Geo veri tabanına kayıtlı mikrodizi verilerinin analizi için yeni bir bilgisayar programının tasarlanması
Designing of a new computer program for analysis of microarray data that deposited in geo database
- Tez No: 761234
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CAFER BUDAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Mikrobiyoloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dicle Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Gen ekspresyonunun mikrodizi tabanlı analizi, biyomedikal araştırmalar için oldukça önemli deney sistemleridir. Bununla beraber bu deneylerden elde edilen verilerin analizi uygun yazılım araçlarıyla desteklenmediği takdirde ya sonuç elde edilememekte ya da hatalı sonuçlar elde edilmektedir. Bu nedenle, bu verilerin analizini istenilen kalitede yapabilecek ve grafik sistemleri ile bunu görselleştirebilecek programlar bu alanda çalışan araştırmacılar açısından oldukça önemlidir. Güncel olarak kullanılmakta olan yazılımlar incelendiğinde açık kaynak kodlu olmayışları, gerekli raporların indirilmesine izin vermemeleri, yeterli grafik desteği olmayışları, işletim sistemi bağımsız çalışamamaları ya da güncel geliştirilen algoritma ve teknolojileri kullanmamaları gibi bir veya birden fazla eksiklik barındırdıkları görülmektedir. Bu tür eksiklikleri olmayan yeni bir yazılım geliştirilmesi mikrodizi tabanlı gen ekspresyon analizi yapan veya yapmayı planlayan temel bilim araştırmacıları ve klinik hekimler için önemli olacaktır. Bu tez çalışmasında GEO analizi için kullanımı kolay ve ücretsiz bir web aracı olan, GEOMT(GEO Microarray Tool) tasarlanmıştır. GEOMT, özellikle daha fazla programlama ve algoritma yeterliliği veya biyoinformatik bilgisi olmayan araştırmacılara için değerli bir araç olacaktır.
Özet (Çeviri)
Microarray-based analysis of gene expression is very important experimental systems for biomedical research. However, if the analysis of the data obtained from these experiments is not supported with appropriate software tools, either no results can be obtained or erroneous results are obtained. For this reason, programs that can analyze these data with the desired quality and visualize it with graphic systems are very important for researchers working in this field. When the software currently being used is examined, it is seen that they have one or more deficiencies such as not being open source, not allowing the download of required reports, not having sufficient graphic support, not working independently of the operating system, or not using up-to-date algorithms and technologies. The development of new software that does not have such shortcomings will be important for basic science researchers and clinicians who are doing or planning to perform microarray-based gene expression analysis. In this thesis, an easy-to-use and free web tool, GEOMT (GEO Microarray Tool), was designed for GEO analysis. GEOMT will be a valuable tool, especially for researchers without further programming and algorithm proficiency or bioinformatics knowledge.
Benzer Tezler
- Investigation of soil behavior of Ankara clay based on geotechnical field and laboratory experiments
Ankara kilinin zemin davranışlarının geoteknik arazi ve laboratuvar deneylerine bağlı olarak incelenmesi
GÖKHAN ŞAHİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
İnşaat MühendisliğiHacettepe Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA KEREM KOÇKAR
- Coğrafi bilgi sistemlerinde birlikte işlerlik
Interoperability between gis
FİLİZ KURTCEBE
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Jeodezi ve FotogrametriYıldız Teknik ÜniversitesiJeodezi ve Fotogrametri Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MEHMET SELÇUK
- 1/25000 ölçekli sayısal harita üretiminde kullanılan fotogrametrik vektör veriler için uygun veri tabanı tasarımı
A geodatabase design for 1/25000 scaled photogrammetric vector data
BİROL GÜNGÖR
Doktora
Türkçe
2009
Jeodezi ve Fotogrametriİstanbul Teknik ÜniversitesiJeodezi ve Fotogrametri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SITKI KÜLÜR
- Coğrafi bilgi sistemlerinde geovideo/audio kullanımı
Geovideo/audio use of geographic information systems
AHMET EMİN KARKINLI
Doktora
Türkçe
2017
Mühendislik BilimleriErciyes ÜniversitesiHarita Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERKAN BEŞDOK
- Nilüfer çayı ile sulanan alanların bazı önemli toprak özellikleri ve ağır metal içeriklerinin konumsal analizi ile güncel arazi kullanım türlerinin belirlenmesi
Spatial analysis of some important soil properties and heavy metal contents with determining of landuse types of the areas irrigated by the Nilufer stream
DUYGU ÖZSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatBursa Uludağ ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERTUĞRUL AKSOY