanesi ATCC-43305 SEROTİP-O1, 2 tanesi ATCC-43306 SEROTİP-O2 ve bir tanesi serotip tanımsız çıkmıştır.
Özet (Çeviri)
This study aimed to serotype and identify according to their phenotypic and genotypic characteristics, isolation of Vibrio anguillarum strains in Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) cage farms in different regions of Turkey. For this purpose, rainbow trout samples were taken from 8 different trout farms. For Vibrio anguillarum isolation; Brain Heart (Infusion) Agar (BHIA), Tryptic Soy Agar (TSA) Tryptic Soy Broth (TSB) and blood agar were used. While preparing these media, 1.5-3.5% salt was added. For the investigation of phenotypic properties of pure strains obtained from liver, spleen, kidney and intestines of rainbow trout were applied Biolog System (The biolog GENIII micro plate) and biochemical identification tests. Polymerase Chain Reaction (PCR) was used in specific primer belonging to Vibrio anguillarum strain. With the help of this primer, all 8 strains were molecularly confirmed as Vibrio anguillarum. Sequence analysis of the strains confirmed by Polymerase Chain Reaction (PCR) was performed and the information obtained as a result of the analysis was interpreted. Sequence analysis of the strains confirmed by Polymerase Chain Reaction (PCR) was performed and as a result of sequence analysis were performed lam agglutination tests on hyperimmune sera created with ATCC-43305 SEROTIP-O1 and ATCC-43306 SEROTIP-O2 standard strains for all strains found to be Vibrio anguillarum. As a result of this test, 5 of 8 strains were found ATCC-43305 SEROTIP-O1, 2 of them ATCC-43306 SEROTIP-O2 and one of them serotype undefined.
Benzer Tezler
- Türkiye'nin Doğu Anadolu bölgesi hastaneleri ile Çukurova bölgesindeki hastanelerden izole edilen sağlık hizmeti ile ilişkili acinetobacter baumannii suşları arasındaki klonal ilişkilerin araştırılması
Investigation of clonal relationships between healthcare-associated acinetobacter baumannii strains isolated from Turkey's Eastern Anatolia region hospitals and Çukurova region
AYŞE KARACALI
Doktora
Türkçe
2021
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TOĞRUL NAĞIYEV
- Türkiye'nin İç Batı Anadolu Bölümü Buprestidae (İnsecta: Coleoptera) familyası üzerinde faunistik ve sistematik araştırmalar
Faunistic and systematic research on the family buprestidae (Insecta: Coleoptera) in Inner Western Anatolian Section of Turkey
ARİF DUYAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHMUT KABALAK
- Van, Bitlis, Muş ve Hakkari illerinde bulunan gökkuşağı alabalığı çiftliklerinden elde edilen Lactococcus garvieae izolatlarının fenotipik, serotipik ve genotipik farklılıklarının belirlenmesi
Determination of phenotypic, serotypic and genotypic differences between L. garvieae isolates obtained from rainbow trout farms in Van, Bitlis, Mus and Hakkari provinces
ŞÜKRÜ ÖNALAN
Doktora
Türkçe
2016
Su ÜrünleriYüzüncü Yıl ÜniversitesiSu Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMED ARABACI
- Investigation of transposition models, optimization of tilt angles, and solar radiation intensity for fixed and tracked south-facing solar photovoltaic surfaces in provinces of türkiye
Transpozisyon modellerinin incelenmesi, türkiye illerinde sabit ve güneş takipli güneye bakan fotovoltaik yüzeyler için eğim açılarının ve güneş radyasyon yoğunluğunun optimizasyonu
BATUR ALP AKGÜL
Doktora
İngilizce
2024
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiHasan Kalyoncu ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA SADETTİN ÖZYAZICI
- Elma çoklu sürgün fitoplazma hastalığı (Candidatus phytoplasma mali)'nın biyolojik mücadelesinde endofitik fungusların etkinliğinin araştırılması
Investigation on efficiency of endophytic fungi in biological control of apple proliferation (Candidatus phytoplasma mali) phytoplasma disease
ŞEFİKA YAVUZ
Doktora
Türkçe
2019
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MONA GAZEL